MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 5128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008271	TCA	2	6	404	409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026828
2	NC_008271	TGT	2	6	426	431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026828
3	NC_008271	CCG	2	6	485	490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026828
4	NC_008271	TCA	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026828
5	NC_008271	GCC	2	6	675	680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026829
6	NC_008271	CCG	2	6	704	709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026829
7	NC_008271	AGC	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026829
8	NC_008271	CGC	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026829
9	NC_008271	TCC	2	6	794	799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026829
10	NC_008271	GCC	2	6	928	933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026830
11	NC_008271	ATC	2	6	978	983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026830
12	NC_008271	GGC	2	6	996	1001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026830
13	NC_008271	TCG	3	9	1259	1267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026830
14	NC_008271	CAG	2	6	1331	1336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026831
15	NC_008271	CGT	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026831
16	NC_008271	TCG	3	9	1494	1502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026831
17	NC_008271	CAC	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026831
18	NC_008271	CGC	2	6	1571	1576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026831
19	NC_008271	CGG	2	6	1721	1726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026832
20	NC_008271	TCC	2	6	1781	1786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026832
21	NC_008271	CCT	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026832
22	NC_008271	GTG	2	6	1829	1834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026832
23	NC_008271	GCG	2	6	1872	1877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026832
24	NC_008271	CTC	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026832
25	NC_008271	GTT	2	6	1921	1926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026832
26	NC_008271	TCG	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026832
27	NC_008271	TGG	2	6	1940	1945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026832
28	NC_008271	ATC	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026832
29	NC_008271	ACC	3	9	2105	2113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026832
30	NC_008271	CGA	2	6	2283	2288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026832
31	NC_008271	CCG	2	6	2298	2303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026832
32	NC_008271	GGC	2	6	2323	2328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026832
33	NC_008271	GCA	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026833
34	NC_008271	GGC	2	6	2869	2874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026833
35	NC_008271	GCC	2	6	2890	2895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026833
36	NC_008271	TCC	2	6	2983	2988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026833
37	NC_008271	CGC	2	6	3067	3072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026833
38	NC_008271	CAA	3	9	3123	3131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026833
39	NC_008271	CAC	3	9	3142	3150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026833
40	NC_008271	CGC	2	6	3225	3230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026833
41	NC_008271	GAA	2	6	3238	3243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026833
42	NC_008271	ACC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026833
43	NC_008271	GAA	2	6	3339	3344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026833
44	NC_008271	AGC	2	6	3734	3739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026834
45	NC_008271	GCA	2	6	3771	3776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026834
46	NC_008271	CGA	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026834
47	NC_008271	AAC	2	6	3894	3899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026834
48	NC_008271	CGT	2	6	3916	3921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026834
49	NC_008271	AGC	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026834
50	NC_008271	GAA	2	6	4096	4101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026834
51	NC_008271	GTG	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026834
52	NC_008271	CGA	2	6	4383	4388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026834
53	NC_008271	ACA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026834
54	NC_008271	ATT	2	6	4420	4425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111026834
55	NC_008271	ACA	2	6	4472	4477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026834
56	NC_008271	CGC	3	9	4522	4530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026834
57	NC_008271	AAG	2	6	4590	4595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026835
58	NC_008271	CGG	2	6	4605	4610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026835
59	NC_008271	CGG	2	6	4625	4630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026835
60	NC_008271	CGC	2	6	4651	4656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026835
61	NC_008271	CCG	2	6	4713	4718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026835
62	NC_008271	CGG	2	6	4750	4755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026835
63	NC_008271	TTC	2	6	4809	4814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026835
64	NC_008271	AGC	2	6	4836	4841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026835
65	NC_008271	TCC	2	6	5037	5042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026835
66	NC_008271	CGC	2	6	5057	5062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026835
67	NC_008271	CCG	2	6	5073	5078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026835
68	NC_008271	GCG	2	6	5172	5177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026835
69	NC_008271	GCG	2	6	5350	5355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026836
70	NC_008271	GCG	2	6	5357	5362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026836
71	NC_008271	ACC	2	6	5381	5386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026836
72	NC_008271	TGG	2	6	5415	5420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026836
73	NC_008271	CGG	2	6	5490	5495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026836
74	NC_008271	CAC	2	6	5604	5609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026836
75	NC_008271	CGG	3	9	5613	5621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026836
76	NC_008271	GGT	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026836
77	NC_008271	GGT	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026836
78	NC_008271	CGT	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026836
79	NC_008271	GGC	2	6	5797	5802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026836
80	NC_008271	GCC	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026836
81	NC_008271	CGC	2	6	5901	5906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026836
82	NC_008271	GCA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026836
83	NC_008271	GCA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026836
84	NC_008271	GGT	2	6	6082	6087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026836
85	NC_008271	ACG	2	6	6161	6166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026836
86	NC_008271	GTC	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026837
87	NC_008271	GCA	2	6	6257	6262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026837
88	NC_008271	CGC	2	6	6299	6304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026837
89	NC_008271	TCG	2	6	6310	6315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026837
90	NC_008271	GGT	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026837
91	NC_008271	CCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026837
92	NC_008271	TGT	2	6	6377	6382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026837
93	NC_008271	GCA	2	6	6407	6412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026837
94	NC_008271	AGT	2	6	6422	6427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026837
95	NC_008271	GCA	2	6	6479	6484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026837
96	NC_008271	TCA	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026837
97	NC_008271	GTG	2	6	6622	6627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026837
98	NC_008271	GCT	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026837
99	NC_008271	GCG	2	6	6921	6926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026837
100	NC_008271	CTC	2	6	6964	6969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026837
101	NC_008271	CAC	2	6	7124	7129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026838
