MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 299

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008268	C	7	7	3455	3461	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_008268	G	6	6	11764	11769	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008268	C	6	6	13351	13356	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_008268	G	6	6	13372	13377	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008268	C	6	6	14821	14826	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_008268	C	7	7	14947	14953	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_008268	G	6	6	18108	18113	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008268	C	6	6	21527	21532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_008268	C	6	6	24515	24520	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_008268	G	6	6	48471	48476	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008268	G	6	6	120182	120187	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008268	G	6	6	139824	139829	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008268	G	6	6	139850	139855	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008268	G	6	6	240564	240569	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008268	C	6	6	269372	269377	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_008268	C	6	6	322515	322520	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_008268	C	6	6	326232	326237	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_008268	C	6	6	326299	326304	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_008268	C	6	6	340389	340394	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_008268	T	6	6	349433	349438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008268	C	7	7	369339	369345	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_008268	G	6	6	381452	381457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008268	G	6	6	381825	381830	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008268	C	6	6	381833	381838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_008268	G	6	6	383148	383153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008268	G	6	6	406888	406893	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008268	G	6	6	415136	415141	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008268	C	6	6	427807	427812	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_008268	C	6	6	496602	496607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_008268	C	6	6	523311	523316	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_008268	G	6	6	539884	539889	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008268	C	6	6	540538	540543	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_008268	G	7	7	581225	581231	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008268	G	6	6	601218	601223	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008268	C	6	6	627139	627144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_008268	C	6	6	630409	630414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_008268	C	7	7	650718	650724	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_008268	A	6	6	684114	684119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008268	C	6	6	739335	739340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_008268	G	6	6	740650	740655	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008268	A	6	6	751738	751743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008268	A	7	7	761184	761190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008268	A	6	6	761469	761474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008268	G	6	6	765773	765778	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008268	C	6	6	766685	766690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_008268	A	6	6	777443	777448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008268	C	6	6	791589	791594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_008268	C	7	7	799302	799308	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_008268	C	6	6	803864	803869	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_008268	C	6	6	848185	848190	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_008268	G	7	7	933634	933640	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008268	G	6	6	940192	940197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008268	C	6	6	950012	950017	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_008268	G	6	6	952119	952124	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008268	C	6	6	971749	971754	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_008268	C	6	6	999208	999213	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_008268	C	6	6	1000497	1000502	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_008268	A	6	6	1001293	1001298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008268	G	6	6	1002014	1002019	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008268	C	6	6	1003112	1003117	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_008268	C	6	6	1042273	1042278	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_008268	T	6	6	1064937	1064942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008268	G	6	6	1169425	1169430	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008268	C	6	6	1191750	1191755	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_008268	C	7	7	1204477	1204483	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_008268	A	7	7	1214695	1214701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008268	C	6	6	1263310	1263315	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_008268	C	6	6	1296049	1296054	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_008268	A	7	7	1384091	1384097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008268	G	6	6	1420425	1420430	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008268	C	6	6	1449210	1449215	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_008268	T	6	6	1449403	1449408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008268	G	6	6	1508352	1508357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008268	G	6	6	1509512	1509517	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008268	C	6	6	1509621	1509626	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_008268	C	6	6	1544450	1544455	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_008268	G	6	6	1544465	1544470	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008268	C	6	6	1545934	1545939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_008268	C	6	6	1547223	1547228	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_008268	A	6	6	1548000	1548005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008268	G	6	6	1548721	1548726	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008268	C	6	6	1549827	1549832	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_008268	A	6	6	1564565	1564570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008268	G	6	6	1615630	1615635	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008268	C	6	6	1654772	1654777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_008268	A	6	6	1674971	1674976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008268	C	6	6	1674981	1674986	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_008268	G	6	6	1691793	1691798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008268	A	7	7	1791295	1791301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008268	C	6	6	1796089	1796094	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_008268	G	6	6	1860793	1860798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008268	C	6	6	1903764	1903769	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_008268	A	7	7	1970910	1970916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008268	C	6	6	2107501	2107506	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_008268	G	6	6	2142154	2142159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008268	A	6	6	2143034	2143039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008268	C	6	6	2197502	2197507	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_008268	G	6	6	2358854	2358859	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008268	C	7	7	2370201	2370207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_008268	C	6	6	2372822	2372827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_008268	C	6	6	2384224	2384229	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_008268	G	6	6	2388714	2388719	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008268	C	6	6	2417065	2417070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_008268	C	6	6	2490349	2490354	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_008268	G	6	6	2578335	2578340	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008268	G	7	7	2582778	2582784	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008268	C	6	6	2598433	2598438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_008268	C	6	6	2638984	2638989	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_008268	C	8	8	2664975	2664982	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_008268	C	6	6	2817739	2817744	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_008268	C	6	6	2823205	2823210	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_008268	G	6	6	2829382	2829387	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008268	C	6	6	2867220	2867225	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_008268	G	6	6	2929579	2929584	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008268	T	6	6	2989926	2989931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008268	G	6	6	2993620	2993625	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008268	A	6	6	2993979	2993984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008268	G	6	6	3116112	3116117	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008268	G	6	6	3129674	3129679	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008268	G	6	6	3132405	3132410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008268	A	6	6	3191397	3191402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008268	A	6	6	3191404	3191409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008268	C	8	8	3192499	3192506	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_008268	G	6	6	3207504	3207509	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008268	C	6	6	3235836	3235841	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_008268	C	7	7	3239868	3239874	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_008268	C	6	6	3261966	3261971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_008268	G	6	6	3262055	3262060	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008268	A	6	6	3267132	3267137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008268	G	6	6	3292348	3292353	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008268	T	6	6	3301435	3301440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008268	C	6	6	3334892	3334897	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_008268	C	7	7	3381347	3381353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134	NC_008268	C	6	6	3394406	3394411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_008268	G	6	6	3400330	3400335	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008268	C	6	6	3416413	3416418	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_008268	G	6	6	3431152	3431157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008268	G	6	6	3450163	3450168	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008268	C	6	6	3455395	3455400	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_008268	A	6	6	3455502	3455507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008268	G	6	6	3459514	3459519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008268	C	6	6	3479175	3479180	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
143	NC_008268	G	6	6	3499549	3499554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008268	G	6	6	3551915	3551920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008268	C	6	6	3568816	3568821	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
146	NC_008268	G	6	6	3590238	3590243	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008268	G	6	6	3600042	3600047	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008268	T	6	6	3604422	3604427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008268	C	6	6	3607436	3607441	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.