MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 19587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008269	GCT	2	6	8	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008269	CAC	2	6	189	194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008269	ACG	2	6	201	206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008269	CGC	2	6	235	240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008269	CGC	2	6	256	261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008269	ACC	2	6	283	288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008269	AAC	2	6	325	330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008269	TTG	2	6	336	341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008269	CAA	2	6	344	349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008269	CAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024786
11	NC_008269	CCG	2	6	487	492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024786
12	NC_008269	TCA	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024786
13	NC_008269	ACC	2	6	623	628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
14	NC_008269	CAC	2	6	633	638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
15	NC_008269	GCA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024786
16	NC_008269	CAG	2	6	661	666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024786
17	NC_008269	GTC	2	6	749	754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024786
18	NC_008269	CGC	2	6	757	762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024786
19	NC_008269	GCC	2	6	767	772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024786
20	NC_008269	ACC	2	6	805	810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
21	NC_008269	CGA	2	6	827	832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024786
22	NC_008269	CCA	2	6	841	846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
23	NC_008269	ACG	2	6	971	976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008269	CCG	2	6	995	1000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_008269	CCG	2	6	1007	1012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008269	AAC	2	6	1062	1067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008269	CGT	2	6	1229	1234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024787
28	NC_008269	ACC	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024787
29	NC_008269	TCG	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024787
30	NC_008269	ATC	2	6	1508	1513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008269	GAT	2	6	1597	1602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024788
32	NC_008269	GTC	2	6	1619	1624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024788
33	NC_008269	CGT	2	6	1647	1652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024788
34	NC_008269	GGT	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024788
35	NC_008269	GGT	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024788
36	NC_008269	GCC	2	6	1947	1952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024788
37	NC_008269	CGC	2	6	1957	1962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024788
38	NC_008269	TTC	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024788
39	NC_008269	CCA	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024788
40	NC_008269	CGT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024788
41	NC_008269	AGG	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024788
42	NC_008269	TCT	2	6	2283	2288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024788
43	NC_008269	ACC	2	6	2327	2332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024788
44	NC_008269	GCC	2	6	2338	2343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008269	CAT	2	6	2419	2424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024789
46	NC_008269	TTC	2	6	2437	2442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024789
47	NC_008269	GCG	2	6	2525	2530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024789
48	NC_008269	GGT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024789
49	NC_008269	CAG	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024789
50	NC_008269	GCA	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008269	GCC	2	6	2859	2864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008269	ACG	2	6	3114	3119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008269	CTA	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024790
54	NC_008269	CCG	2	6	3229	3234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024790
55	NC_008269	TCC	2	6	3313	3318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024790
56	NC_008269	TCA	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024790
57	NC_008269	TGC	2	6	3559	3564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008269	CAG	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008269	ACC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
60	NC_008269	CGC	2	6	3670	3675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024791
61	NC_008269	CGG	2	6	3721	3726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024791
62	NC_008269	CCA	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
63	NC_008269	CAC	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
64	NC_008269	ACC	3	9	3762	3770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
65	NC_008269	ACG	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024791
66	NC_008269	CAC	3	9	3851	3859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
67	NC_008269	GCT	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024791
68	NC_008269	CAC	2	6	3925	3930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
69	NC_008269	TCC	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024791
70	NC_008269	TCC	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024791
71	NC_008269	CCT	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024791
72	NC_008269	CGC	2	6	4033	4038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024791
73	NC_008269	GCA	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024791
74	NC_008269	GTC	2	6	4141	4146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024791
75	NC_008269	TGG	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024791
76	NC_008269	CGC	2	6	4211	4216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024791
77	NC_008269	TGG	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024792
78	NC_008269	CCG	2	6	4448	4453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
79	NC_008269	CAC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024792
80	NC_008269	ATC	2	6	4498	4503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024792
81	NC_008269	CGC	2	6	4536	4541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
82	NC_008269	CCG	2	6	4562	4567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
83	NC_008269	GAC	2	6	4576	4581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024792
84	NC_008269	GAA	4	12	4669	4680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024792
85	NC_008269	GCG	2	6	4698	4703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024792
86	NC_008269	CGA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024792
87	NC_008269	CGC	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
88	NC_008269	GCC	2	6	4839	4844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
89	NC_008269	GGA	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024793
90	NC_008269	CAC	2	6	4934	4939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024793
91	NC_008269	GCT	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
92	NC_008269	CTG	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
93	NC_008269	ACG	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024793
94	NC_008269	TGC	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
95	NC_008269	CGG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
96	NC_008269	CGC	3	9	5129	5137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
97	NC_008269	CGG	2	6	5140	5145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
98	NC_008269	TCG	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
99	NC_008269	GCG	2	6	5200	5205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
100	NC_008269	GCT	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
101	NC_008269	CTG	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
102	NC_008269	TGA	2	6	5380	5385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024793
103	NC_008269	GTG	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024793
104	NC_008269	CCG	2	6	5515	5520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
105	NC_008269	CGG	2	6	5536	5541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
106	NC_008269	GCC	3	9	5580	5588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
107	NC_008269	GCG	2	6	5613	5618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
108	NC_008269	GCC	2	6	5640	5645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
109	NC_008269	GTG	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024793
110	NC_008269	TGC	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
111	NC_008269	CCG	3	9	5728	5736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
112	NC_008269	TGC	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
113	NC_008269	CGG	2	6	5944	5949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
114	NC_008269	CCG	2	6	5962	5967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
115	NC_008269	CCG	2	6	5998	6003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
116	NC_008269	CAA	2	6	6010	6015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024793
117	NC_008269	CCA	2	6	6019	6024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024793
118	NC_008269	CAC	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024793
119	NC_008269	CGA	2	6	6194	6199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008269	GCC	2	6	6254	6259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008269	CGC	2	6	6283	6288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_008269	CGC	2	6	6292	6297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008269	CGC	3	9	6343	6351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008269	GCC	2	6	6353	6358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_008269	CAC	2	6	6395	6400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008269	CGC	2	6	6459	6464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024794
127	NC_008269	GCC	2	6	6499	6504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024794
128	NC_008269	GCC	2	6	6586	6591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024794
129	NC_008269	CGG	3	9	6617	6625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024794
130	NC_008269	GCA	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024794
131	NC_008269	GGC	2	6	6873	6878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024794
132	NC_008269	CGG	2	6	6899	6904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024794
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134	NC_008269	GCC	2	6	7113	7118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024794
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