MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium phage phiSM101 chromosome

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008265	GCTATA	2	12	143	154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008265	ATTTAA	2	12	529	540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008265	TTCTCT	2	12	1134	1145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008265	AATTTA	2	12	1398	1409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008265	ATTTGC	2	12	2974	2985	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008265	AGCTTC	2	12	7041	7052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110804068
7	NC_008265	GCCATA	2	12	8800	8811	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110804068
8	NC_008265	TCCTCT	2	12	9894	9905	0 %	50 %	0 %	50 %	110804055
9	NC_008265	TAAATA	2	12	10172	10183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804055
10	NC_008265	TTTACT	2	12	10256	10267	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	110804026
11	NC_008265	TATCAT	2	12	10577	10588	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	110804026
12	NC_008265	TTCATC	2	12	10638	10649	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	110804026
13	NC_008265	ATTTGA	2	12	16267	16278	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	110804033
14	NC_008265	ATCTAC	2	12	17917	17928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804034
15	NC_008265	ACTTCT	2	12	18075	18086	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	110804034
16	NC_008265	TAAAAA	2	12	19462	19473	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008265	TTTATT	2	12	20651	20662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	110804065
18	NC_008265	ATCAAA	2	12	22614	22625	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	110804066
19	NC_008265	TTTTTC	2	12	22695	22706	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	110804066
20	NC_008265	CTCTTT	2	12	23018	23029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804054
21	NC_008265	TCATTT	2	12	23239	23250	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	110804029
22	NC_008265	CTACTT	2	12	24238	24249	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	110804073
23	NC_008265	ATTTCT	2	12	24280	24291	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	110804073
24	NC_008265	TCTATA	2	12	28109	28120	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	110804037
25	NC_008265	AATTTA	2	12	29326	29337	50 %	50 %	0 %	0 %	110804060
26	NC_008265	AAATAA	2	12	32707	32718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	110804059
27	NC_008265	TGTATA	2	12	33564	33575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	110804057
28	NC_008265	TTACTT	2	12	34071	34082	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	110804053
29	NC_008265	AGCTAT	2	12	35900	35911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008265	TAAATT	2	12	36880	36891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008265	TTGAAT	2	12	37552	37563	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008265	TTCCAT	2	12	37756	37767	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008265	TGTTTT	2	12	37910	37921	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.