MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 18987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008268	CCCG	2	8	1767	1774	0 %	0 %	25 %	75 %	111017023
2	NC_008268	TGGA	2	8	1923	1930	25 %	25 %	50 %	0 %	111017023
3	NC_008268	CCGA	2	8	3785	3792	25 %	0 %	25 %	50 %	111017024
4	NC_008268	GCCG	2	8	4008	4015	0 %	0 %	50 %	50 %	111017024
5	NC_008268	CGAG	2	8	4109	4116	25 %	0 %	50 %	25 %	111017024
6	NC_008268	GGAT	2	8	4282	4289	25 %	25 %	50 %	0 %	111017025
7	NC_008268	GACA	2	8	4440	4447	50 %	0 %	25 %	25 %	111017025
8	NC_008268	AGCG	2	8	4506	4513	25 %	0 %	50 %	25 %	111017025
9	NC_008268	AGAC	2	8	4626	4633	50 %	0 %	25 %	25 %	111017025
10	NC_008268	CCGA	2	8	4751	4758	25 %	0 %	25 %	50 %	111017025
11	NC_008268	ACCG	2	8	4774	4781	25 %	0 %	25 %	50 %	111017025
12	NC_008268	CCGC	2	8	4823	4830	0 %	0 %	25 %	75 %	111017025
13	NC_008268	GTCG	2	8	6278	6285	0 %	25 %	50 %	25 %	111017026
14	NC_008268	CCGG	2	8	6539	6546	0 %	0 %	50 %	50 %	111017026
15	NC_008268	CGAC	2	8	6550	6557	25 %	0 %	25 %	50 %	111017026
16	NC_008268	CTCC	2	8	7942	7949	0 %	25 %	0 %	75 %	111017027
17	NC_008268	CTCA	2	8	8011	8018	25 %	25 %	0 %	50 %	111017027
18	NC_008268	CGGC	2	8	8284	8291	0 %	0 %	50 %	50 %	111017027
19	NC_008268	CCCG	2	8	8414	8421	0 %	0 %	25 %	75 %	111017027
20	NC_008268	ACCG	2	8	8430	8437	25 %	0 %	25 %	50 %	111017027
21	NC_008268	GCAC	2	8	11422	11429	25 %	0 %	25 %	50 %	111017028
22	NC_008268	CGGC	2	8	12466	12473	0 %	0 %	50 %	50 %	111017029
23	NC_008268	GTCC	3	12	15856	15867	0 %	25 %	25 %	50 %	111017032
24	NC_008268	CCTG	2	8	16158	16165	0 %	25 %	25 %	50 %	111017032
25	NC_008268	GACC	2	8	19093	19100	25 %	0 %	25 %	50 %	111017033
26	NC_008268	GGCT	2	8	19175	19182	0 %	25 %	50 %	25 %	111017033
27	NC_008268	CACC	2	8	19246	19253	25 %	0 %	0 %	75 %	111017033
28	NC_008268	CGCC	2	8	19986	19993	0 %	0 %	25 %	75 %	111017033
29	NC_008268	GCCG	2	8	20291	20298	0 %	0 %	50 %	50 %	111017033
30	NC_008268	GTGA	2	8	22101	22108	25 %	25 %	50 %	0 %	111017035
31	NC_008268	CCGC	2	8	22855	22862	0 %	0 %	25 %	75 %	111017035
32	NC_008268	ACCA	2	8	22935	22942	50 %	0 %	0 %	50 %	111017035
33	NC_008268	TGCC	2	8	23930	23937	0 %	25 %	25 %	50 %	111017036
34	NC_008268	CGGC	2	8	25197	25204	0 %	0 %	50 %	50 %	111017037
35	NC_008268	CCTG	2	8	25513	25520	0 %	25 %	25 %	50 %	111017037
36	NC_008268	GCCC	2	8	26006	26013	0 %	0 %	25 %	75 %	111017038
37	NC_008268	CGAA	2	8	26303	26310	50 %	0 %	25 %	25 %	111017038
38	NC_008268	CGGT	2	8	26958	26965	0 %	25 %	50 %	25 %	111017039
39	NC_008268	TGTC	2	8	27273	27280	0 %	50 %	25 %	25 %	111017039
40	NC_008268	GGTG	2	8	27331	27338	0 %	25 %	75 %	0 %	111017040
41	NC_008268	GGCC	2	8	27516	27523	0 %	0 %	50 %	50 %	111017040
42	NC_008268	TTCC	2	8	27667	27674	0 %	50 %	0 %	50 %	111017042
43	NC_008268	CGGG	2	8	27776	27783	0 %	0 %	75 %	25 %	111017042
44	NC_008268	GTTC	2	8	28044	28051	0 %	50 %	25 %	25 %	111017043
45	NC_008268	CCAC	2	8	28319	28326	25 %	0 %	0 %	75 %	111017043
46	NC_008268	CGGA	2	8	28523	28530	25 %	0 %	50 %	25 %	111017043
