MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 1011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008270	CTCG	2	8	762	769	0 %	25 %	25 %	50 %	111026069
2	NC_008270	CGAC	2	8	1599	1606	25 %	0 %	25 %	50 %	111026070
3	NC_008270	TGCT	2	8	1922	1929	0 %	50 %	25 %	25 %	111026070
4	NC_008270	GCAA	2	8	2276	2283	50 %	0 %	25 %	25 %	111026071
5	NC_008270	CGGC	2	8	2583	2590	0 %	0 %	50 %	50 %	111026072
6	NC_008270	CCCG	2	8	2741	2748	0 %	0 %	25 %	75 %	111026072
7	NC_008270	GTCC	2	8	3068	3075	0 %	25 %	25 %	50 %	111026073
8	NC_008270	CCCA	2	8	3080	3087	25 %	0 %	0 %	75 %	111026073
9	NC_008270	ACGA	2	8	3122	3129	50 %	0 %	25 %	25 %	111026073
10	NC_008270	TTGC	2	8	3196	3203	0 %	50 %	25 %	25 %	111026073
11	NC_008270	CTCC	2	8	3229	3236	0 %	25 %	0 %	75 %	111026073
12	NC_008270	CGGC	2	8	3693	3700	0 %	0 %	50 %	50 %	111026073
13	NC_008270	CGAA	2	8	3866	3873	50 %	0 %	25 %	25 %	111026073
14	NC_008270	TCGT	2	8	3903	3910	0 %	50 %	25 %	25 %	111026073
15	NC_008270	GCCG	2	8	4602	4609	0 %	0 %	50 %	50 %	111026074
16	NC_008270	AGCA	2	8	5024	5031	50 %	0 %	25 %	25 %	111026075
17	NC_008270	CCCA	2	8	5556	5563	25 %	0 %	0 %	75 %	111026076
18	NC_008270	CTTG	2	8	5763	5770	0 %	50 %	25 %	25 %	111026076
19	NC_008270	GCCA	2	8	5897	5904	25 %	0 %	25 %	50 %	111026076
20	NC_008270	CCGT	2	8	6741	6748	0 %	25 %	25 %	50 %	111026077
21	NC_008270	GGGT	2	8	6812	6819	0 %	25 %	75 %	0 %	111026077
22	NC_008270	GTCA	2	8	7056	7063	25 %	25 %	25 %	25 %	111026077
23	NC_008270	CTGC	2	8	8322	8329	0 %	25 %	25 %	50 %	111026077
24	NC_008270	CGAT	2	8	8437	8444	25 %	25 %	25 %	25 %	111026077
25	NC_008270	CACC	2	8	8615	8622	25 %	0 %	0 %	75 %	111026077
26	NC_008270	GCCC	2	8	8889	8896	0 %	0 %	25 %	75 %	111026077
27	NC_008270	CGCT	2	8	8950	8957	0 %	25 %	25 %	50 %	111026077
28	NC_008270	GCGA	2	8	9261	9268	25 %	0 %	50 %	25 %	111026077
29	NC_008270	AGGC	2	8	9860	9867	25 %	0 %	50 %	25 %	111026077
30	NC_008270	TCAG	2	8	10483	10490	25 %	25 %	25 %	25 %	111026077
31	NC_008270	TGCT	2	8	10614	10621	0 %	50 %	25 %	25 %	111026077
32	NC_008270	TACG	2	8	11181	11188	25 %	25 %	25 %	25 %	111026077
33	NC_008270	CGGG	2	8	11251	11258	0 %	0 %	75 %	25 %	111026077
34	NC_008270	GGTG	2	8	12976	12983	0 %	25 %	75 %	0 %	111026080
35	NC_008270	GGTT	2	8	13000	13007	0 %	50 %	50 %	0 %	111026080
36	NC_008270	TGGG	2	8	13175	13182	0 %	25 %	75 %	0 %	111026080
37	NC_008270	CATG	2	8	14240	14247	25 %	25 %	25 %	25 %	111026081
38	NC_008270	GCCT	2	8	15578	15585	0 %	25 %	25 %	50 %	111026082
39	NC_008270	CTGT	2	8	15751	15758	0 %	50 %	25 %	25 %	111026082
40	NC_008270	ATGA	2	8	16086	16093	50 %	25 %	25 %	0 %	111026083
41	NC_008270	GGCG	2	8	17296	17303	0 %	0 %	75 %	25 %	111026085
42	NC_008270	TGAG	2	8	17448	17455	25 %	25 %	50 %	0 %	111026085
43	NC_008270	GCCA	2	8	18047	18054	25 %	0 %	25 %	50 %	111026086
44	NC_008270	TGGT	2	8	19099	19106	0 %	50 %	50 %	0 %	111026087
45	NC_008270	ATGA	2	8	19180	19187	50 %	25 %	25 %	0 %	111026087
46	NC_008270	ATCC	2	8	20375	20382	25 %	25 %	0 %	50 %	111026087
47	NC_008270	CCCG	2	8	20457	20464	0 %	0 %	25 %	75 %	111026087