102	NC_008271	ACG	2	6	7138	7143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026838
103	NC_008271	GTC	2	6	7165	7170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026838
104	NC_008271	TCG	2	6	7187	7192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026838
105	NC_008271	GGC	2	6	7200	7205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026838
106	NC_008271	CGT	2	6	7296	7301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026838
107	NC_008271	TCC	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026838
108	NC_008271	CCG	2	6	7398	7403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026838
109	NC_008271	GTG	2	6	7418	7423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026838
110	NC_008271	CCG	2	6	7452	7457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026838
111	NC_008271	GGC	3	9	7545	7553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026838
112	NC_008271	CCG	2	6	7588	7593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026838
113	NC_008271	TCA	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026838
114	NC_008271	CGG	3	9	7698	7706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026838
115	NC_008271	CAC	2	6	7720	7725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026838
116	NC_008271	GGC	2	6	7735	7740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026838
117	NC_008271	CGC	2	6	7893	7898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026839
118	NC_008271	CGC	2	6	7960	7965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026839
119	NC_008271	GGT	2	6	7983	7988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026839
120	NC_008271	TTC	2	6	7990	7995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026839
121	NC_008271	CAC	2	6	8087	8092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026839
122	NC_008271	CTC	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026839
123	NC_008271	CGA	2	6	8238	8243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026839
124	NC_008271	CCG	2	6	8246	8251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026839
125	NC_008271	CCG	2	6	8253	8258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026839
126	NC_008271	GCC	2	6	8279	8284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026839
127	NC_008271	CAC	2	6	8313	8318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026839
128	NC_008271	CAT	2	6	8346	8351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026839
129	NC_008271	CAG	2	6	8434	8439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026839
130	NC_008271	CGC	2	6	8500	8505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026839
131	NC_008271	GGA	2	6	8631	8636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026840
132	NC_008271	CGT	3	9	8666	8674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026840
133	NC_008271	GCG	2	6	8740	8745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026840
134	NC_008271	GCC	2	6	8755	8760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026840
135	NC_008271	TTC	2	6	9133	9138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026840
136	NC_008271	GCG	2	6	9318	9323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026840
137	NC_008271	GGC	2	6	9332	9337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026840
138	NC_008271	CGC	2	6	9369	9374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026840
139	NC_008271	GTC	2	6	9495	9500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026840
140	NC_008271	TTC	2	6	9621	9626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026840
141	NC_008271	GCT	2	6	9635	9640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026840
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152	NC_008271	TGG	2	6	10365	10370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026841
153	NC_008271	TCG	2	6	10397	10402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026841
154	NC_008271	GCG	2	6	10441	10446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026841
155	NC_008271	TGG	2	6	10540	10545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026841
156	NC_008271	CCG	2	6	10555	10560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026841
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255	NC_008271	GGA	2	6	17232	17237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026849
256	NC_008271	GTC	2	6	17256	17261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026849
257	NC_008271	TCC	2	6	17376	17381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026849
258	NC_008271	CGA	2	6	17606	17611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026849
259	NC_008271	GGT	2	6	17712	17717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026849
260	NC_008271	AGC	2	6	17731	17736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026849
261	NC_008271	GGC	2	6	17794	17799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026849
262	NC_008271	CGA	2	6	17825	17830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026849
263	NC_008271	GAC	2	6	17874	17879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026849
264	NC_008271	CGC	2	6	17888	17893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026849
265	NC_008271	ACG	2	6	17944	17949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026849
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268	NC_008271	GTG	2	6	18106	18111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026849
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270	NC_008271	CGA	2	6	18191	18196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026849
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275	NC_008271	CGA	2	6	18463	18468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026850
276	NC_008271	GAC	2	6	18476	18481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026850
277	NC_008271	CGC	2	6	18554	18559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026850
278	NC_008271	GGA	2	6	18602	18607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026850
279	NC_008271	TGC	2	6	18619	18624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026850
280	NC_008271	GGC	2	6	18653	18658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026850
281	NC_008271	CGA	2	6	18748	18753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026850
282	NC_008271	ATC	2	6	18852	18857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026850
283	NC_008271	GTC	2	6	18923	18928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026850
284	NC_008271	CAG	2	6	18938	18943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026850
285	NC_008271	ATC	2	6	19058	19063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026851
286	NC_008271	TCG	2	6	19128	19133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026851
287	NC_008271	CGA	2	6	19248	19253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026851
288	NC_008271	CAC	3	9	19321	19329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026851
289	NC_008271	GCA	2	6	19419	19424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026851
290	NC_008271	CGG	2	6	19455	19460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026851
291	NC_008271	GAT	2	6	19462	19467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026851
292	NC_008271	CTT	2	6	19470	19475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026851
293	NC_008271	GTC	2	6	19541	19546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026851
294	NC_008271	ACG	2	6	19898	19903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026851
295	NC_008271	TTC	3	9	20102	20110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026851
296	NC_008271	CCG	2	6	20126	20131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026851
297	NC_008271	TCG	2	6	20150	20155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026851
298	NC_008271	CGT	2	6	20156	20161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026851
299	NC_008271	TCG	2	6	20171	20176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026851
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303	NC_008271	ACC	2	6	20390	20395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026851
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312	NC_008271	TGC	2	6	21156	21161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026852
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320	NC_008271	GCC	4	12	21569	21580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026853
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322	NC_008271	CCG	2	6	21754	21759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026853
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329	NC_008271	TCC	2	6	22216	22221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026854
330	NC_008271	CCG	2	6	22433	22438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026854
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370	NC_008271	GCA	2	6	25517	25522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026857
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