MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 21163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008268	TCGA	2	8	106	113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008268	CAAT	2	8	430	437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008268	CGCC	2	8	482	489	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_008268	CCCA	2	8	610	617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_008268	TCGC	2	8	651	658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008268	CACC	2	8	751	758	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_008268	CCCG	2	8	1767	1774	0 %	0 %	25 %	75 %	111017023
8	NC_008268	TGGA	2	8	1923	1930	25 %	25 %	50 %	0 %	111017023
9	NC_008268	ATTG	2	8	2664	2671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008268	ACCC	2	8	2693	2700	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_008268	CCGA	2	8	3785	3792	25 %	0 %	25 %	50 %	111017024
12	NC_008268	GCCG	2	8	4008	4015	0 %	0 %	50 %	50 %	111017024
13	NC_008268	CGAG	2	8	4109	4116	25 %	0 %	50 %	25 %	111017024
14	NC_008268	GGAT	2	8	4282	4289	25 %	25 %	50 %	0 %	111017025
15	NC_008268	GACA	2	8	4440	4447	50 %	0 %	25 %	25 %	111017025
16	NC_008268	AGCG	2	8	4506	4513	25 %	0 %	50 %	25 %	111017025
17	NC_008268	AGAC	2	8	4626	4633	50 %	0 %	25 %	25 %	111017025
18	NC_008268	CCGA	2	8	4751	4758	25 %	0 %	25 %	50 %	111017025
19	NC_008268	ACCG	2	8	4774	4781	25 %	0 %	25 %	50 %	111017025
20	NC_008268	CCGC	2	8	4823	4830	0 %	0 %	25 %	75 %	111017025
21	NC_008268	GTCG	2	8	6278	6285	0 %	25 %	50 %	25 %	111017026
22	NC_008268	CCGG	2	8	6539	6546	0 %	0 %	50 %	50 %	111017026
23	NC_008268	CGAC	2	8	6550	6557	25 %	0 %	25 %	50 %	111017026
24	NC_008268	CTCC	2	8	7942	7949	0 %	25 %	0 %	75 %	111017027
25	NC_008268	CTCA	2	8	8011	8018	25 %	25 %	0 %	50 %	111017027
26	NC_008268	CGGC	2	8	8284	8291	0 %	0 %	50 %	50 %	111017027
27	NC_008268	CCCG	2	8	8414	8421	0 %	0 %	25 %	75 %	111017027
28	NC_008268	ACCG	2	8	8430	8437	25 %	0 %	25 %	50 %	111017027
29	NC_008268	AGGA	2	8	8562	8569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008268	CCGA	2	8	8852	8859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008268	CGGA	2	8	9139	9146	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008268	TCGG	2	8	9324	9331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008268	GCCA	2	8	9560	9567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008268	CCCG	2	8	10175	10182	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_008268	ACCA	2	8	10631	10638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008268	GGCC	2	8	11052	11059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008268	GCAC	2	8	11422	11429	25 %	0 %	25 %	50 %	111017028
38	NC_008268	CCGG	2	8	11802	11809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008268	GTCG	2	8	12440	12447	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008268	CGGC	2	8	12466	12473	0 %	0 %	50 %	50 %	111017029
41	NC_008268	AGGC	2	8	12902	12909	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008268	CCCG	2	8	12983	12990	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_008268	GCAC	2	8	13802	13809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008268	TCTT	2	8	13887	13894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008268	CCGA	2	8	14330	14337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008268	CCGA	2	8	14560	14567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008268	CCTC	2	8	14790	14797	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_008268	GCCG	2	8	14835	14842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008268	GTTC	2	8	15032	15039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008268	GTCC	3	12	15856	15867	0 %	25 %	25 %	50 %	111017032
