MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium phage phiSM101 chromosome

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008265	TACTT	2	10	868	877	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008265	ATTTT	2	10	5358	5367	20 %	80 %	0 %	0 %	110804063
3	NC_008265	TAAAG	2	10	5851	5860	60 %	20 %	20 %	0 %	110804045
4	NC_008265	CCAGT	2	10	6394	6403	20 %	20 %	20 %	40 %	110804068
5	NC_008265	CATAA	2	10	10626	10635	60 %	20 %	0 %	20 %	110804026
6	NC_008265	CTTTT	2	10	11539	11548	0 %	80 %	0 %	20 %	110804042
7	NC_008265	CTTCT	2	10	12338	12347	0 %	60 %	0 %	40 %	110804032
8	NC_008265	GTAAT	2	10	13181	13190	40 %	40 %	20 %	0 %	110804052
9	NC_008265	TTTAA	2	10	13375	13384	40 %	60 %	0 %	0 %	110804052
10	NC_008265	TTTTC	2	10	13789	13798	0 %	80 %	0 %	20 %	110804052
11	NC_008265	CTTTT	2	10	14016	14025	0 %	80 %	0 %	20 %	110804048
12	NC_008265	CTCTT	2	10	16641	16650	0 %	60 %	0 %	40 %	110804033
13	NC_008265	TAAAT	2	10	17131	17140	60 %	40 %	0 %	0 %	110804033
14	NC_008265	TTTTA	2	10	18260	18269	20 %	80 %	0 %	0 %	110804034
15	NC_008265	TTCTC	2	10	19004	19013	0 %	60 %	0 %	40 %	110804039
16	NC_008265	TCTAT	2	10	20088	20097	20 %	60 %	0 %	20 %	110804038
17	NC_008265	TCTAT	2	10	20280	20289	20 %	60 %	0 %	20 %	110804038
18	NC_008265	TCACT	2	10	22247	22256	20 %	40 %	0 %	40 %	110804066
19	NC_008265	TTTCT	2	10	22347	22356	0 %	80 %	0 %	20 %	110804066
20	NC_008265	TTCTT	2	10	22542	22551	0 %	80 %	0 %	20 %	110804066
21	NC_008265	TCTTT	2	10	24228	24237	0 %	80 %	0 %	20 %	110804073
22	NC_008265	TATTC	2	10	24355	24364	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008265	GTTAA	2	10	24384	24393	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008265	TAATT	2	10	25348	25357	40 %	60 %	0 %	0 %	110804043
25	NC_008265	TAAAA	2	10	26113	26122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008265	TAAAT	2	10	26681	26690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008265	ATTGT	2	10	26757	26766	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008265	ATAAA	2	10	26854	26863	80 %	20 %	0 %	0 %	110804036
29	NC_008265	TTAAC	2	10	26905	26914	40 %	40 %	0 %	20 %	110804036
30	NC_008265	ATTTT	2	10	27392	27401	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008265	TCTTT	2	10	28333	28342	0 %	80 %	0 %	20 %	110804037
32	NC_008265	GATTT	2	10	28480	28489	20 %	60 %	20 %	0 %	110804037
33	NC_008265	AATAA	2	10	30099	30108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008265	TAAGG	2	10	30125	30134	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008265	TATCT	2	10	30160	30169	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008265	GAAAT	2	10	31001	31010	60 %	20 %	20 %	0 %	110804024
37	NC_008265	TATTT	2	10	31377	31386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008265	AATTA	2	10	32440	32449	60 %	40 %	0 %	0 %	110804021
39	NC_008265	TAATA	2	10	32820	32829	60 %	40 %	0 %	0 %	110804059
40	NC_008265	ATTTT	2	10	33239	33248	20 %	80 %	0 %	0 %	110804057
41	NC_008265	ATTTA	2	10	33312	33321	40 %	60 %	0 %	0 %	110804057
42	NC_008265	TTTCC	2	10	33919	33928	0 %	60 %	0 %	40 %	110804057
43	NC_008265	TTCTT	2	10	34033	34042	0 %	80 %	0 %	20 %	110804053
44	NC_008265	CTTTC	2	10	35617	35626	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_008265	AATAA	2	10	35830	35839	80 %	20 %	0 %	0 %	110804071
46	NC_008265	AAAAT	2	10	37643	37652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008265	ATTTT	2	10	37953	37962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.