MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008269	C	6	6	4087	4092	0 %	0 %	0 %	100 %	111024791
2	NC_008269	G	6	6	10951	10956	0 %	0 %	100 %	0 %	111024798
3	NC_008269	T	7	7	19745	19751	0 %	100 %	0 %	0 %	111024806
4	NC_008269	C	6	6	31840	31845	0 %	0 %	0 %	100 %	111024822
5	NC_008269	G	6	6	56749	56754	0 %	0 %	100 %	0 %	111024845
6	NC_008269	C	6	6	61768	61773	0 %	0 %	0 %	100 %	111024850
7	NC_008269	C	6	6	62740	62745	0 %	0 %	0 %	100 %	111024851
8	NC_008269	G	6	6	69156	69161	0 %	0 %	100 %	0 %	111024857
9	NC_008269	C	6	6	75196	75201	0 %	0 %	0 %	100 %	111024861
10	NC_008269	G	6	6	91238	91243	0 %	0 %	100 %	0 %	111024877
11	NC_008269	G	6	6	99457	99462	0 %	0 %	100 %	0 %	111024888
12	NC_008269	G	6	6	116235	116240	0 %	0 %	100 %	0 %	111024906
13	NC_008269	C	6	6	117699	117704	0 %	0 %	0 %	100 %	111024906
14	NC_008269	C	6	6	118426	118431	0 %	0 %	0 %	100 %	111024907
15	NC_008269	C	6	6	121328	121333	0 %	0 %	0 %	100 %	111024908
16	NC_008269	C	6	6	125561	125566	0 %	0 %	0 %	100 %	111024913
17	NC_008269	C	6	6	127288	127293	0 %	0 %	0 %	100 %	111024914
18	NC_008269	G	6	6	130495	130500	0 %	0 %	100 %	0 %	111024917
19	NC_008269	G	6	6	149802	149807	0 %	0 %	100 %	0 %	111024935
20	NC_008269	G	6	6	155137	155142	0 %	0 %	100 %	0 %	111024940
21	NC_008269	C	6	6	155929	155934	0 %	0 %	0 %	100 %	111024940
22	NC_008269	G	7	7	156402	156408	0 %	0 %	100 %	0 %	111024941
23	NC_008269	G	6	6	159514	159519	0 %	0 %	100 %	0 %	111024944
24	NC_008269	C	6	6	164276	164281	0 %	0 %	0 %	100 %	111024950
25	NC_008269	C	7	7	172975	172981	0 %	0 %	0 %	100 %	111024961
26	NC_008269	T	7	7	176113	176119	0 %	100 %	0 %	0 %	111024963
27	NC_008269	C	6	6	186997	187002	0 %	0 %	0 %	100 %	111024975
28	NC_008269	G	6	6	187385	187390	0 %	0 %	100 %	0 %	111024975
29	NC_008269	G	6	6	192209	192214	0 %	0 %	100 %	0 %	111024978
30	NC_008269	G	6	6	208332	208337	0 %	0 %	100 %	0 %	111024991
31	NC_008269	C	6	6	220235	220240	0 %	0 %	0 %	100 %	111025003
32	NC_008269	C	6	6	223900	223905	0 %	0 %	0 %	100 %	111025010
33	NC_008269	A	6	6	228255	228260	100 %	0 %	0 %	0 %	111025017
34	NC_008269	C	6	6	231753	231758	0 %	0 %	0 %	100 %	111025021
35	NC_008269	C	6	6	246456	246461	0 %	0 %	0 %	100 %	111025040
36	NC_008269	C	6	6	258182	258187	0 %	0 %	0 %	100 %	111025051
37	NC_008269	G	6	6	262451	262456	0 %	0 %	100 %	0 %	111025057
38	NC_008269	C	6	6	263181	263186	0 %	0 %	0 %	100 %	111025057
39	NC_008269	C	6	6	264304	264309	0 %	0 %	0 %	100 %	111025058
40	NC_008269	C	6	6	266563	266568	0 %	0 %	0 %	100 %	111025059
41	NC_008269	C	6	6	269341	269346	0 %	0 %	0 %	100 %	111025063
42	NC_008269	G	6	6	270951	270956	0 %	0 %	100 %	0 %	111025065
43	NC_008269	C	6	6	272113	272118	0 %	0 %	0 %	100 %	111025067
44	NC_008269	C	8	8	274614	274621	0 %	0 %	0 %	100 %	111025069
45	NC_008269	G	6	6	291894	291899	0 %	0 %	100 %	0 %	111025092
46	NC_008269	G	6	6	292931	292936	0 %	0 %	100 %	0 %	111025093
47	NC_008269	C	6	6	295769	295774	0 %	0 %	0 %	100 %	111025094
48	NC_008269	C	6	6	296298	296303	0 %	0 %	0 %	100 %	111025094
49	NC_008269	C	6	6	296603	296608	0 %	0 %	0 %	100 %	111025095
50	NC_008269	C	6	6	301177	301182	0 %	0 %	0 %	100 %	111025097
51	NC_008269	G	6	6	304842	304847	0 %	0 %	100 %	0 %	111025101
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60	NC_008269	G	6	6	379608	379613	0 %	0 %	100 %	0 %	111025190
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62	NC_008269	C	6	6	383134	383139	0 %	0 %	0 %	100 %	111025192
63	NC_008269	C	6	6	391909	391914	0 %	0 %	0 %	100 %	111025199
64	NC_008269	C	6	6	392098	392103	0 %	0 %	0 %	100 %	111025199
65	NC_008269	G	6	6	396934	396939	0 %	0 %	100 %	0 %	111025204
66	NC_008269	C	7	7	401659	401665	0 %	0 %	0 %	100 %	111025211
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103	NC_008269	G	6	6	705274	705279	0 %	0 %	100 %	0 %	111025512
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107	NC_008269	G	6	6	715500	715505	0 %	0 %	100 %	0 %	111025525
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.