48	NC_008270	GAGG	2	8	20973	20980	25 %	0 %	75 %	0 %	111026087
49	NC_008270	GGGT	2	8	21236	21243	0 %	25 %	75 %	0 %	111026088
50	NC_008270	GTTC	2	8	21644	21651	0 %	50 %	25 %	25 %	111026089
51	NC_008270	CGTG	2	8	21862	21869	0 %	25 %	50 %	25 %	111026089
52	NC_008270	CTTC	2	8	21931	21938	0 %	50 %	0 %	50 %	111026089
53	NC_008270	GGTG	2	8	22173	22180	0 %	25 %	75 %	0 %	111026089
54	NC_008270	GTGG	2	8	22182	22189	0 %	25 %	75 %	0 %	111026089
55	NC_008270	TCGA	2	8	23420	23427	25 %	25 %	25 %	25 %	111026091
56	NC_008270	TCAT	2	8	23986	23993	25 %	50 %	0 %	25 %	111026091
57	NC_008270	GCCG	2	8	24760	24767	0 %	0 %	50 %	50 %	111026093
58	NC_008270	GCCG	2	8	24813	24820	0 %	0 %	50 %	50 %	111026093
59	NC_008270	CCCA	2	8	25045	25052	25 %	0 %	0 %	75 %	111026093
60	NC_008270	GCCG	2	8	25057	25064	0 %	0 %	50 %	50 %	111026093
61	NC_008270	GCGA	2	8	26042	26049	25 %	0 %	50 %	25 %	111026094
62	NC_008270	CGCC	2	8	26966	26973	0 %	0 %	25 %	75 %	111026094
63	NC_008270	GTCG	2	8	27549	27556	0 %	25 %	50 %	25 %	111026094
64	NC_008270	GCTG	2	8	27810	27817	0 %	25 %	50 %	25 %	111026095
65	NC_008270	CGGC	2	8	27870	27877	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
66	NC_008270	CCAA	2	8	28507	28514	50 %	0 %	0 %	50 %	111026095
67	NC_008270	GCCG	2	8	28856	28863	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
68	NC_008270	ACCG	2	8	29203	29210	25 %	0 %	25 %	50 %	111026095
69	NC_008270	AGCG	2	8	29445	29452	25 %	0 %	50 %	25 %	111026095
70	NC_008270	CGGT	2	8	29511	29518	0 %	25 %	50 %	25 %	111026095
71	NC_008270	CCAG	2	8	29780	29787	25 %	0 %	25 %	50 %	111026095
72	NC_008270	GAGG	2	8	30190	30197	25 %	0 %	75 %	0 %	111026096
73	NC_008270	GCCG	2	8	31524	31531	0 %	0 %	50 %	50 %	111026096
74	NC_008270	CGGT	2	8	33079	33086	0 %	25 %	50 %	25 %	111026097
75	NC_008270	CGCC	2	8	33437	33444	0 %	0 %	25 %	75 %	111026097
76	NC_008270	CCAT	2	8	35302	35309	25 %	25 %	0 %	50 %	111026097
77	NC_008270	GCCT	2	8	35935	35942	0 %	25 %	25 %	50 %	111026098
78	NC_008270	TCCT	2	8	36336	36343	0 %	50 %	0 %	50 %	111026098
79	NC_008270	CCAC	2	8	37255	37262	25 %	0 %	0 %	75 %	111026099
80	NC_008270	CGAC	2	8	37567	37574	25 %	0 %	25 %	50 %	111026099
81	NC_008270	CGGC	2	8	37599	37606	0 %	0 %	50 %	50 %	111026099
82	NC_008270	CGGG	2	8	37741	37748	0 %	0 %	75 %	25 %	111026099
83	NC_008270	CGGT	2	8	37809	37816	0 %	25 %	50 %	25 %	111026099
84	NC_008270	CCAG	2	8	37972	37979	25 %	0 %	25 %	50 %	111026099
85	NC_008270	CGGA	2	8	38003	38010	25 %	0 %	50 %	25 %	111026099
86	NC_008270	TCGA	2	8	39704	39711	25 %	25 %	25 %	25 %	111026101
87	NC_008270	ATCG	2	8	40475	40482	25 %	25 %	25 %	25 %	111026103
88	NC_008270	GAAG	2	8	40553	40560	50 %	0 %	50 %	0 %	111026104
89	NC_008270	CTTC	2	8	40655	40662	0 %	50 %	0 %	50 %	111026104
90	NC_008270	CTCG	2	8	40665	40672	0 %	25 %	25 %	50 %	111026104
91	NC_008270	AGCT	2	8	41271	41278	25 %	25 %	25 %	25 %	111026105
92	NC_008270	CCCG	2	8	41300	41307	0 %	0 %	25 %	75 %	111026105
93	NC_008270	CGAG	2	8	41745	41752	25 %	0 %	50 %	25 %	111026105
94	NC_008270	TCGT	2	8	41949	41956	0 %	50 %	25 %	25 %	111026105