47	NC_008268	CCGC	2	8	29015	29022	0 %	0 %	25 %	75 %	111017044
48	NC_008268	GGGC	2	8	29375	29382	0 %	0 %	75 %	25 %	111017044
49	NC_008268	CTTC	2	8	29824	29831	0 %	50 %	0 %	50 %	111017045
50	NC_008268	CGGC	2	8	30248	30255	0 %	0 %	50 %	50 %	111017045
51	NC_008268	CCGC	2	8	30380	30387	0 %	0 %	25 %	75 %	111017045
52	NC_008268	GTTG	2	8	30992	30999	0 %	50 %	50 %	0 %	111017046
53	NC_008268	CCGG	2	8	32443	32450	0 %	0 %	50 %	50 %	111017047
54	NC_008268	CCGC	2	8	33008	33015	0 %	0 %	25 %	75 %	111017048
55	NC_008268	ACCG	2	8	33150	33157	25 %	0 %	25 %	50 %	111017048
56	NC_008268	GCCG	2	8	33835	33842	0 %	0 %	50 %	50 %	111017049
57	NC_008268	TCCC	2	8	33939	33946	0 %	25 %	0 %	75 %	111017049
58	NC_008268	CGGT	2	8	34024	34031	0 %	25 %	50 %	25 %	111017049
59	NC_008268	TCCG	2	8	34460	34467	0 %	25 %	25 %	50 %	111017049
60	NC_008268	GTCG	2	8	34790	34797	0 %	25 %	50 %	25 %	111017049
61	NC_008268	ATCG	2	8	35256	35263	25 %	25 %	25 %	25 %	111017050
62	NC_008268	GGGC	2	8	35306	35313	0 %	0 %	75 %	25 %	111017050
63	NC_008268	GTGA	2	8	35526	35533	25 %	25 %	50 %	0 %	111017050
64	NC_008268	GGTA	2	8	35656	35663	25 %	25 %	50 %	0 %	111017050
65	NC_008268	TCCG	2	8	36386	36393	0 %	25 %	25 %	50 %	111017051
66	NC_008268	GCCG	2	8	38483	38490	0 %	0 %	50 %	50 %	111017053
67	NC_008268	GCCC	2	8	39056	39063	0 %	0 %	25 %	75 %	111017054
68	NC_008268	GTGG	2	8	39340	39347	0 %	25 %	75 %	0 %	111017055
69	NC_008268	GTTC	2	8	39380	39387	0 %	50 %	25 %	25 %	111017055
70	NC_008268	CGTA	2	8	39580	39587	25 %	25 %	25 %	25 %	111017055
71	NC_008268	GTGC	2	8	40251	40258	0 %	25 %	50 %	25 %	111017055
72	NC_008268	CCCG	2	8	41901	41908	0 %	0 %	25 %	75 %	111017057
73	NC_008268	TCCG	2	8	42001	42008	0 %	25 %	25 %	50 %	111017057
74	NC_008268	GTTC	2	8	42548	42555	0 %	50 %	25 %	25 %	111017058
75	NC_008268	CCGG	2	8	42697	42704	0 %	0 %	50 %	50 %	111017059
76	NC_008268	AGGC	2	8	42706	42713	25 %	0 %	50 %	25 %	111017059
77	NC_008268	GGTT	2	8	43814	43821	0 %	50 %	50 %	0 %	111017059
78	NC_008268	GAGC	2	8	44839	44846	25 %	0 %	50 %	25 %	111017061
79	NC_008268	CGGT	2	8	45123	45130	0 %	25 %	50 %	25 %	111017061
80	NC_008268	CCGG	2	8	45131	45138	0 %	0 %	50 %	50 %	111017061
81	NC_008268	GCGG	2	8	45283	45290	0 %	0 %	75 %	25 %	111017061
82	NC_008268	GCGG	2	8	46763	46770	0 %	0 %	75 %	25 %	111017063
83	NC_008268	TGCC	2	8	47067	47074	0 %	25 %	25 %	50 %	111017063
84	NC_008268	ATCG	2	8	47528	47535	25 %	25 %	25 %	25 %	111017063
85	NC_008268	GCTC	2	8	47562	47569	0 %	25 %	25 %	50 %	111017064
86	NC_008268	CAGG	2	8	47586	47593	25 %	0 %	50 %	25 %	111017064
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88	NC_008268	CCGG	2	8	49154	49161	0 %	0 %	50 %	50 %	111017066
89	NC_008268	CTCG	2	8	49297	49304	0 %	25 %	25 %	50 %	111017066
90	NC_008268	GGTC	2	8	50088	50095	0 %	25 %	50 %	25 %	111017067
91	NC_008268	ACCG	2	8	50218	50225	25 %	0 %	25 %	50 %	111017067
92	NC_008268	CGGC	2	8	50798	50805	0 %	0 %	50 %	50 %	111017067
93	NC_008268	GGGC	2	8	50937	50944	0 %	0 %	75 %	25 %	111017067
