MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008271	GC	3	6	14139	14144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008271	AC	4	8	14181	14188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008271	CG	3	6	14594	14599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008271	CG	3	6	15848	15853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008271	TC	3	6	28312	28317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008271	CT	3	6	29172	29177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008271	CA	3	6	35244	35249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008271	TC	3	6	42188	42193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008271	GA	3	6	42453	42458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008271	GA	3	6	49584	49589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008271	GC	3	6	50307	50312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008271	GC	3	6	57279	57284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008271	CG	3	6	68938	68943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008271	CG	3	6	69919	69924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008271	AG	3	6	80873	80878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008271	TC	3	6	81659	81664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008271	GC	3	6	83510	83515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008271	GA	3	6	83581	83586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008271	GT	3	6	83608	83613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008271	CA	3	6	85395	85400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008271	CA	3	6	85485	85490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008271	TC	3	6	86109	86114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008271	GC	3	6	86192	86197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008271	CG	3	6	86238	86243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008271	CG	3	6	86630	86635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008271	GC	3	6	88193	88198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008271	CG	3	6	89685	89690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008271	CA	3	6	90041	90046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008271	CG	3	6	90714	90719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008271	AC	3	6	90993	90998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008271	CG	3	6	93559	93564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008271	CA	3	6	93709	93714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008271	GA	3	6	93741	93746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008271	CG	4	8	99885	99892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008271	GC	3	6	100495	100500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008271	AC	3	6	104304	104309	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008271	CG	3	6	112582	112587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008271	GC	3	6	119443	119448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008271	GC	3	6	119503	119508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008271	GC	3	6	121192	121197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008271	GC	3	6	122575	122580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008271	TC	4	8	123694	123701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008271	CA	3	6	139430	139435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008271	CA	3	6	139933	139938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008271	CG	3	6	140772	140777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008271	AC	3	6	144366	144371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008271	GT	3	6	153614	153619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008271	GC	3	6	153800	153805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008271	TC	3	6	157062	157067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008271	TC	3	6	164377	164382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008271	CG	3	6	164390	164395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008271	CT	3	6	168623	168628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008271	CA	4	8	170409	170416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008271	GA	3	6	172566	172571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008271	TG	3	6	172637	172642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008271	GC	3	6	172762	172767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008271	GT	3	6	179318	179323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008271	CG	3	6	179416	179421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008271	CG	3	6	191087	191092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008271	CG	3	6	192010	192015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008271	CG	3	6	192087	192092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008271	GC	3	6	192120	192125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008271	TG	3	6	192146	192151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008271	CG	3	6	197129	197134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008271	AC	3	6	202296	202301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008271	CG	3	6	210628	210633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008271	GA	4	8	210731	210738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008271	TA	3	6	220337	220342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008271	GC	3	6	220832	220837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008271	GC	3	6	229442	229447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008271	AC	4	8	230080	230087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008271	GC	3	6	230145	230150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008271	GC	3	6	233014	233019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008271	TG	3	6	233412	233417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008271	CG	3	6	236826	236831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008271	CA	3	6	243046	243051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008271	CA	3	6	243530	243535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008271	GC	3	6	246594	246599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008271	GC	3	6	246655	246660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008271	AC	3	6	250805	250810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008271	CA	3	6	251623	251628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008271	GA	3	6	251650	251655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008271	GC	3	6	256737	256742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008271	CA	3	6	257909	257914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008271	TG	3	6	259548	259553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008271	GT	3	6	262591	262596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008271	GC	3	6	262747	262752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008271	TC	3	6	265330	265335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008271	GC	3	6	288190	288195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008271	TC	3	6	293018	293023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008271	CA	3	6	297231	297236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008271	GC	3	6	299825	299830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008271	CG	3	6	302975	302980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008271	CG	3	6	303197	303202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008271	TG	3	6	311358	311363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008271	AC	3	6	311494	311499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008271	AC	3	6	316791	316796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008271	AT	3	6	318659	318664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008271	AT	3	6	319072	319077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008271	CG	3	6	321059	321064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008271	GT	3	6	330136	330141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008271	GC	3	6	331879	331884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008271	GT	3	6	331974	331979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008271	GT	3	6	332063	332068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.