MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 421

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008269	GC	3	6	74	79	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008269	TC	3	6	1088	1093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008269	CA	3	6	3045	3050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008269	CA	3	6	3156	3161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008269	TC	3	6	6372	6377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008269	GC	3	6	7530	7535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008269	CG	3	6	7599	7604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008269	CG	3	6	9536	9541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008269	CG	3	6	10439	10444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008269	GC	3	6	10499	10504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008269	CT	3	6	14357	14362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008269	CG	3	6	18571	18576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008269	CA	3	6	18730	18735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008269	GC	3	6	24652	24657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008269	GC	3	6	27227	27232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008269	CG	4	8	32911	32918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008269	CA	3	6	36570	36575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008269	GC	3	6	40557	40562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008269	CT	3	6	42613	42618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008269	GC	3	6	42991	42996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008269	GT	3	6	63439	63444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008269	AG	3	6	66035	66040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008269	CA	3	6	67441	67446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008269	GC	3	6	81948	81953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008269	CA	3	6	86097	86102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008269	GC	3	6	88120	88125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008269	CT	3	6	89684	89689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008269	TG	4	8	91312	91319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008269	GT	4	8	95464	95471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008269	CT	3	6	96848	96853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008269	AC	3	6	98235	98240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008269	CT	3	6	99215	99220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008269	AC	3	6	99938	99943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008269	TC	3	6	108286	108291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008269	CG	3	6	109451	109456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008269	CG	3	6	111034	111039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008269	CA	3	6	111085	111090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008269	GA	3	6	111095	111100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008269	GC	3	6	111172	111177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008269	CG	3	6	111191	111196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008269	GT	3	6	121510	121515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008269	CG	3	6	129978	129983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008269	AC	4	8	131439	131446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008269	AC	3	6	131471	131476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008269	AC	3	6	131918	131923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008269	AC	3	6	135754	135759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008269	GC	3	6	137130	137135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008269	CG	3	6	137159	137164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008269	CG	3	6	137465	137470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008269	GC	3	6	137682	137687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008269	GC	3	6	138844	138849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008269	GC	3	6	143747	143752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008269	CG	3	6	143790	143795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008269	GC	3	6	147041	147046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008269	CA	3	6	147118	147123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008269	GC	3	6	147434	147439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008269	CT	4	8	147636	147643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008269	CT	3	6	161281	161286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008269	TC	3	6	164537	164542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008269	CT	3	6	164579	164584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008269	AG	3	6	169783	169788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008269	GC	3	6	170139	170144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008269	CT	3	6	183500	183505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008269	GC	3	6	183560	183565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008269	AG	3	6	186469	186474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008269	AG	3	6	186490	186495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008269	CG	3	6	189913	189918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008269	GA	3	6	196833	196838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008269	CA	3	6	197513	197518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008269	CG	3	6	197953	197958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008269	CA	3	6	198022	198027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008269	TG	3	6	198051	198056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008269	GA	3	6	200059	200064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008269	TG	3	6	205869	205874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008269	CA	3	6	206003	206008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008269	CA	3	6	207840	207845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008269	TC	3	6	209671	209676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008269	CT	3	6	210705	210710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008269	CG	3	6	210839	210844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008269	CG	3	6	216305	216310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008269	CT	3	6	218181	218186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008269	AC	3	6	220302	220307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008269	GC	3	6	228794	228799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008269	GC	3	6	228810	228815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008269	GA	4	8	230300	230307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008269	GA	3	6	230471	230476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008269	CA	3	6	232181	232186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008269	CG	3	6	232706	232711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008269	TG	3	6	236467	236472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008269	GT	4	8	241272	241279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008269	CG	3	6	242927	242932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008269	GC	3	6	243095	243100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008269	TC	3	6	243260	243265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008269	TC	3	6	244850	244855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008269	CT	3	6	245837	245842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008269	CT	4	8	249266	249273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008269	GA	3	6	250435	250440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008269	CA	3	6	252172	252177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008269	CG	3	6	252279	252284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008269	TC	3	6	256820	256825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008269	CT	3	6	257924	257929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008269	CG	3	6	265526	265531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008269	CG	3	6	265542	265547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008269	CG	3	6	267716	267721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008269	GC	3	6	269076	269081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008269	CG	4	8	275576	275583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008269	CA	3	6	278601	278606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008269	CA	3	6	278749	278754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008269	CA	3	6	280360	280365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008269	CG	3	6	283837	283842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008269	CG	3	6	286738	286743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008269	GC	3	6	287894	287899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008269	CG	3	6	288452	288457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008269	CG	3	6	288476	288481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008269	GC	3	6	294312	294317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008269	CG	3	6	304386	304391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008269	GT	3	6	304537	304542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008269	AC	3	6	306087	306092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008269	GA	3	6	313734	313739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008269	GT	3	6	313826	313831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008269	TG	3	6	315153	315158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008269	CG	3	6	317952	317957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008269	GA	3	6	321699	321704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008269	GA	3	6	329779	329784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008269	CG	3	6	330531	330536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008269	CG	3	6	330789	330794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008269	CG	3	6	332813	332818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008269	CG	3	6	332902	332907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008269	TG	3	6	339001	339006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008269	CA	3	6	339262	339267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008269	GA	3	6	341841	341846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008269	CA	3	6	347231	347236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008269	TG	3	6	348957	348962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008269	CA	3	6	349864	349869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008269	CA	3	6	350972	350977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008269	CA	3	6	359741	359746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008269	GC	3	6	365603	365608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008269	CG	3	6	368089	368094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008269	AG	3	6	370811	370816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008269	GC	3	6	371111	371116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008269	GC	3	6	374055	374060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008269	CG	3	6	374113	374118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008269	CG	3	6	380399	380404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008269	GC	3	6	380453	380458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008269	GT	3	6	386233	386238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008269	AC	3	6	390597	390602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008269	CG	3	6	395033	395038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008269	CG	3	6	395055	395060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008269	CG	3	6	396404	396409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008269	AC	4	8	397878	397885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008269	AC	3	6	397910	397915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008269	AC	3	6	398357	398362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008269	CG	3	6	398682	398687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_008269	CA	3	6	398716	398721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.