94	NC_008268	GCCC	2	8	51693	51700	0 %	0 %	25 %	75 %	111017067
95	NC_008268	GTTC	2	8	52356	52363	0 %	50 %	25 %	25 %	111017067
96	NC_008268	GGAG	2	8	52482	52489	25 %	0 %	75 %	0 %	111017067
97	NC_008268	TCGT	2	8	53024	53031	0 %	50 %	25 %	25 %	111017067
98	NC_008268	CCAC	2	8	53319	53326	25 %	0 %	0 %	75 %	111017068
99	NC_008268	CGGT	2	8	53633	53640	0 %	25 %	50 %	25 %	111017068
100	NC_008268	GTTC	2	8	54246	54253	0 %	50 %	25 %	25 %	111017069
101	NC_008268	TGAG	2	8	55360	55367	25 %	25 %	50 %	0 %	111017071
102	NC_008268	CGCC	2	8	55682	55689	0 %	0 %	25 %	75 %	111017071
103	NC_008268	AGGC	2	8	55710	55717	25 %	0 %	50 %	25 %	111017071
104	NC_008268	TCGA	2	8	56361	56368	25 %	25 %	25 %	25 %	111017071
105	NC_008268	CGTG	2	8	56384	56391	0 %	25 %	50 %	25 %	111017071
106	NC_008268	CCGC	2	8	56940	56947	0 %	0 %	25 %	75 %	111017072
107	NC_008268	GGCT	2	8	57138	57145	0 %	25 %	50 %	25 %	111017072
108	NC_008268	GCCG	2	8	57220	57227	0 %	0 %	50 %	50 %	111017072
109	NC_008268	CCAC	2	8	57333	57340	25 %	0 %	0 %	75 %	111017072
110	NC_008268	GGCC	2	8	57469	57476	0 %	0 %	50 %	50 %	111017072
111	NC_008268	GCCG	2	8	57608	57615	0 %	0 %	50 %	50 %	111017072
112	NC_008268	CCGG	2	8	57664	57671	0 %	0 %	50 %	50 %	111017072
113	NC_008268	TCCG	2	8	57785	57792	0 %	25 %	25 %	50 %	111017072
114	NC_008268	CGAT	2	8	58008	58015	25 %	25 %	25 %	25 %	111017073
115	NC_008268	CCGA	2	8	58578	58585	25 %	0 %	25 %	50 %	111017073
116	NC_008268	TCCA	2	8	59198	59205	25 %	25 %	0 %	50 %	111017074
117	NC_008268	CGCA	2	8	59435	59442	25 %	0 %	25 %	50 %	111017075
118	NC_008268	GGTC	2	8	59486	59493	0 %	25 %	50 %	25 %	111017075
119	NC_008268	GCAG	2	8	60881	60888	25 %	0 %	50 %	25 %	111017077
120	NC_008268	CCGA	2	8	61110	61117	25 %	0 %	25 %	50 %	111017077
121	NC_008268	GCCT	2	8	61716	61723	0 %	25 %	25 %	50 %	111017077
122	NC_008268	GACC	2	8	61991	61998	25 %	0 %	25 %	50 %	111017077
123	NC_008268	GGTC	2	8	62050	62057	0 %	25 %	50 %	25 %	111017077
124	NC_008268	CCGA	2	8	62476	62483	25 %	0 %	25 %	50 %	111017078
125	NC_008268	CTCG	2	8	63072	63079	0 %	25 %	25 %	50 %	111017078
126	NC_008268	TCGT	2	8	63210	63217	0 %	50 %	25 %	25 %	111017078
127	NC_008268	CGGG	2	8	63846	63853	0 %	0 %	75 %	25 %	111017079
128	NC_008268	GAGG	2	8	63887	63894	25 %	0 %	75 %	0 %	111017079
129	NC_008268	GCTC	2	8	64123	64130	0 %	25 %	25 %	50 %	111017079
130	NC_008268	CGTG	2	8	64267	64274	0 %	25 %	50 %	25 %	111017079
131	NC_008268	GGGC	2	8	64330	64337	0 %	0 %	75 %	25 %	111017079
132	NC_008268	TCGC	2	8	64751	64758	0 %	25 %	25 %	50 %	111017080
133	NC_008268	GGAG	2	8	64796	64803	25 %	0 %	75 %	0 %	111017080
134	NC_008268	ATCG	2	8	65322	65329	25 %	25 %	25 %	25 %	111017080
135	NC_008268	GCCG	2	8	65516	65523	0 %	0 %	50 %	50 %	111017080
136	NC_008268	GACC	2	8	65979	65986	25 %	0 %	25 %	50 %	111017081
137	NC_008268	CGAC	2	8	66170	66177	25 %	0 %	25 %	50 %	111017081
138	NC_008268	GCCG	2	8	66229	66236	0 %	0 %	50 %	50 %	111017081
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