MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008270	GC	3	6	86	91	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008270	CA	3	6	1375	1380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008270	AC	3	6	11641	11646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008270	GT	3	6	12129	12134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008270	GT	3	6	14457	14462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008270	CG	3	6	15112	15117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008270	GT	3	6	15861	15866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008270	TG	3	6	17736	17741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008270	AT	3	6	32190	32195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008270	CT	3	6	32225	32230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008270	CA	3	6	32707	32712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008270	GA	3	6	32744	32749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008270	GT	3	6	36736	36741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008270	CG	3	6	36848	36853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008270	CG	3	6	36978	36983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008270	CT	3	6	38299	38304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008270	CA	3	6	40102	40107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008270	GA	3	6	51629	51634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008270	CG	3	6	59108	59113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008270	AG	3	6	60821	60826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008270	CA	3	6	63387	63392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008270	CA	3	6	65524	65529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008270	TC	4	8	65906	65913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008270	CT	3	6	68251	68256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008270	TC	4	8	69577	69584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008270	CA	3	6	70519	70524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008270	CT	3	6	75989	75994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008270	AC	3	6	77134	77139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008270	GC	3	6	78481	78486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008270	CA	3	6	80660	80665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008270	GC	3	6	80717	80722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008270	GC	3	6	84425	84430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008270	AC	3	6	93806	93811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008270	CG	3	6	96003	96008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008270	AC	3	6	96077	96082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008270	GT	3	6	115715	115720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008270	CG	3	6	117860	117865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008270	CT	3	6	122791	122796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008270	AC	3	6	128605	128610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008270	GC	3	6	135962	135967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008270	GT	3	6	142389	142394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008270	TG	3	6	142415	142420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008270	CG	3	6	145841	145846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008270	TG	3	6	147231	147236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008270	CG	3	6	158812	158817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008270	CG	3	6	158857	158862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008270	AC	3	6	159936	159941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008270	GC	3	6	159944	159949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008270	TC	3	6	161727	161732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008270	CA	3	6	167018	167023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008270	CG	3	6	168875	168880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008270	GA	4	8	168881	168888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008270	CT	3	6	176427	176432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008270	CG	3	6	179335	179340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008270	AG	3	6	179396	179401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008270	GC	3	6	179481	179486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008270	GT	3	6	185217	185222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008270	GT	3	6	185231	185236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008270	CA	3	6	188967	188972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008270	GC	3	6	189171	189176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008270	GC	3	6	196618	196623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008270	TC	3	6	196973	196978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008270	AG	3	6	202178	202183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008270	AG	3	6	202219	202224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008270	AG	3	6	205476	205481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008270	GC	4	8	209394	209401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008270	GC	3	6	214376	214381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008270	GA	3	6	217303	217308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008270	CG	3	6	219276	219281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008270	AC	3	6	226193	226198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008270	CG	3	6	228973	228978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008270	GC	3	6	228994	228999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008270	TC	3	6	229069	229074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008270	TG	3	6	229079	229084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008270	GA	3	6	232923	232928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008270	GT	3	6	233137	233142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008270	CG	3	6	233787	233792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008270	GC	3	6	233837	233842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008270	TG	3	6	234001	234006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008270	CG	3	6	238148	238153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008270	GT	3	6	239024	239029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008270	GC	3	6	239362	239367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008270	AC	3	6	240487	240492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008270	CG	3	6	240537	240542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008270	CG	4	8	242494	242501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008270	CG	4	8	242725	242732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008270	GC	3	6	245451	245456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008270	GT	3	6	245514	245519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008270	TC	3	6	253487	253492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008270	CT	3	6	254460	254465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008270	GC	3	6	255489	255494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008270	GC	3	6	256434	256439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008270	GC	3	6	256463	256468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008270	CG	4	8	258774	258781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008270	GC	3	6	260850	260855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008270	AC	3	6	261410	261415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008270	CG	3	6	271044	271049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008270	CT	3	6	280958	280963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008270	GC	3	6	281324	281329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008270	GC	3	6	281921	281926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008270	GC	3	6	282182	282187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008270	GT	3	6	291191	291196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008270	GA	3	6	291375	291380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008270	GC	3	6	292743	292748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008270	AG	3	6	295306	295311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008270	CA	3	6	307893	307898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008270	GT	3	6	307956	307961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008270	AG	3	6	309771	309776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008270	GT	3	6	316397	316402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008270	TC	3	6	319541	319546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008270	GC	3	6	320142	320147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008270	TG	3	6	320678	320683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008270	GA	3	6	320971	320976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008270	TG	3	6	327832	327837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008270	GC	3	6	327841	327846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008270	CA	3	6	329252	329257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008270	GC	3	6	329401	329406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008270	GA	3	6	336100	336105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008270	CA	3	6	337022	337027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008270	TC	3	6	337511	337516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008270	AG	3	6	338047	338052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008270	CG	3	6	341253	341258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008270	AG	4	8	341461	341468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008270	GT	3	6	346589	346594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008270	AC	3	6	347044	347049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008270	CA	3	6	358232	358237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008270	TG	3	6	362561	362566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008270	GA	3	6	366599	366604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008270	CT	3	6	367386	367391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008270	TC	3	6	374263	374268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008270	GA	3	6	374500	374505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008270	GC	3	6	378007	378012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008270	GC	3	6	378713	378718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008270	CG	3	6	383142	383147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008270	GC	3	6	384651	384656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008270	CG	3	6	384704	384709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008270	CG	3	6	386502	386507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008270	CG	3	6	387721	387726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008270	GC	3	6	390148	390153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008270	GC	3	6	391423	391428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008270	GC	3	6	391491	391496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008270	CG	3	6	392022	392027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008270	GC	3	6	392136	392141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008270	CT	3	6	392258	392263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008270	CG	3	6	393242	393247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008270	TC	3	6	393307	393312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008270	CT	3	6	393350	393355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008270	AC	3	6	395952	395957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008270	AC	3	6	396767	396772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008270	AC	3	6	400354	400359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008270	GT	3	6	400425	400430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008270	AG	3	6	400484	400489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008270	AC	3	6	408538	408543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_008270	CT	3	6	408584	408589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_008270	CA	3	6	409776	409781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_008270	CA	3	6	410256	410261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_008270	GT	3	6	411752	411757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008270	GC	3	6	418312	418317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_008270	GC	3	6	427758	427763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
160	NC_008270	CG	3	6	431481	431486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_008270	CA	3	6	432485	432490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_008270	CG	3	6	434473	434478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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168	NC_008270	GT	3	6	442237	442242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.