MICAS: Microsatellite Analysis Server

Di-nucleotide Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008271	GA	3	6	640	645	50 %	0 %	50 %	0 %	111026828
2	NC_008271	GC	3	6	1207	1212	0 %	0 %	50 %	50 %	111026830
3	NC_008271	GC	4	8	1437	1444	0 %	0 %	50 %	50 %	111026831
4	NC_008271	GT	3	6	3967	3972	0 %	50 %	50 %	0 %	111026834
5	NC_008271	AC	3	6	4430	4435	50 %	0 %	0 %	50 %	111026834
6	NC_008271	GC	3	6	6435	6440	0 %	0 %	50 %	50 %	111026837
7	NC_008271	GC	3	6	6877	6882	0 %	0 %	50 %	50 %	111026837
8	NC_008271	GC	4	8	7642	7649	0 %	0 %	50 %	50 %	111026838
9	NC_008271	CA	3	6	8363	8368	50 %	0 %	0 %	50 %	111026839
10	NC_008271	CT	3	6	8516	8521	0 %	50 %	0 %	50 %	111026839
11	NC_008271	GC	3	6	9009	9014	0 %	0 %	50 %	50 %	111026840
12	NC_008271	CG	3	6	9703	9708	0 %	0 %	50 %	50 %	111026840
13	NC_008271	CG	3	6	10445	10450	0 %	0 %	50 %	50 %	111026841
14	NC_008271	GC	3	6	11655	11660	0 %	0 %	50 %	50 %	111026841
15	NC_008271	CG	3	6	11996	12001	0 %	0 %	50 %	50 %	111026842
16	NC_008271	GC	4	8	12100	12107	0 %	0 %	50 %	50 %	111026842
17	NC_008271	CG	3	6	12841	12846	0 %	0 %	50 %	50 %	111026843
18	NC_008271	GC	3	6	12854	12859	0 %	0 %	50 %	50 %	111026843
19	NC_008271	AC	4	8	13241	13248	50 %	0 %	0 %	50 %	111026844
20	NC_008271	AC	3	6	13261	13266	50 %	0 %	0 %	50 %	111026844
21	NC_008271	CA	3	6	13318	13323	50 %	0 %	0 %	50 %	111026844
22	NC_008271	CG	3	6	13868	13873	0 %	0 %	50 %	50 %	111026844
23	NC_008271	GC	3	6	14139	14144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008271	AC	4	8	14181	14188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008271	CG	3	6	14594	14599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008271	GC	3	6	15020	15025	0 %	0 %	50 %	50 %	111026846
27	NC_008271	TC	3	6	15189	15194	0 %	50 %	0 %	50 %	111026846
28	NC_008271	CG	3	6	15848	15853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008271	GA	3	6	16856	16861	50 %	0 %	50 %	0 %	111026849
30	NC_008271	TG	3	6	17061	17066	0 %	50 %	50 %	0 %	111026849
31	NC_008271	CG	3	6	17223	17228	0 %	0 %	50 %	50 %	111026849
32	NC_008271	CG	3	6	18131	18136	0 %	0 %	50 %	50 %	111026849
33	NC_008271	GC	3	6	19158	19163	0 %	0 %	50 %	50 %	111026851
34	NC_008271	GA	3	6	19612	19617	50 %	0 %	50 %	0 %	111026851
35	NC_008271	AC	3	6	20517	20522	50 %	0 %	0 %	50 %	111026852
36	NC_008271	GC	3	6	23072	23077	0 %	0 %	50 %	50 %	111026855
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40	NC_008271	GC	3	6	25748	25753	0 %	0 %	50 %	50 %	111026857
41	NC_008271	GC	4	8	26022	26029	0 %	0 %	50 %	50 %	111026858
42	NC_008271	GC	3	6	26167	26172	0 %	0 %	50 %	50 %	111026858
43	NC_008271	TC	3	6	26540	26545	0 %	50 %	0 %	50 %	111026858
44	NC_008271	GC	3	6	27268	27273	0 %	0 %	50 %	50 %	111026859
45	NC_008271	CA	3	6	27691	27696	50 %	0 %	0 %	50 %	111026859
46	NC_008271	AC	3	6	27797	27802	50 %	0 %	0 %	50 %	111026859
47	NC_008271	TC	3	6	28312	28317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008271	TC	4	8	28399	28406	0 %	50 %	0 %	50 %	111026860
49	NC_008271	CG	3	6	28468	28473	0 %	0 %	50 %	50 %	111026860
50	NC_008271	CT	3	6	29172	29177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008271	GC	3	6	30034	30039	0 %	0 %	50 %	50 %	111026861
52	NC_008271	TC	3	6	30134	30139	0 %	50 %	0 %	50 %	111026861
53	NC_008271	GC	3	6	30529	30534	0 %	0 %	50 %	50 %	111026861
54	NC_008271	CG	3	6	30856	30861	0 %	0 %	50 %	50 %	111026861
55	NC_008271	GC	4	8	31539	31546	0 %	0 %	50 %	50 %	111026862
56	NC_008271	GC	3	6	31836	31841	0 %	0 %	50 %	50 %	111026862
57	NC_008271	CG	4	8	33119	33126	0 %	0 %	50 %	50 %	111026863
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59	NC_008271	CA	3	6	34346	34351	50 %	0 %	0 %	50 %	111026865
60	NC_008271	CA	3	6	35244	35249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008271	GC	3	6	35363	35368	0 %	0 %	50 %	50 %	111026867
62	NC_008271	GT	3	6	35920	35925	0 %	50 %	50 %	0 %	111026868
63	NC_008271	GT	3	6	35936	35941	0 %	50 %	50 %	0 %	111026868
64	NC_008271	CG	3	6	36629	36634	0 %	0 %	50 %	50 %	111026868
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69	NC_008271	CA	3	6	41464	41469	50 %	0 %	0 %	50 %	111026873
70	NC_008271	CG	3	6	41497	41502	0 %	0 %	50 %	50 %	111026873
71	NC_008271	TC	3	6	42188	42193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008271	GA	3	6	42453	42458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008271	TG	4	8	42541	42548	0 %	50 %	50 %	0 %	111026874
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91	NC_008271	CG	3	6	53112	53117	0 %	0 %	50 %	50 %	111026884
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98	NC_008271	AG	3	6	56634	56639	50 %	0 %	50 %	0 %	111026885
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111	NC_008271	GC	3	6	66518	66523	0 %	0 %	50 %	50 %	111026896
112	NC_008271	AG	3	6	66880	66885	50 %	0 %	50 %	0 %	111026896
113	NC_008271	GA	3	6	66967	66972	50 %	0 %	50 %	0 %	111026896
114	NC_008271	GA	3	6	67371	67376	50 %	0 %	50 %	0 %	111026896
115	NC_008271	CG	4	8	68175	68182	0 %	0 %	50 %	50 %	111026898
116	NC_008271	GA	3	6	68311	68316	50 %	0 %	50 %	0 %	111026898
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121	NC_008271	CG	3	6	69919	69924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008271	CG	3	6	70398	70403	0 %	0 %	50 %	50 %	111026901
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125	NC_008271	GC	3	6	73718	73723	0 %	0 %	50 %	50 %	111026903
126	NC_008271	CG	3	6	74150	74155	0 %	0 %	50 %	50 %	111026903
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