MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 7328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008270	GCC	2	6	54	59	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008270	TGC	2	6	109	114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008270	CCG	3	9	256	264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026069
4	NC_008270	GCT	2	6	271	276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026069
5	NC_008270	GCG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026069
6	NC_008270	CGG	3	9	481	489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026069
7	NC_008270	CAG	2	6	521	526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026069
8	NC_008270	GAT	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026069
9	NC_008270	CGG	2	6	658	663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026069
10	NC_008270	CCA	2	6	718	723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026069
11	NC_008270	GCG	2	6	726	731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026069
12	NC_008270	GTG	2	6	792	797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026069
13	NC_008270	GAT	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026069
14	NC_008270	GCC	2	6	834	839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026069
15	NC_008270	CAC	2	6	965	970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026069
16	NC_008270	ACC	2	6	996	1001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026069
17	NC_008270	CTC	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026069
18	NC_008270	GCG	2	6	1032	1037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026069
19	NC_008270	CCG	3	9	1105	1113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026069
20	NC_008270	TCA	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026069
21	NC_008270	TCG	2	6	1143	1148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026069
22	NC_008270	CAA	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026069
23	NC_008270	ACT	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026070
24	NC_008270	GCC	2	6	1641	1646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026070
25	NC_008270	GCC	2	6	1675	1680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026070
26	NC_008270	CAG	2	6	1724	1729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026070
27	NC_008270	GCC	3	9	1755	1763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026070
28	NC_008270	CTC	2	6	1814	1819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026070
29	NC_008270	CTC	2	6	1850	1855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026070
30	NC_008270	CCG	2	6	2072	2077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026071
31	NC_008270	CAC	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026071
32	NC_008270	ACC	3	9	2180	2188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026071
33	NC_008270	CTC	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026071
34	NC_008270	AAC	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026071
35	NC_008270	CCA	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026071
36	NC_008270	CGG	2	6	2570	2575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026072
37	NC_008270	GCC	2	6	2806	2811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026072
38	NC_008270	TGC	2	6	2886	2891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008270	TCC	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026073
40	NC_008270	CCG	2	6	3007	3012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026073
41	NC_008270	TCC	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026073
42	NC_008270	TCT	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026073
43	NC_008270	ACG	2	6	3339	3344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026073
44	NC_008270	CGT	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026073
45	NC_008270	CCG	3	9	3457	3465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026073
46	NC_008270	CGC	2	6	3474	3479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026073
47	NC_008270	GCC	2	6	3483	3488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026073
48	NC_008270	TCC	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026073
49	NC_008270	TCG	2	6	3659	3664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026073
50	NC_008270	CAG	2	6	3778	3783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026073
51	NC_008270	CGC	3	9	3791	3799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026073
52	NC_008270	ACC	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026073
53	NC_008270	CGC	2	6	3916	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026073
54	NC_008270	AAC	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008270	ACA	2	6	4031	4036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008270	CGG	2	6	4306	4311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026074
57	NC_008270	GAA	2	6	4399	4404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026074
58	NC_008270	GCA	2	6	4506	4511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026074
59	NC_008270	CGA	2	6	4743	4748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026074
60	NC_008270	ACG	2	6	4770	4775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008270	AGC	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008270	CGT	2	6	4933	4938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026075
63	NC_008270	CGT	2	6	5057	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026075
64	NC_008270	ACG	2	6	5169	5174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026075
65	NC_008270	CTG	2	6	5270	5275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026075
66	NC_008270	CGG	2	6	5296	5301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026075
67	NC_008270	GCT	2	6	5314	5319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026075
68	NC_008270	CGA	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026075
69	NC_008270	GCC	2	6	5340	5345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026075
70	NC_008270	CGA	2	6	5387	5392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026075
71	NC_008270	GCC	2	6	5737	5742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026076
72	NC_008270	CGC	2	6	5791	5796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026076
73	NC_008270	TGC	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026076
74	NC_008270	GGC	2	6	5947	5952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026076
75	NC_008270	GAA	2	6	6067	6072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026076
76	NC_008270	CAC	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026076
77	NC_008270	GGC	2	6	6145	6150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026076
78	NC_008270	CCA	2	6	6174	6179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026076
79	NC_008270	CGG	2	6	6275	6280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026077
80	NC_008270	CTG	2	6	6342	6347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
81	NC_008270	GAG	2	6	6357	6362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026077
82	NC_008270	TCC	2	6	6414	6419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026077
83	NC_008270	ATG	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026077
84	NC_008270	CGA	2	6	6551	6556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026077
85	NC_008270	TGG	2	6	6559	6564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026077
86	NC_008270	CTG	2	6	6796	6801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
87	NC_008270	GCC	2	6	6878	6883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026077
88	NC_008270	ATG	2	6	6954	6959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026077
89	NC_008270	CTT	2	6	7104	7109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026077
90	NC_008270	CGA	2	6	7125	7130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026077
91	NC_008270	GCG	2	6	7162	7167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026077
92	NC_008270	ATC	2	6	7168	7173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026077
93	NC_008270	GCC	2	6	7392	7397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026077
94	NC_008270	CTG	2	6	7489	7494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
95	NC_008270	TGC	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
96	NC_008270	GGT	2	6	7704	7709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026077
97	NC_008270	CTG	2	6	7721	7726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
98	NC_008270	GTC	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
99	NC_008270	GCT	2	6	7757	7762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
100	NC_008270	CGA	2	6	7781	7786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026077
101	NC_008270	TGC	2	6	7797	7802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
102	NC_008270	CGT	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
103	NC_008270	TGC	2	6	7890	7895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
104	NC_008270	GGC	2	6	7911	7916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026077
105	NC_008270	CCA	2	6	7926	7931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026077
106	NC_008270	CGC	3	9	7979	7987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026077