95	NC_008270	GACG	2	8	42121	42128	25 %	0 %	50 %	25 %	111026105
96	NC_008270	CGAC	2	8	42165	42172	25 %	0 %	25 %	50 %	111026105
97	NC_008270	CGCC	2	8	42300	42307	0 %	0 %	25 %	75 %	111026105
98	NC_008270	GAGT	2	8	42348	42355	25 %	25 %	50 %	0 %	111026105
99	NC_008270	CAGG	2	8	42649	42656	25 %	0 %	50 %	25 %	111026105
100	NC_008270	GCGG	2	8	43455	43462	0 %	0 %	75 %	25 %	111026107
101	NC_008270	CCGG	2	8	44432	44439	0 %	0 %	50 %	50 %	111026108
102	NC_008270	GGCC	2	8	44606	44613	0 %	0 %	50 %	50 %	111026108
103	NC_008270	GCCG	2	8	44817	44824	0 %	0 %	50 %	50 %	111026109
104	NC_008270	TTGG	2	8	45468	45475	0 %	50 %	50 %	0 %	111026109
105	NC_008270	ACGA	2	8	46505	46512	50 %	0 %	25 %	25 %	111026111
106	NC_008270	GCCG	2	8	46642	46649	0 %	0 %	50 %	50 %	111026111
107	NC_008270	ACCG	3	12	47062	47073	25 %	0 %	25 %	50 %	111026112
108	NC_008270	GCCG	2	8	47363	47370	0 %	0 %	50 %	50 %	111026112
109	NC_008270	AGAA	2	8	48068	48075	75 %	0 %	25 %	0 %	111026113
110	NC_008270	CCGC	2	8	51384	51391	0 %	0 %	25 %	75 %	111026116
111	NC_008270	CAGG	2	8	52035	52042	25 %	0 %	50 %	25 %	111026117
112	NC_008270	CGCC	2	8	52234	52241	0 %	0 %	25 %	75 %	111026118
113	NC_008270	GGAC	2	8	52450	52457	25 %	0 %	50 %	25 %	111026118
114	NC_008270	CGAT	2	8	52629	52636	25 %	25 %	25 %	25 %	111026118
115	NC_008270	CGAG	2	8	53837	53844	25 %	0 %	50 %	25 %	111026120
116	NC_008270	CGGC	2	8	53896	53903	0 %	0 %	50 %	50 %	111026120
117	NC_008270	TGCC	2	8	54127	54134	0 %	25 %	25 %	50 %	111026120
118	NC_008270	GCAA	2	8	54265	54272	50 %	0 %	25 %	25 %	111026120
119	NC_008270	AGCA	2	8	54334	54341	50 %	0 %	25 %	25 %	111026120
120	NC_008270	GCAC	2	8	54921	54928	25 %	0 %	25 %	50 %	111026120
121	NC_008270	CGGC	2	8	55144	55151	0 %	0 %	50 %	50 %	111026120
122	NC_008270	CGTC	2	8	55186	55193	0 %	25 %	25 %	50 %	111026120
123	NC_008270	GCCG	2	8	55487	55494	0 %	0 %	50 %	50 %	111026120
124	NC_008270	CCGG	2	8	55747	55754	0 %	0 %	50 %	50 %	111026120
125	NC_008270	CGAC	2	8	55783	55790	25 %	0 %	25 %	50 %	111026120
126	NC_008270	CCAC	2	8	56095	56102	25 %	0 %	0 %	75 %	111026120
127	NC_008270	CAGC	2	8	56307	56314	25 %	0 %	25 %	50 %	111026121
128	NC_008270	CGGC	2	8	56511	56518	0 %	0 %	50 %	50 %	111026121
129	NC_008270	CTTC	2	8	56521	56528	0 %	50 %	0 %	50 %	111026121
130	NC_008270	GCCT	2	8	57261	57268	0 %	25 %	25 %	50 %	111026122
131	NC_008270	GCTC	2	8	57363	57370	0 %	25 %	25 %	50 %	111026122
132	NC_008270	ACTG	2	8	58425	58432	25 %	25 %	25 %	25 %	111026123
133	NC_008270	CGGC	2	8	58807	58814	0 %	0 %	50 %	50 %	111026124
134	NC_008270	CCAG	2	8	58898	58905	25 %	0 %	25 %	50 %	111026124
135	NC_008270	CCGG	2	8	59006	59013	0 %	0 %	50 %	50 %	111026124
136	NC_008270	GCCG	2	8	59966	59973	0 %	0 %	50 %	50 %	111026126
137	NC_008270	TGCC	2	8	60304	60311	0 %	25 %	25 %	50 %	111026126
138	NC_008270	GATC	2	8	60350	60357	25 %	25 %	25 %	25 %	111026126
139	NC_008270	GGCG	2	8	60459	60466	0 %	0 %	75 %	25 %	111026126
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141	NC_008270	CGTG	2	8	60954	60961	0 %	25 %	50 %	25 %	111026127
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