MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008270	C	6	6	618	623	0 %	0 %	0 %	100 %	111026069
2	NC_008270	G	6	6	12349	12354	0 %	0 %	100 %	0 %	111026079
3	NC_008270	C	6	6	14170	14175	0 %	0 %	0 %	100 %	111026081
4	NC_008270	G	6	6	19889	19894	0 %	0 %	100 %	0 %	111026087
5	NC_008270	A	6	6	22422	22427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008270	G	6	6	26619	26624	0 %	0 %	100 %	0 %	111026094
7	NC_008270	G	6	6	34963	34968	0 %	0 %	100 %	0 %	111026097
8	NC_008270	G	7	7	36519	36525	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008270	T	6	6	43927	43932	0 %	100 %	0 %	0 %	111026108
10	NC_008270	C	6	6	44353	44358	0 %	0 %	0 %	100 %	111026108
11	NC_008270	C	6	6	45555	45560	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_008270	C	6	6	55756	55761	0 %	0 %	0 %	100 %	111026120
13	NC_008270	G	6	6	63618	63623	0 %	0 %	100 %	0 %	111026129
14	NC_008270	G	6	6	72231	72236	0 %	0 %	100 %	0 %	111026139
15	NC_008270	G	6	6	75019	75024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008270	T	6	6	79774	79779	0 %	100 %	0 %	0 %	111026150
17	NC_008270	C	6	6	85762	85767	0 %	0 %	0 %	100 %	111026156
18	NC_008270	G	6	6	89366	89371	0 %	0 %	100 %	0 %	111026160
19	NC_008270	G	6	6	96642	96647	0 %	0 %	100 %	0 %	111026172
20	NC_008270	G	6	6	96929	96934	0 %	0 %	100 %	0 %	111026173
21	NC_008270	G	6	6	99924	99929	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008270	G	6	6	100948	100953	0 %	0 %	100 %	0 %	111026179
23	NC_008270	T	6	6	115379	115384	0 %	100 %	0 %	0 %	111026192
24	NC_008270	C	6	6	115859	115864	0 %	0 %	0 %	100 %	111026193
25	NC_008270	G	6	6	118190	118195	0 %	0 %	100 %	0 %	111026195
26	NC_008270	G	7	7	119227	119233	0 %	0 %	100 %	0 %	111026195
27	NC_008270	T	6	6	124220	124225	0 %	100 %	0 %	0 %	111026201
28	NC_008270	G	6	6	128080	128085	0 %	0 %	100 %	0 %	111026206
29	NC_008270	T	6	6	132215	132220	0 %	100 %	0 %	0 %	111026211
30	NC_008270	G	6	6	135443	135448	0 %	0 %	100 %	0 %	111026215
31	NC_008270	G	6	6	136144	136149	0 %	0 %	100 %	0 %	111026216
32	NC_008270	G	6	6	137515	137520	0 %	0 %	100 %	0 %	111026216
33	NC_008270	G	6	6	142899	142904	0 %	0 %	100 %	0 %	111026218
34	NC_008270	C	6	6	144261	144266	0 %	0 %	0 %	100 %	111026220
35	NC_008270	C	6	6	150194	150199	0 %	0 %	0 %	100 %	111026227
36	NC_008270	C	6	6	166989	166994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_008270	C	6	6	167166	167171	0 %	0 %	0 %	100 %	111026241
38	NC_008270	C	6	6	172398	172403	0 %	0 %	0 %	100 %	111026245
39	NC_008270	A	7	7	190643	190649	100 %	0 %	0 %	0 %	111026263
40	NC_008270	G	7	7	193781	193787	0 %	0 %	100 %	0 %	111026265
41	NC_008270	G	6	6	202481	202486	0 %	0 %	100 %	0 %	111026276
42	NC_008270	C	6	6	207243	207248	0 %	0 %	0 %	100 %	111026282
43	NC_008270	G	6	6	209644	209649	0 %	0 %	100 %	0 %	111026286
44	NC_008270	C	6	6	210520	210525	0 %	0 %	0 %	100 %	111026287
45	NC_008270	T	7	7	218283	218289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008270	G	7	7	220396	220402	0 %	0 %	100 %	0 %	111026297
47	NC_008270	C	6	6	223227	223232	0 %	0 %	0 %	100 %	111026298
48	NC_008270	C	6	6	226513	226518	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_008270	C	6	6	226538	226543	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_008270	C	6	6	226559	226564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_008270	G	6	6	233879	233884	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008270	T	8	8	237988	237995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008270	G	6	6	241712	241717	0 %	0 %	100 %	0 %	111026315
