MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008271	G	7	7	20543	20549	0 %	0 %	100 %	0 %	111026852
2	NC_008271	C	6	6	21201	21206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_008271	G	6	6	22516	22521	0 %	0 %	100 %	0 %	111026855
4	NC_008271	G	6	6	24575	24580	0 %	0 %	100 %	0 %	111026856
5	NC_008271	C	6	6	31621	31626	0 %	0 %	0 %	100 %	111026862
6	NC_008271	C	6	6	41673	41678	0 %	0 %	0 %	100 %	111026873
7	NC_008271	C	6	6	42610	42615	0 %	0 %	0 %	100 %	111026874
8	NC_008271	G	6	6	43622	43627	0 %	0 %	100 %	0 %	111026875
9	NC_008271	G	6	6	43891	43896	0 %	0 %	100 %	0 %	111026875
10	NC_008271	C	6	6	49479	49484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_008271	C	6	6	50289	50294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_008271	C	7	7	52377	52383	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_008271	C	6	6	53032	53037	0 %	0 %	0 %	100 %	111026884
14	NC_008271	G	6	6	53302	53307	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008271	C	6	6	60440	60445	0 %	0 %	0 %	100 %	111026889
16	NC_008271	G	6	6	76871	76876	0 %	0 %	100 %	0 %	111026906
17	NC_008271	C	6	6	87614	87619	0 %	0 %	0 %	100 %	111026918
18	NC_008271	C	6	6	90183	90188	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_008271	C	6	6	90665	90670	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_008271	C	7	7	90689	90695	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_008271	C	6	6	91010	91015	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_008271	G	6	6	92639	92644	0 %	0 %	100 %	0 %	111026922
23	NC_008271	C	6	6	93429	93434	0 %	0 %	0 %	100 %	111026922
24	NC_008271	C	6	6	95506	95511	0 %	0 %	0 %	100 %	111026925
25	NC_008271	G	6	6	96207	96212	0 %	0 %	100 %	0 %	111026925
26	NC_008271	G	6	6	98434	98439	0 %	0 %	100 %	0 %	111026927
27	NC_008271	C	6	6	100363	100368	0 %	0 %	0 %	100 %	111026928
28	NC_008271	G	6	6	101704	101709	0 %	0 %	100 %	0 %	111026929
29	NC_008271	C	6	6	102433	102438	0 %	0 %	0 %	100 %	111026929
30	NC_008271	C	6	6	102479	102484	0 %	0 %	0 %	100 %	111026929
31	NC_008271	C	6	6	103878	103883	0 %	0 %	0 %	100 %	111026931
32	NC_008271	A	7	7	104072	104078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008271	G	6	6	104863	104868	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008271	G	7	7	110279	110285	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008271	C	6	6	110887	110892	0 %	0 %	0 %	100 %	111026941
36	NC_008271	G	6	6	112309	112314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008271	G	6	6	119804	119809	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008271	A	6	6	121022	121027	100 %	0 %	0 %	0 %	111026951
39	NC_008271	C	6	6	121150	121155	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_008271	G	6	6	129570	129575	0 %	0 %	100 %	0 %	111026962
41	NC_008271	C	6	6	130744	130749	0 %	0 %	0 %	100 %	111026963
42	NC_008271	G	6	6	131819	131824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008271	C	6	6	143233	143238	0 %	0 %	0 %	100 %	111026976
44	NC_008271	C	6	6	154436	154441	0 %	0 %	0 %	100 %	111026986
45	NC_008271	G	6	6	160502	160507	0 %	0 %	100 %	0 %	111026992
46	NC_008271	G	6	6	166761	166766	0 %	0 %	100 %	0 %	111026996
47	NC_008271	G	6	6	175870	175875	0 %	0 %	100 %	0 %	111027003
48	NC_008271	C	6	6	177270	177275	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_008271	C	6	6	181116	181121	0 %	0 %	0 %	100 %	111027006
50	NC_008271	C	6	6	181650	181655	0 %	0 %	0 %	100 %	111027006
51	NC_008271	C	6	6	184372	184377	0 %	0 %	0 %	100 %	111027009
52	NC_008271	C	6	6	185218	185223	0 %	0 %	0 %	100 %	111027010
53	NC_008271	G	6	6	188792	188797	0 %	0 %	100 %	0 %	111027014
54	NC_008271	G	6	6	191316	191321	0 %	0 %	100 %	0 %	111027016
55	NC_008271	A	6	6	195705	195710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008271	G	6	6	202119	202124	0 %	0 %	100 %	0 %	111027028
57	NC_008271	C	6	6	203646	203651	0 %	0 %	0 %	100 %	111027031
58	NC_008271	C	6	6	209541	209546	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_008271	C	6	6	213011	213016	0 %	0 %	0 %	100 %	111027040
60	NC_008271	G	6	6	221133	221138	0 %	0 %	100 %	0 %	111027051
61	NC_008271	C	6	6	230228	230233	0 %	0 %	0 %	100 %	111027060
62	NC_008271	C	7	7	234161	234167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_008271	C	6	6	236386	236391	0 %	0 %	0 %	100 %	111027065
64	NC_008271	C	6	6	238373	238378	0 %	0 %	0 %	100 %	111027069
65	NC_008271	C	6	6	241970	241975	0 %	0 %	0 %	100 %	111027074
66	NC_008271	C	6	6	248237	248242	0 %	0 %	0 %	100 %	111027082
67	NC_008271	C	6	6	256658	256663	0 %	0 %	0 %	100 %	111027090
68	NC_008271	T	6	6	261033	261038	0 %	100 %	0 %	0 %	111027094
69	NC_008271	C	6	6	281004	281009	0 %	0 %	0 %	100 %	111027113
70	NC_008271	C	6	6	282427	282432	0 %	0 %	0 %	100 %	111027114
71	NC_008271	G	6	6	284682	284687	0 %	0 %	100 %	0 %	111027115
72	NC_008271	C	7	7	288394	288400	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_008271	G	7	7	288411	288417	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008271	C	6	6	292067	292072	0 %	0 %	0 %	100 %	111027121
75	NC_008271	C	7	7	295005	295011	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_008271	G	6	6	305593	305598	0 %	0 %	100 %	0 %	111027134
77	NC_008271	G	6	6	307314	307319	0 %	0 %	100 %	0 %	111027137
78	NC_008271	T	6	6	307798	307803	0 %	100 %	0 %	0 %	111027137
79	NC_008271	C	6	6	328193	328198	0 %	0 %	0 %	100 %	111027158
80	NC_008271	G	6	6	331849	331854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008271	T	6	6	332054	332059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.