MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 3167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008269	TCGA	2	8	107	114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008269	CCCA	2	8	613	620	25 %	0 %	0 %	75 %	111024786
3	NC_008269	TCGC	2	8	676	683	0 %	25 %	25 %	50 %	111024786
4	NC_008269	GGGA	2	8	695	702	25 %	0 %	75 %	0 %	111024786
5	NC_008269	CACC	2	8	775	782	25 %	0 %	0 %	75 %	111024786
6	NC_008269	ACCC	2	8	927	934	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_008269	CCAT	2	8	1129	1136	25 %	25 %	0 %	50 %	111024787
8	NC_008269	GGCC	2	8	1184	1191	0 %	0 %	50 %	50 %	111024787
9	NC_008269	GCTC	2	8	1270	1277	0 %	25 %	25 %	50 %	111024787
10	NC_008269	AACC	2	8	1901	1908	50 %	0 %	0 %	50 %	111024788
11	NC_008269	CGAT	2	8	2094	2101	25 %	25 %	25 %	25 %	111024788
12	NC_008269	GGGT	2	8	2203	2210	0 %	25 %	75 %	0 %	111024788
13	NC_008269	CACG	2	8	2243	2250	25 %	0 %	25 %	50 %	111024788
14	NC_008269	CTTC	2	8	2571	2578	0 %	50 %	0 %	50 %	111024789
15	NC_008269	CAAA	2	8	2780	2787	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008269	ATAC	2	8	2912	2919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008269	TTGG	2	8	2957	2964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008269	CCCG	2	8	3251	3258	0 %	0 %	25 %	75 %	111024790
19	NC_008269	CGCA	2	8	4011	4018	25 %	0 %	25 %	50 %	111024791
20	NC_008269	AGTG	2	8	4195	4202	25 %	25 %	50 %	0 %	111024791
21	NC_008269	GCTG	2	8	4313	4320	0 %	25 %	50 %	25 %	111024792
22	NC_008269	GGCG	2	8	4488	4495	0 %	0 %	75 %	25 %	111024792
23	NC_008269	CGGC	2	8	4857	4864	0 %	0 %	50 %	50 %	111024792
24	NC_008269	CGGC	2	8	4924	4931	0 %	0 %	50 %	50 %	111024793
25	NC_008269	GCCG	2	8	5661	5668	0 %	0 %	50 %	50 %	111024793
26	NC_008269	CTCA	2	8	5954	5961	25 %	25 %	0 %	50 %	111024793
27	NC_008269	GACC	2	8	6028	6035	25 %	0 %	25 %	50 %	111024793
28	NC_008269	GATC	2	8	6319	6326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008269	TCCC	2	8	7068	7075	0 %	25 %	0 %	75 %	111024794
30	NC_008269	CTTC	2	8	8131	8138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008269	GCCC	2	8	9516	9523	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_008269	CGGG	2	8	9559	9566	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008269	GTCA	2	8	9573	9580	25 %	25 %	25 %	25 %	111024797
34	NC_008269	GGCC	2	8	10302	10309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008269	GGTC	2	8	10666	10673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008269	GCCG	2	8	10801	10808	0 %	0 %	50 %	50 %	111024798
37	NC_008269	GCGG	2	8	10899	10906	0 %	0 %	75 %	25 %	111024798
38	NC_008269	CGCT	2	8	11364	11371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008269	CTGC	2	8	11464	11471	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008269	TCGG	2	8	11573	11580	0 %	25 %	50 %	25 %	111024799
41	NC_008269	CCGA	2	8	11761	11768	25 %	0 %	25 %	50 %	111024799
42	NC_008269	AGCG	2	8	11776	11783	25 %	0 %	50 %	25 %	111024799
43	NC_008269	GGTG	2	8	11935	11942	0 %	25 %	75 %	0 %	111024799
44	NC_008269	CGCC	2	8	12437	12444	0 %	0 %	25 %	75 %	111024799
45	NC_008269	CCGA	2	8	12466	12473	25 %	0 %	25 %	50 %	111024799
46	NC_008269	TCCG	2	8	13218	13225	0 %	25 %	25 %	50 %	111024800
47	NC_008269	GAGT	2	8	13417	13424	25 %	25 %	50 %	0 %	111024800
48	NC_008269	GCCC	2	8	14112	14119	0 %	0 %	25 %	75 %	111024800