54	NC_008270	C	6	6	241946	241951	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_008270	G	6	6	248464	248469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008270	C	6	6	251881	251886	0 %	0 %	0 %	100 %	111026330
57	NC_008270	G	6	6	254677	254682	0 %	0 %	100 %	0 %	111026332
58	NC_008270	G	6	6	258810	258815	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008270	A	6	6	282747	282752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008270	C	6	6	282777	282782	0 %	0 %	0 %	100 %	111026361
61	NC_008270	G	6	6	283533	283538	0 %	0 %	100 %	0 %	111026361
62	NC_008270	G	7	7	290543	290549	0 %	0 %	100 %	0 %	111026367
63	NC_008270	C	6	6	291071	291076	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_008270	G	6	6	296840	296845	0 %	0 %	100 %	0 %	111026373
65	NC_008270	G	6	6	302653	302658	0 %	0 %	100 %	0 %	111026378
66	NC_008270	G	6	6	304598	304603	0 %	0 %	100 %	0 %	111026380
67	NC_008270	C	7	7	304897	304903	0 %	0 %	0 %	100 %	111026380
68	NC_008270	G	6	6	305401	305406	0 %	0 %	100 %	0 %	111026381
69	NC_008270	C	6	6	312983	312988	0 %	0 %	0 %	100 %	111026387
70	NC_008270	C	6	6	313825	313830	0 %	0 %	0 %	100 %	111026387
71	NC_008270	G	6	6	318995	319000	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008270	C	6	6	331741	331746	0 %	0 %	0 %	100 %	111026407
73	NC_008270	C	6	6	336765	336770	0 %	0 %	0 %	100 %	111026411
74	NC_008270	G	6	6	345356	345361	0 %	0 %	100 %	0 %	111026423
75	NC_008270	C	6	6	347123	347128	0 %	0 %	0 %	100 %	111026425
76	NC_008270	C	6	6	348367	348372	0 %	0 %	0 %	100 %	111026426
77	NC_008270	A	6	6	354375	354380	100 %	0 %	0 %	0 %	111026431
78	NC_008270	C	6	6	354976	354981	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_008270	G	6	6	361922	361927	0 %	0 %	100 %	0 %	111026437
80	NC_008270	G	6	6	378047	378052	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008270	C	6	6	378460	378465	0 %	0 %	0 %	100 %	111026454
82	NC_008270	C	6	6	379928	379933	0 %	0 %	0 %	100 %	111026456
83	NC_008270	G	6	6	380941	380946	0 %	0 %	100 %	0 %	111026457
84	NC_008270	G	6	6	383977	383982	0 %	0 %	100 %	0 %	111026462
85	NC_008270	G	6	6	384709	384714	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008270	T	6	6	387592	387597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008270	C	6	6	388483	388488	0 %	0 %	0 %	100 %	111026466
88	NC_008270	A	6	6	389919	389924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008270	G	6	6	391618	391623	0 %	0 %	100 %	0 %	111026468
90	NC_008270	T	6	6	392797	392802	0 %	100 %	0 %	0 %	111026469
91	NC_008270	T	6	6	397737	397742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008270	A	6	6	401423	401428	100 %	0 %	0 %	0 %	111026478
93	NC_008270	T	6	6	402347	402352	0 %	100 %	0 %	0 %	111026479
94	NC_008270	C	7	7	403251	403257	0 %	0 %	0 %	100 %	111026481
95	NC_008270	T	6	6	406240	406245	0 %	100 %	0 %	0 %	111026485
96	NC_008270	C	7	7	407144	407150	0 %	0 %	0 %	100 %	111026487
97	NC_008270	A	6	6	435841	435846	100 %	0 %	0 %	0 %	111026516
98	NC_008270	G	6	6	442341	442346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.