107	NC_008270	ACC	2	6	8184	8189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026077
108	NC_008270	CGC	2	6	8222	8227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026077
109	NC_008270	ATC	2	6	8277	8282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026077
110	NC_008270	TCC	2	6	8386	8391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026077
111	NC_008270	CAA	2	6	8508	8513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026077
112	NC_008270	CGA	2	6	8549	8554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026077
113	NC_008270	GCC	2	6	8630	8635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026077
114	NC_008270	CAA	2	6	8727	8732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026077
115	NC_008270	CGC	2	6	8778	8783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026077
116	NC_008270	AGC	2	6	8784	8789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026077
117	NC_008270	CAA	2	6	8861	8866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026077
118	NC_008270	CAA	2	6	9036	9041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026077
119	NC_008270	CAC	2	6	9117	9122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026077
120	NC_008270	GCG	2	6	9346	9351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026077
121	NC_008270	GTG	2	6	9438	9443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026077
122	NC_008270	GAA	2	6	9596	9601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026077
123	NC_008270	CAG	2	6	9672	9677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026077
124	NC_008270	CCG	2	6	9694	9699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026077
125	NC_008270	TCG	2	6	9703	9708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
126	NC_008270	GAA	2	6	9729	9734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026077
127	NC_008270	ATC	2	6	9747	9752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026077
128	NC_008270	GCG	2	6	9753	9758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026077
129	NC_008270	CAC	2	6	9780	9785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026077
130	NC_008270	GCG	2	6	9991	9996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026077
131	NC_008270	CGC	2	6	10023	10028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026077
132	NC_008270	TCG	2	6	10048	10053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
133	NC_008270	GCG	2	6	10229	10234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026077
134	NC_008270	CGG	2	6	10338	10343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026077
135	NC_008270	GCA	2	6	10390	10395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026077
136	NC_008270	CTG	2	6	10458	10463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
137	NC_008270	GCA	2	6	10636	10641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026077
138	NC_008270	ACC	2	6	10683	10688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026077
139	NC_008270	GCC	2	6	10713	10718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026077
140	NC_008270	GCC	2	6	10750	10755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026077
141	NC_008270	CAC	2	6	10784	10789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026077
142	NC_008270	CAG	2	6	11013	11018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026077
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144	NC_008270	CGC	2	6	11281	11286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026077
145	NC_008270	CAC	2	6	11291	11296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026077
146	NC_008270	TCG	2	6	11350	11355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026077
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151	NC_008270	CAG	2	6	11609	11614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026077
152	NC_008270	GCC	2	6	11631	11636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_008270	GCC	2	6	11779	11784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_008270	TCG	2	6	11871	11876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026078
155	NC_008270	CTT	2	6	11903	11908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026078
156	NC_008270	TCG	2	6	12236	12241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026079
157	NC_008270	CAT	2	6	12245	12250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026079
158	NC_008270	AAC	2	6	12303	12308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026079
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160	NC_008270	CGG	2	6	12398	12403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026079
161	NC_008270	CAC	2	6	12468	12473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026079
162	NC_008270	GGC	2	6	12505	12510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_008270	AAG	2	6	12589	12594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026080
164	NC_008270	CGT	2	6	12655	12660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026080
165	NC_008270	CAT	2	6	12915	12920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026080
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167	NC_008270	GTA	3	9	13049	13057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026080
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169	NC_008270	CTC	2	6	13126	13131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026080
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199	NC_008270	TGA	2	6	14436	14441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_008270	CTC	2	6	17508	17513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
242	NC_008270	CGT	2	6	17544	17549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_008270	CGT	2	6	17656	17661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_008270	CGA	2	6	17670	17675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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246	NC_008270	ATC	2	6	17803	17808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_008270	CCA	2	6	17911	17916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
248	NC_008270	GAC	2	6	17941	17946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026086
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255	NC_008270	GTC	2	6	18320	18325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026086
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257	NC_008270	ACG	2	6	18393	18398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026086
258	NC_008270	AGC	2	6	18467	18472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_008270	ACC	2	6	18524	18529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_008270	GAC	2	6	18547	18552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_008270	ACA	2	6	18623	18628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_008270	TGA	2	6	18699	18704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_008270	GGC	2	6	18805	18810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_008270	CAA	2	6	18814	18819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_008270	TGC	2	6	18820	18825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_008270	AGT	2	6	18844	18849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_008270	TGC	2	6	18852	18857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_008270	CCT	2	6	18890	18895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_008270	TCG	2	6	19014	19019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_008270	CGC	2	6	19023	19028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_008270	CGA	2	6	19139	19144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026087
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290	NC_008270	TGA	2	6	19832	19837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026087
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336	NC_008270	GGT	2	6	22226	22231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
337	NC_008270	TGT	2	6	22278	22283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
338	NC_008270	GTT	2	6	22314	22319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
339	NC_008270	GCG	2	6	22340	22345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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372	NC_008270	TTC	2	6	24140	24145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026092
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377	NC_008270	GAG	2	6	24263	24268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026092
378	NC_008270	CGC	2	6	24283	24288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026092
379	NC_008270	TGC	2	6	24489	24494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
380	NC_008270	CGA	2	6	24501	24506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026093
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382	NC_008270	TCA	2	6	24524	24529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026093
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497	NC_008270	CCG	2	6	30605	30610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026096
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499	NC_008270	CCA	2	6	30689	30694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026096
500	NC_008270	CGG	2	6	30696	30701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026096

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