MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 254

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008269	A	6	6	3578	3583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008269	C	6	6	4087	4092	0 %	0 %	0 %	100 %	111024791
3	NC_008269	G	6	6	10951	10956	0 %	0 %	100 %	0 %	111024798
4	NC_008269	T	7	7	19745	19751	0 %	100 %	0 %	0 %	111024806
5	NC_008269	C	6	6	24927	24932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_008269	C	6	6	31840	31845	0 %	0 %	0 %	100 %	111024822
7	NC_008269	G	7	7	36864	36870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008269	C	6	6	42577	42582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_008269	G	6	6	56749	56754	0 %	0 %	100 %	0 %	111024845
10	NC_008269	C	6	6	61768	61773	0 %	0 %	0 %	100 %	111024850
11	NC_008269	C	6	6	62740	62745	0 %	0 %	0 %	100 %	111024851
12	NC_008269	G	6	6	69156	69161	0 %	0 %	100 %	0 %	111024857
13	NC_008269	C	6	6	75196	75201	0 %	0 %	0 %	100 %	111024861
14	NC_008269	C	6	6	76982	76987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_008269	G	6	6	81770	81775	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008269	G	6	6	91238	91243	0 %	0 %	100 %	0 %	111024877
17	NC_008269	T	6	6	99263	99268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008269	G	6	6	99457	99462	0 %	0 %	100 %	0 %	111024888
19	NC_008269	G	6	6	108405	108410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008269	G	6	6	116235	116240	0 %	0 %	100 %	0 %	111024906
21	NC_008269	C	6	6	117699	117704	0 %	0 %	0 %	100 %	111024906
22	NC_008269	C	6	6	118426	118431	0 %	0 %	0 %	100 %	111024907
23	NC_008269	C	6	6	121328	121333	0 %	0 %	0 %	100 %	111024908
24	NC_008269	C	6	6	125561	125566	0 %	0 %	0 %	100 %	111024913
25	NC_008269	C	6	6	127288	127293	0 %	0 %	0 %	100 %	111024914
26	NC_008269	G	6	6	130495	130500	0 %	0 %	100 %	0 %	111024917
27	NC_008269	G	6	6	149802	149807	0 %	0 %	100 %	0 %	111024935
28	NC_008269	G	6	6	155137	155142	0 %	0 %	100 %	0 %	111024940
29	NC_008269	C	6	6	155929	155934	0 %	0 %	0 %	100 %	111024940
30	NC_008269	G	7	7	156402	156408	0 %	0 %	100 %	0 %	111024941
31	NC_008269	G	6	6	159514	159519	0 %	0 %	100 %	0 %	111024944
32	NC_008269	C	6	6	164276	164281	0 %	0 %	0 %	100 %	111024950
33	NC_008269	C	7	7	172975	172981	0 %	0 %	0 %	100 %	111024961
34	NC_008269	T	7	7	176113	176119	0 %	100 %	0 %	0 %	111024963
35	NC_008269	C	6	6	186997	187002	0 %	0 %	0 %	100 %	111024975
36	NC_008269	G	6	6	187385	187390	0 %	0 %	100 %	0 %	111024975
37	NC_008269	C	6	6	188146	188151	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_008269	G	6	6	192209	192214	0 %	0 %	100 %	0 %	111024978
39	NC_008269	G	6	6	195633	195638	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008269	G	6	6	208332	208337	0 %	0 %	100 %	0 %	111024991
41	NC_008269	G	6	6	210823	210828	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008269	C	6	6	220235	220240	0 %	0 %	0 %	100 %	111025003
43	NC_008269	C	6	6	223900	223905	0 %	0 %	0 %	100 %	111025010
44	NC_008269	A	6	6	228255	228260	100 %	0 %	0 %	0 %	111025017
45	NC_008269	C	6	6	231753	231758	0 %	0 %	0 %	100 %	111025021
46	NC_008269	G	6	6	239321	239326	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008269	G	6	6	241412	241417	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008269	C	6	6	244024	244029	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_008269	G	6	6	245945	245950	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008269	C	6	6	246456	246461	0 %	0 %	0 %	100 %	111025040
51	NC_008269	C	6	6	248146	248151	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_008269	C	6	6	258182	258187	0 %	0 %	0 %	100 %	111025051
53	NC_008269	G	6	6	262451	262456	0 %	0 %	100 %	0 %	111025057
54	NC_008269	C	6	6	263181	263186	0 %	0 %	0 %	100 %	111025057
55	NC_008269	C	6	6	264304	264309	0 %	0 %	0 %	100 %	111025058
56	NC_008269	C	6	6	266563	266568	0 %	0 %	0 %	100 %	111025059
57	NC_008269	C	6	6	269341	269346	0 %	0 %	0 %	100 %	111025063
58	NC_008269	G	6	6	270951	270956	0 %	0 %	100 %	0 %	111025065
59	NC_008269	A	6	6	271247	271252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008269	C	6	6	272113	272118	0 %	0 %	0 %	100 %	111025067
61	NC_008269	G	6	6	273576	273581	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008269	C	8	8	274614	274621	0 %	0 %	0 %	100 %	111025069
63	NC_008269	C	6	6	278643	278648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_008269	C	6	6	278683	278688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_008269	G	6	6	291894	291899	0 %	0 %	100 %	0 %	111025092
66	NC_008269	G	6	6	292931	292936	0 %	0 %	100 %	0 %	111025093
67	NC_008269	C	6	6	295769	295774	0 %	0 %	0 %	100 %	111025094
68	NC_008269	C	6	6	296298	296303	0 %	0 %	0 %	100 %	111025094
69	NC_008269	C	6	6	296603	296608	0 %	0 %	0 %	100 %	111025095
70	NC_008269	C	6	6	301177	301182	0 %	0 %	0 %	100 %	111025097
71	NC_008269	G	6	6	304842	304847	0 %	0 %	100 %	0 %	111025101
72	NC_008269	C	8	8	308974	308981	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_008269	C	6	6	313719	313724	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_008269	C	6	6	318446	318451	0 %	0 %	0 %	100 %	111025118
