MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 16648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008269	CAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024786
2	NC_008269	CCG	2	6	487	492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024786
3	NC_008269	TCA	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024786
4	NC_008269	ACC	2	6	623	628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
5	NC_008269	CAC	2	6	633	638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
6	NC_008269	GCA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024786
7	NC_008269	CAG	2	6	661	666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024786
8	NC_008269	GTC	2	6	749	754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024786
9	NC_008269	CGC	2	6	757	762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024786
10	NC_008269	GCC	2	6	767	772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024786
11	NC_008269	ACC	2	6	805	810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
12	NC_008269	CGA	2	6	827	832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024786
13	NC_008269	CCA	2	6	841	846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
14	NC_008269	CGT	2	6	1229	1234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024787
15	NC_008269	ACC	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024787
16	NC_008269	TCG	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024787
17	NC_008269	GAT	2	6	1597	1602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024788
18	NC_008269	GTC	2	6	1619	1624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024788
19	NC_008269	CGT	2	6	1647	1652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024788
20	NC_008269	GGT	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024788
21	NC_008269	GGT	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024788
22	NC_008269	GCC	2	6	1947	1952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024788
23	NC_008269	CGC	2	6	1957	1962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024788
24	NC_008269	TTC	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024788
25	NC_008269	CCA	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024788
26	NC_008269	CGT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024788
27	NC_008269	AGG	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024788
28	NC_008269	TCT	2	6	2283	2288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024788
29	NC_008269	ACC	2	6	2327	2332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024788
30	NC_008269	CAT	2	6	2419	2424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024789
31	NC_008269	TTC	2	6	2437	2442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024789
32	NC_008269	GCG	2	6	2525	2530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024789
33	NC_008269	GGT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024789
34	NC_008269	CAG	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024789
35	NC_008269	CTA	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024790
36	NC_008269	CCG	2	6	3229	3234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024790
37	NC_008269	TCC	2	6	3313	3318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024790
38	NC_008269	TCA	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024790
39	NC_008269	ACC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
40	NC_008269	CGC	2	6	3670	3675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024791
41	NC_008269	CGG	2	6	3721	3726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024791
42	NC_008269	CCA	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
43	NC_008269	CAC	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
44	NC_008269	ACC	3	9	3762	3770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
45	NC_008269	ACG	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024791
46	NC_008269	CAC	3	9	3851	3859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
47	NC_008269	GCT	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024791
48	NC_008269	CAC	2	6	3925	3930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
49	NC_008269	TCC	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024791
50	NC_008269	TCC	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024791
51	NC_008269	CCT	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024791
52	NC_008269	CGC	2	6	4033	4038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024791
53	NC_008269	GCA	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024791
54	NC_008269	GTC	2	6	4141	4146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024791
55	NC_008269	TGG	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024791
56	NC_008269	CGC	2	6	4211	4216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024791
57	NC_008269	TGG	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024792
58	NC_008269	CCG	2	6	4448	4453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
59	NC_008269	CAC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024792
60	NC_008269	ATC	2	6	4498	4503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024792
61	NC_008269	CGC	2	6	4536	4541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
62	NC_008269	CCG	2	6	4562	4567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
63	NC_008269	GAC	2	6	4576	4581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024792
64	NC_008269	GAA	4	12	4669	4680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024792
65	NC_008269	GCG	2	6	4698	4703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024792
66	NC_008269	CGA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024792
67	NC_008269	CGC	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
68	NC_008269	GCC	2	6	4839	4844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
69	NC_008269	GGA	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024793
70	NC_008269	CAC	2	6	4934	4939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024793
71	NC_008269	GCT	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
72	NC_008269	CTG	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
73	NC_008269	ACG	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024793
74	NC_008269	TGC	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
75	NC_008269	CGG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
76	NC_008269	CGC	3	9	5129	5137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
77	NC_008269	CGG	2	6	5140	5145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
78	NC_008269	TCG	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
79	NC_008269	GCG	2	6	5200	5205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
80	NC_008269	GCT	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
81	NC_008269	CTG	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
82	NC_008269	TGA	2	6	5380	5385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024793
83	NC_008269	GTG	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024793
84	NC_008269	CCG	2	6	5515	5520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
85	NC_008269	CGG	2	6	5536	5541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
86	NC_008269	GCC	3	9	5580	5588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
87	NC_008269	GCG	2	6	5613	5618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
88	NC_008269	GCC	2	6	5640	5645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
89	NC_008269	GTG	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024793
90	NC_008269	TGC	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
91	NC_008269	CCG	3	9	5728	5736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
92	NC_008269	TGC	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
93	NC_008269	CGG	2	6	5944	5949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
94	NC_008269	CCG	2	6	5962	5967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
95	NC_008269	CCG	2	6	5998	6003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
96	NC_008269	CAA	2	6	6010	6015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024793
97	NC_008269	CCA	2	6	6019	6024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024793
98	NC_008269	CAC	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024793
99	NC_008269	CGC	2	6	6459	6464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024794
100	NC_008269	GCC	2	6	6499	6504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024794
101	NC_008269	GCC	2	6	6586	6591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024794
102	NC_008269	CGG	3	9	6617	6625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024794
103	NC_008269	GCA	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024794
104	NC_008269	GGC	2	6	6873	6878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024794
105	NC_008269	CGG	2	6	6899	6904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024794
106	NC_008269	CGG	2	6	6957	6962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024794
107	NC_008269	GCC	2	6	7113	7118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024794
108	NC_008269	TCT	2	6	7154	7159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024794
109	NC_008269	CCT	2	6	7169	7174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024794
110	NC_008269	ACC	2	6	7180	7185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024794
111	NC_008269	ATC	2	6	7240	7245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024794
112	NC_008269	CGT	2	6	7346	7351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024794
113	NC_008269	CGT	2	6	7793	7798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024795
114	NC_008269	CGT	2	6	7817	7822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024795
115	NC_008269	CGA	2	6	7850	7855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024795
116	NC_008269	CTC	2	6	7929	7934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024795
117	NC_008269	GCG	3	9	7984	7992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024795
118	NC_008269	CAC	2	6	8036	8041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024795
119	NC_008269	CGG	2	6	8087	8092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024795
120	NC_008269	CCG	2	6	8093	8098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024795
121	NC_008269	CGC	2	6	8249	8254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024796
122	NC_008269	GCG	2	6	8258	8263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024796
123	NC_008269	CCG	2	6	8284	8289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024796
124	NC_008269	TCG	2	6	8305	8310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024796
125	NC_008269	GCC	2	6	8334	8339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024796
126	NC_008269	CGC	2	6	8389	8394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024796
127	NC_008269	CGT	3	9	8420	8428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024796
128	NC_008269	CGC	2	6	8444	8449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024796
129	NC_008269	GCG	2	6	8497	8502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024796
130	NC_008269	GGA	2	6	8519	8524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024796
131	NC_008269	GCC	2	6	8560	8565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024796
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257	NC_008269	TGC	2	6	16410	16415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024803
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499	NC_008269	CTA	2	6	31623	31628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024822
500	NC_008269	CCA	2	6	31673	31678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024822

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