51	NC_008268	CCTG	2	8	16158	16165	0 %	25 %	25 %	50 %	111017032
52	NC_008268	GAGC	2	8	16683	16690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008268	CTGG	2	8	16930	16937	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008268	TCGC	2	8	17055	17062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008268	TGGC	2	8	17227	17234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008268	GCCG	2	8	17257	17264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008268	TCGG	2	8	17448	17455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008268	GACC	2	8	17614	17621	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008268	ACCT	2	8	18058	18065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008268	GACC	2	8	19093	19100	25 %	0 %	25 %	50 %	111017033
61	NC_008268	GGCT	2	8	19175	19182	0 %	25 %	50 %	25 %	111017033
62	NC_008268	CACC	2	8	19246	19253	25 %	0 %	0 %	75 %	111017033
63	NC_008268	CGCC	2	8	19986	19993	0 %	0 %	25 %	75 %	111017033
64	NC_008268	GCCG	2	8	20291	20298	0 %	0 %	50 %	50 %	111017033
65	NC_008268	CGCA	2	8	20749	20756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008268	CCTA	2	8	21029	21036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008268	AACC	2	8	21051	21058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008268	CTTC	2	8	21205	21212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008268	CCCA	2	8	21346	21353	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_008268	CGCC	2	8	21521	21528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_008268	CCGA	2	8	21594	21601	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008268	CATC	2	8	21614	21621	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008268	ACAT	2	8	22027	22034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008268	GTGA	2	8	22101	22108	25 %	25 %	50 %	0 %	111017035
75	NC_008268	CCGC	2	8	22855	22862	0 %	0 %	25 %	75 %	111017035
76	NC_008268	ACCA	2	8	22935	22942	50 %	0 %	0 %	50 %	111017035
77	NC_008268	ACCC	2	8	23378	23385	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_008268	TGCC	2	8	23930	23937	0 %	25 %	25 %	50 %	111017036
79	NC_008268	CCCA	2	8	24902	24909	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_008268	CGGC	2	8	25197	25204	0 %	0 %	50 %	50 %	111017037
81	NC_008268	CCTG	2	8	25513	25520	0 %	25 %	25 %	50 %	111017037
82	NC_008268	GCCC	2	8	26006	26013	0 %	0 %	25 %	75 %	111017038
83	NC_008268	CGAA	2	8	26303	26310	50 %	0 %	25 %	25 %	111017038
84	NC_008268	CGGT	2	8	26958	26965	0 %	25 %	50 %	25 %	111017039
85	NC_008268	TGTC	2	8	27273	27280	0 %	50 %	25 %	25 %	111017039
86	NC_008268	GGTG	2	8	27331	27338	0 %	25 %	75 %	0 %	111017040
87	NC_008268	GGCC	2	8	27516	27523	0 %	0 %	50 %	50 %	111017040
88	NC_008268	TTCC	2	8	27667	27674	0 %	50 %	0 %	50 %	111017042
89	NC_008268	CGGG	2	8	27776	27783	0 %	0 %	75 %	25 %	111017042
90	NC_008268	GTTC	2	8	28044	28051	0 %	50 %	25 %	25 %	111017043
91	NC_008268	CCAC	2	8	28319	28326	25 %	0 %	0 %	75 %	111017043
92	NC_008268	CGGA	2	8	28523	28530	25 %	0 %	50 %	25 %	111017043
93	NC_008268	CCGC	2	8	29015	29022	0 %	0 %	25 %	75 %	111017044
94	NC_008268	GGGC	2	8	29375	29382	0 %	0 %	75 %	25 %	111017044
95	NC_008268	CTTC	2	8	29824	29831	0 %	50 %	0 %	50 %	111017045