75	NC_008269	C	7	7	321105	321111	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_008269	G	6	6	329579	329584	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008269	G	6	6	335757	335762	0 %	0 %	100 %	0 %	111025138
78	NC_008269	C	6	6	340919	340924	0 %	0 %	0 %	100 %	111025146
79	NC_008269	G	6	6	343239	343244	0 %	0 %	100 %	0 %	111025147
80	NC_008269	G	6	6	349501	349506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008269	T	6	6	354801	354806	0 %	100 %	0 %	0 %	111025160
82	NC_008269	C	6	6	355734	355739	0 %	0 %	0 %	100 %	111025162
83	NC_008269	C	6	6	356259	356264	0 %	0 %	0 %	100 %	111025163
84	NC_008269	C	6	6	359346	359351	0 %	0 %	0 %	100 %	111025167
85	NC_008269	G	7	7	368256	368262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008269	G	7	7	369474	369480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008269	C	6	6	374787	374792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_008269	G	6	6	379608	379613	0 %	0 %	100 %	0 %	111025190
89	NC_008269	C	6	6	382407	382412	0 %	0 %	0 %	100 %	111025191
90	NC_008269	C	6	6	383134	383139	0 %	0 %	0 %	100 %	111025192
91	NC_008269	G	6	6	388092	388097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008269	C	6	6	391909	391914	0 %	0 %	0 %	100 %	111025199
93	NC_008269	C	6	6	392098	392103	0 %	0 %	0 %	100 %	111025199
94	NC_008269	G	6	6	396934	396939	0 %	0 %	100 %	0 %	111025204
95	NC_008269	C	7	7	401659	401665	0 %	0 %	0 %	100 %	111025211
96	NC_008269	G	6	6	412762	412767	0 %	0 %	100 %	0 %	111025221
97	NC_008269	C	6	6	417258	417263	0 %	0 %	0 %	100 %	111025225
98	NC_008269	C	6	6	421473	421478	0 %	0 %	0 %	100 %	111025229
99	NC_008269	C	6	6	424630	424635	0 %	0 %	0 %	100 %	161353733
100	NC_008269	C	6	6	436354	436359	0 %	0 %	0 %	100 %	111025247
101	NC_008269	C	6	6	438639	438644	0 %	0 %	0 %	100 %	111025249
102	NC_008269	G	6	6	443817	443822	0 %	0 %	100 %	0 %	111025253
103	NC_008269	G	6	6	466195	466200	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008269	C	6	6	468178	468183	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_008269	G	6	6	470478	470483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008269	G	7	7	470672	470678	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008269	G	6	6	470694	470699	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008269	G	6	6	470718	470723	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008269	G	6	6	476854	476859	0 %	0 %	100 %	0 %	111025286
110	NC_008269	G	6	6	484910	484915	0 %	0 %	100 %	0 %	111025294
111	NC_008269	G	6	6	503862	503867	0 %	0 %	100 %	0 %	111025317
112	NC_008269	G	6	6	504967	504972	0 %	0 %	100 %	0 %	111025318
113	NC_008269	G	6	6	510143	510148	0 %	0 %	100 %	0 %	111025322
114	NC_008269	G	6	6	510703	510708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008269	C	6	6	510713	510718	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_008269	G	6	6	512028	512033	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008269	C	6	6	517999	518004	0 %	0 %	0 %	100 %	111025329
118	NC_008269	C	6	6	518052	518057	0 %	0 %	0 %	100 %	111025329
119	NC_008269	G	6	6	524771	524776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008269	G	6	6	526932	526937	0 %	0 %	100 %	0 %	111025335
121	NC_008269	C	6	6	532213	532218	0 %	0 %	0 %	100 %	111025341
122	NC_008269	C	6	6	533232	533237	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_008269	C	6	6	545967	545972	0 %	0 %	0 %	100 %	111025354
124	NC_008269	C	6	6	554444	554449	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_008269	G	6	6	557935	557940	0 %	0 %	100 %	0 %	111025368
126	NC_008269	C	6	6	558037	558042	0 %	0 %	0 %	100 %	111025368
127	NC_008269	C	6	6	558717	558722	0 %	0 %	0 %	100 %	111025369
128	NC_008269	G	6	6	561742	561747	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008269	C	6	6	566153	566158	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_008269	G	6	6	567007	567012	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008269	C	6	6	570072	570077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
132	NC_008269	C	7	7	573865	573871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_008269	C	6	6	576488	576493	0 %	0 %	0 %	100 %	111025382
134	NC_008269	G	6	6	579194	579199	0 %	0 %	100 %	0 %	111025386
135	NC_008269	G	6	6	579309	579314	0 %	0 %	100 %	0 %	111025386
136	NC_008269	A	6	6	590048	590053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008269	C	6	6	597536	597541	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
138	NC_008269	C	6	6	605032	605037	0 %	0 %	0 %	100 %	111025408
139	NC_008269	G	6	6	616787	616792	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008269	G	6	6	622349	622354	0 %	0 %	100 %	0 %	111025427
141	NC_008269	C	6	6	641265	641270	0 %	0 %	0 %	100 %	111025443
142	NC_008269	G	6	6	644803	644808	0 %	0 %	100 %	0 %	111025447
143	NC_008269	C	6	6	661369	661374	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.