MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium phage phiSM101 chromosome

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008265	ATTTT	2	10	5358	5367	20 %	80 %	0 %	0 %	110804063
2	NC_008265	TAAAG	2	10	5851	5860	60 %	20 %	20 %	0 %	110804045
3	NC_008265	CCAGT	2	10	6394	6403	20 %	20 %	20 %	40 %	110804068
4	NC_008265	CATAA	2	10	10626	10635	60 %	20 %	0 %	20 %	110804026
5	NC_008265	CTTTT	2	10	11539	11548	0 %	80 %	0 %	20 %	110804042
6	NC_008265	CTTCT	2	10	12338	12347	0 %	60 %	0 %	40 %	110804032
7	NC_008265	GTAAT	2	10	13181	13190	40 %	40 %	20 %	0 %	110804052
8	NC_008265	TTTAA	2	10	13375	13384	40 %	60 %	0 %	0 %	110804052
9	NC_008265	TTTTC	2	10	13789	13798	0 %	80 %	0 %	20 %	110804052
10	NC_008265	CTTTT	2	10	14016	14025	0 %	80 %	0 %	20 %	110804048
11	NC_008265	CTCTT	2	10	16641	16650	0 %	60 %	0 %	40 %	110804033
12	NC_008265	TAAAT	2	10	17131	17140	60 %	40 %	0 %	0 %	110804033
13	NC_008265	TTTTA	2	10	18260	18269	20 %	80 %	0 %	0 %	110804034
14	NC_008265	TTCTC	2	10	19004	19013	0 %	60 %	0 %	40 %	110804039
15	NC_008265	TCTAT	2	10	20088	20097	20 %	60 %	0 %	20 %	110804038
16	NC_008265	TCTAT	2	10	20280	20289	20 %	60 %	0 %	20 %	110804038
17	NC_008265	TCACT	2	10	22247	22256	20 %	40 %	0 %	40 %	110804066
18	NC_008265	TTTCT	2	10	22347	22356	0 %	80 %	0 %	20 %	110804066
19	NC_008265	TTCTT	2	10	22542	22551	0 %	80 %	0 %	20 %	110804066
20	NC_008265	TCTTT	2	10	24228	24237	0 %	80 %	0 %	20 %	110804073
21	NC_008265	TAATT	2	10	25348	25357	40 %	60 %	0 %	0 %	110804043
22	NC_008265	ATAAA	2	10	26854	26863	80 %	20 %	0 %	0 %	110804036
23	NC_008265	TTAAC	2	10	26905	26914	40 %	40 %	0 %	20 %	110804036
24	NC_008265	TCTTT	2	10	28333	28342	0 %	80 %	0 %	20 %	110804037
25	NC_008265	GATTT	2	10	28480	28489	20 %	60 %	20 %	0 %	110804037
26	NC_008265	GAAAT	2	10	31001	31010	60 %	20 %	20 %	0 %	110804024
27	NC_008265	AATTA	2	10	32440	32449	60 %	40 %	0 %	0 %	110804021
28	NC_008265	TAATA	2	10	32820	32829	60 %	40 %	0 %	0 %	110804059
29	NC_008265	ATTTT	2	10	33239	33248	20 %	80 %	0 %	0 %	110804057
30	NC_008265	ATTTA	2	10	33312	33321	40 %	60 %	0 %	0 %	110804057
31	NC_008265	TTTCC	2	10	33919	33928	0 %	60 %	0 %	40 %	110804057
32	NC_008265	TTCTT	2	10	34033	34042	0 %	80 %	0 %	20 %	110804053
33	NC_008265	AATAA	2	10	35830	35839	80 %	20 %	0 %	0 %	110804071

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.