49	NC_008269	GATG	2	8	14348	14355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008269	GGCC	2	8	14634	14641	0 %	0 %	50 %	50 %	111024801
51	NC_008269	TCCG	2	8	14946	14953	0 %	25 %	25 %	50 %	111024801
52	NC_008269	GCCC	2	8	14963	14970	0 %	0 %	25 %	75 %	111024801
53	NC_008269	CGAA	2	8	15205	15212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008269	CTGT	2	8	15263	15270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008269	TTTG	2	8	15392	15399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008269	ACCG	2	8	15760	15767	25 %	0 %	25 %	50 %	111024802
57	NC_008269	ACCG	2	8	15811	15818	25 %	0 %	25 %	50 %	111024802
58	NC_008269	TCGG	2	8	16159	16166	0 %	25 %	50 %	25 %	111024803
59	NC_008269	GTCC	2	8	16177	16184	0 %	25 %	25 %	50 %	111024803
60	NC_008269	GATC	2	8	16360	16367	25 %	25 %	25 %	25 %	111024803
61	NC_008269	ACCT	2	8	16376	16383	25 %	25 %	0 %	50 %	111024803
62	NC_008269	ACCG	2	8	16670	16677	25 %	0 %	25 %	50 %	111024803
63	NC_008269	CTCG	2	8	16767	16774	0 %	25 %	25 %	50 %	111024803
64	NC_008269	GACC	2	8	17553	17560	25 %	0 %	25 %	50 %	111024804
65	NC_008269	CCTG	2	8	17939	17946	0 %	25 %	25 %	50 %	111024804
66	NC_008269	ACCG	2	8	18094	18101	25 %	0 %	25 %	50 %	111024804
67	NC_008269	CGCC	2	8	18370	18377	0 %	0 %	25 %	75 %	111024804
68	NC_008269	CTAC	2	8	18854	18861	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008269	CGGC	2	8	19307	19314	0 %	0 %	50 %	50 %	111024805
70	NC_008269	CTTC	2	8	19535	19542	0 %	50 %	0 %	50 %	111024805
71	NC_008269	CACG	2	8	19574	19581	25 %	0 %	25 %	50 %	111024805
72	NC_008269	GGGC	2	8	19642	19649	0 %	0 %	75 %	25 %	111024805
73	NC_008269	CCGA	2	8	20055	20062	25 %	0 %	25 %	50 %	111024806
74	NC_008269	GGTG	2	8	20541	20548	0 %	25 %	75 %	0 %	111024807
75	NC_008269	CGGT	2	8	20987	20994	0 %	25 %	50 %	25 %	111024807
76	NC_008269	CCAA	2	8	21210	21217	50 %	0 %	0 %	50 %	111024807
77	NC_008269	CCGG	2	8	21274	21281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008269	GCGG	2	8	22167	22174	0 %	0 %	75 %	25 %	111024809
79	NC_008269	CGGT	2	8	22184	22191	0 %	25 %	50 %	25 %	111024809
80	NC_008269	CCCG	2	8	22988	22995	0 %	0 %	25 %	75 %	111024810
81	NC_008269	TCGG	2	8	23386	23393	0 %	25 %	50 %	25 %	111024811
82	NC_008269	CGTG	2	8	23437	23444	0 %	25 %	50 %	25 %	111024811
83	NC_008269	GGAA	2	8	24046	24053	50 %	0 %	50 %	0 %	111024811
84	NC_008269	CCTT	2	8	24199	24206	0 %	50 %	0 %	50 %	111024811
85	NC_008269	ACCC	2	8	24313	24320	25 %	0 %	0 %	75 %	111024811
86	NC_008269	CGGC	2	8	24592	24599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008269	ATCA	2	8	25018	25025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008269	ACCC	2	8	25303	25310	25 %	0 %	0 %	75 %	111024812
89	NC_008269	GAAC	2	8	25417	25424	50 %	0 %	25 %	25 %	111024812
90	NC_008269	CAAC	2	8	26408	26415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008269	CCCA	2	8	26443	26450	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_008269	ATCT	2	8	26475	26482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008269	GGCC	2	8	26988	26995	0 %	0 %	50 %	50 %	111024815
94	NC_008269	GTGC	2	8	27172	27179	0 %	25 %	50 %	25 %	111024815
95	NC_008269	CGCC	2	8	28532	28539	0 %	0 %	25 %	75 %	111024817
96	NC_008269	CAGC	2	8	28697	28704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008269	GGGT	2	8	29945	29952	0 %	25 %	75 %	0 %	111024819