96	NC_008268	CGGC	2	8	30248	30255	0 %	0 %	50 %	50 %	111017045
97	NC_008268	CCGC	2	8	30380	30387	0 %	0 %	25 %	75 %	111017045
98	NC_008268	GTTG	2	8	30992	30999	0 %	50 %	50 %	0 %	111017046
99	NC_008268	CCGG	2	8	32443	32450	0 %	0 %	50 %	50 %	111017047
100	NC_008268	CCGC	2	8	33008	33015	0 %	0 %	25 %	75 %	111017048
101	NC_008268	ACCG	2	8	33150	33157	25 %	0 %	25 %	50 %	111017048
102	NC_008268	GCCG	2	8	33835	33842	0 %	0 %	50 %	50 %	111017049
103	NC_008268	TCCC	2	8	33939	33946	0 %	25 %	0 %	75 %	111017049
104	NC_008268	CGGT	2	8	34024	34031	0 %	25 %	50 %	25 %	111017049
105	NC_008268	TCCG	2	8	34460	34467	0 %	25 %	25 %	50 %	111017049
106	NC_008268	GTCG	2	8	34790	34797	0 %	25 %	50 %	25 %	111017049
107	NC_008268	ATCG	2	8	35256	35263	25 %	25 %	25 %	25 %	111017050
108	NC_008268	GGGC	2	8	35306	35313	0 %	0 %	75 %	25 %	111017050
109	NC_008268	GTGA	2	8	35526	35533	25 %	25 %	50 %	0 %	111017050
110	NC_008268	GGTA	2	8	35656	35663	25 %	25 %	50 %	0 %	111017050
111	NC_008268	TCCG	2	8	36386	36393	0 %	25 %	25 %	50 %	111017051
112	NC_008268	GCCG	2	8	38483	38490	0 %	0 %	50 %	50 %	111017053
113	NC_008268	GCCC	2	8	39056	39063	0 %	0 %	25 %	75 %	111017054
114	NC_008268	GTGG	2	8	39340	39347	0 %	25 %	75 %	0 %	111017055
115	NC_008268	GTTC	2	8	39380	39387	0 %	50 %	25 %	25 %	111017055
116	NC_008268	CGTA	2	8	39580	39587	25 %	25 %	25 %	25 %	111017055
117	NC_008268	GTGC	2	8	40251	40258	0 %	25 %	50 %	25 %	111017055
118	NC_008268	CCCG	2	8	41901	41908	0 %	0 %	25 %	75 %	111017057
119	NC_008268	TCCG	2	8	42001	42008	0 %	25 %	25 %	50 %	111017057
120	NC_008268	GTTC	2	8	42548	42555	0 %	50 %	25 %	25 %	111017058
121	NC_008268	CCGG	2	8	42697	42704	0 %	0 %	50 %	50 %	111017059
122	NC_008268	AGGC	2	8	42706	42713	25 %	0 %	50 %	25 %	111017059
123	NC_008268	GGTT	2	8	43814	43821	0 %	50 %	50 %	0 %	111017059
124	NC_008268	GAGC	2	8	44839	44846	25 %	0 %	50 %	25 %	111017061
125	NC_008268	CGGT	2	8	45123	45130	0 %	25 %	50 %	25 %	111017061
126	NC_008268	CCGG	2	8	45131	45138	0 %	0 %	50 %	50 %	111017061
127	NC_008268	GCGG	2	8	45283	45290	0 %	0 %	75 %	25 %	111017061
128	NC_008268	CTCG	2	8	45644	45651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008268	CGGT	2	8	45665	45672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008268	GCGG	2	8	46763	46770	0 %	0 %	75 %	25 %	111017063
131	NC_008268	TGCC	2	8	47067	47074	0 %	25 %	25 %	50 %	111017063
132	NC_008268	ATCG	2	8	47528	47535	25 %	25 %	25 %	25 %	111017063
133	NC_008268	GCTC	2	8	47562	47569	0 %	25 %	25 %	50 %	111017064
134	NC_008268	CAGG	2	8	47586	47593	25 %	0 %	50 %	25 %	111017064
135	NC_008268	GTTG	2	8	48523	48530	0 %	50 %	50 %	0 %	111017065
136	NC_008268	CCGG	2	8	49154	49161	0 %	0 %	50 %	50 %	111017066
137	NC_008268	CTCG	2	8	49297	49304	0 %	25 %	25 %	50 %	111017066
138	NC_008268	GATC	2	8	49437	49444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008268	CGTC	2	8	49524	49531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008268	CGAC	2	8	49662	49669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008268	GCGA	2	8	49846	49853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008268	GGTC	2	8	50088	50095	0 %	25 %	50 %	25 %	111017067
143	NC_008268	ACCG	2	8	50218	50225	25 %	0 %	25 %	50 %	111017067
144	NC_008268	CGGC	2	8	50798	50805	0 %	0 %	50 %	50 %	111017067
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146	NC_008268	GCCC	2	8	51693	51700	0 %	0 %	25 %	75 %	111017067
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