98	NC_008269	TACG	2	8	31720	31727	25 %	25 %	25 %	25 %	111024822
99	NC_008269	CGGA	2	8	32017	32024	25 %	0 %	50 %	25 %	111024823
100	NC_008269	CCGG	2	8	33110	33117	0 %	0 %	50 %	50 %	111024824
101	NC_008269	CGGT	2	8	33370	33377	0 %	25 %	50 %	25 %	111024824
102	NC_008269	AAAG	2	8	34104	34111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008269	CGCT	2	8	34694	34701	0 %	25 %	25 %	50 %	111024826
104	NC_008269	CCGG	2	8	35660	35667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008269	GCGG	2	8	36228	36235	0 %	0 %	75 %	25 %	111024827
106	NC_008269	GTCA	2	8	36897	36904	25 %	25 %	25 %	25 %	111024828
107	NC_008269	CGTT	2	8	37101	37108	0 %	50 %	25 %	25 %	111024828
108	NC_008269	GCTG	2	8	37666	37673	0 %	25 %	50 %	25 %	111024828
109	NC_008269	GCTC	2	8	37690	37697	0 %	25 %	25 %	50 %	111024828
110	NC_008269	TCCA	2	8	37781	37788	25 %	25 %	0 %	50 %	111024828
111	NC_008269	AGGC	2	8	38041	38048	25 %	0 %	50 %	25 %	111024829
112	NC_008269	GGAA	2	8	38280	38287	50 %	0 %	50 %	0 %	111024829
113	NC_008269	AGTC	2	8	38797	38804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008269	CAGC	2	8	38926	38933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008269	CCGC	2	8	39260	39267	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_008269	TGCA	2	8	39848	39855	25 %	25 %	25 %	25 %	111024831
117	NC_008269	CAGG	2	8	39994	40001	25 %	0 %	50 %	25 %	111024831
118	NC_008269	AGCA	2	8	40295	40302	50 %	0 %	25 %	25 %	111024831
119	NC_008269	TGGT	2	8	40596	40603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008269	TCAG	2	8	40901	40908	25 %	25 %	25 %	25 %	111024832
121	NC_008269	CTTG	2	8	40951	40958	0 %	50 %	25 %	25 %	111024832
122	NC_008269	CCGA	2	8	41538	41545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008269	ACCG	2	8	42103	42110	25 %	0 %	25 %	50 %	111024833
124	NC_008269	TCGA	2	8	42331	42338	25 %	25 %	25 %	25 %	111024833
125	NC_008269	GCGT	2	8	42376	42383	0 %	25 %	50 %	25 %	111024833
126	NC_008269	GTCG	2	8	42420	42427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008269	GCCA	2	8	42879	42886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008269	GATT	2	8	42957	42964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008269	CCCT	2	8	43488	43495	0 %	25 %	0 %	75 %	111024834
130	NC_008269	GTGC	2	8	44006	44013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008269	GTCG	2	8	44272	44279	0 %	25 %	50 %	25 %	111024835
132	NC_008269	GTCT	2	8	44457	44464	0 %	50 %	25 %	25 %	111024835
133	NC_008269	CGTG	2	8	44756	44763	0 %	25 %	50 %	25 %	111024835
134	NC_008269	CTGC	2	8	45134	45141	0 %	25 %	25 %	50 %	111024835
135	NC_008269	CGAC	2	8	45291	45298	25 %	0 %	25 %	50 %	111024835
136	NC_008269	TGGT	2	8	45313	45320	0 %	50 %	50 %	0 %	111024835
137	NC_008269	CCGA	2	8	45372	45379	25 %	0 %	25 %	50 %	111024835
138	NC_008269	GACA	2	8	46021	46028	50 %	0 %	25 %	25 %	111024836
139	NC_008269	CGGT	2	8	46257	46264	0 %	25 %	50 %	25 %	111024836
140	NC_008269	TCCG	2	8	46424	46431	0 %	25 %	25 %	50 %	111024837
141	NC_008269	CAAT	2	8	46460	46467	50 %	25 %	0 %	25 %	111024837
142	NC_008269	GTCC	2	8	46883	46890	0 %	25 %	25 %	50 %	111024837
143	NC_008269	CTGC	2	8	47855	47862	0 %	25 %	25 %	50 %	111024837
144	NC_008269	GGCA	2	8	48007	48014	25 %	0 %	50 %	25 %	111024837
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