MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium phage phiSM101 chromosome

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008265	TGCT	2	8	58	65	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008265	TTAC	2	8	221	228	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008265	CATT	2	8	521	528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008265	ATTT	2	8	898	905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008265	TTTA	2	8	916	923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008265	TTAC	2	8	1898	1905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008265	CTAT	2	8	2153	2160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008265	ATTT	2	8	2779	2786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008265	CTTA	2	8	3235	3242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008265	TAGA	2	8	3642	3649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008265	CTTT	2	8	3791	3798	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008265	ATCC	2	8	3900	3907	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008265	CTAT	2	8	3980	3987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008265	AAGT	2	8	3989	3996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008265	TCCA	2	8	4161	4168	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008265	ATCT	2	8	4786	4793	25 %	50 %	0 %	25 %	110804056
17	NC_008265	ATTG	2	8	4797	4804	25 %	50 %	25 %	0 %	110804056
18	NC_008265	ACTT	2	8	4927	4934	25 %	50 %	0 %	25 %	110804056
19	NC_008265	TGTT	2	8	5258	5265	0 %	75 %	25 %	0 %	110804063
20	NC_008265	TCCT	2	8	5525	5532	0 %	50 %	0 %	50 %	110804045
21	NC_008265	TATC	2	8	5629	5636	25 %	50 %	0 %	25 %	110804045
22	NC_008265	TAAC	2	8	5932	5939	50 %	25 %	0 %	25 %	110804045
23	NC_008265	TTTA	2	8	6020	6027	25 %	75 %	0 %	0 %	110804045
24	NC_008265	TTAC	2	8	6142	6149	25 %	50 %	0 %	25 %	110804068
25	NC_008265	ATTT	2	8	6758	6765	25 %	75 %	0 %	0 %	110804068
26	NC_008265	ATTC	2	8	7473	7480	25 %	50 %	0 %	25 %	110804068
27	NC_008265	AAAT	2	8	7644	7651	75 %	25 %	0 %	0 %	110804068
28	NC_008265	AACC	2	8	8260	8267	50 %	0 %	0 %	50 %	110804068
29	NC_008265	AGTT	2	8	8453	8460	25 %	50 %	25 %	0 %	110804068
30	NC_008265	TTTA	2	8	9150	9157	25 %	75 %	0 %	0 %	110804068
31	NC_008265	CTTC	2	8	9656	9663	0 %	50 %	0 %	50 %	110804072
32	NC_008265	ACTA	2	8	9687	9694	50 %	25 %	0 %	25 %	110804072
33	NC_008265	ACTA	2	8	9965	9972	50 %	25 %	0 %	25 %	110804055
34	NC_008265	CTTT	2	8	10232	10239	0 %	75 %	0 %	25 %	110804055
35	NC_008265	ACAT	2	8	10380	10387	50 %	25 %	0 %	25 %	110804026
36	NC_008265	CTTG	2	8	10423	10430	0 %	50 %	25 %	25 %	110804026
37	NC_008265	TTGT	2	8	10691	10698	0 %	75 %	25 %	0 %	110804026
38	NC_008265	CTTT	2	8	10897	10904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008265	TAAA	2	8	11237	11244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008265	ATTT	2	8	11256	11263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008265	CTTA	2	8	11462	11469	25 %	50 %	0 %	25 %	110804042
42	NC_008265	ATTT	2	8	11685	11692	25 %	75 %	0 %	0 %	110804035
43	NC_008265	AATT	2	8	12169	12176	50 %	50 %	0 %	0 %	110804032
44	NC_008265	ATTC	2	8	12520	12527	25 %	50 %	0 %	25 %	110804046
45	NC_008265	ATTT	2	8	13199	13206	25 %	75 %	0 %	0 %	110804052
46	NC_008265	ATTT	2	8	13629	13636	25 %	75 %	0 %	0 %	110804052
47	NC_008265	TTTA	2	8	13878	13885	25 %	75 %	0 %	0 %	110804052
48	NC_008265	AATT	2	8	14030	14037	50 %	50 %	0 %	0 %	110804048
49	NC_008265	ATTA	2	8	14744	14751	50 %	50 %	0 %	0 %	110804051
50	NC_008265	TAAT	2	8	14940	14947	50 %	50 %	0 %	0 %	110804051
51	NC_008265	ATTG	2	8	14970	14977	25 %	50 %	25 %	0 %	110804051
52	NC_008265	AATA	2	8	15669	15676	75 %	25 %	0 %	0 %	110804051
53	NC_008265	ATTT	2	8	16143	16150	25 %	75 %	0 %	0 %	110804033
54	NC_008265	AACT	2	8	16279	16286	50 %	25 %	0 %	25 %	110804033
55	NC_008265	ATAA	2	8	17050	17057	75 %	25 %	0 %	0 %	110804033
56	NC_008265	ATTT	2	8	17875	17882	25 %	75 %	0 %	0 %	110804034
57	NC_008265	TAAG	2	8	18245	18252	50 %	25 %	25 %	0 %	110804034
58	NC_008265	TAAA	2	8	18948	18955	75 %	25 %	0 %	0 %	110804039
59	NC_008265	TAAA	2	8	19135	19142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008265	TATT	2	8	19265	19272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008265	TTTC	2	8	19365	19372	0 %	75 %	0 %	25 %	110804064
62	NC_008265	TAAT	2	8	19907	19914	50 %	50 %	0 %	0 %	110804038
63	NC_008265	TTTC	2	8	20002	20009	0 %	75 %	0 %	25 %	110804038
64	NC_008265	TTAT	2	8	20025	20032	25 %	75 %	0 %	0 %	110804038
65	NC_008265	TTAC	2	8	20073	20080	25 %	50 %	0 %	25 %	110804038
66	NC_008265	TAAA	2	8	20237	20244	75 %	25 %	0 %	0 %	110804038
67	NC_008265	CTTT	2	8	20669	20676	0 %	75 %	0 %	25 %	110804065
68	NC_008265	ATTT	2	8	21008	21015	25 %	75 %	0 %	0 %	110804027
69	NC_008265	TTTA	2	8	21061	21068	25 %	75 %	0 %	0 %	110804047
70	NC_008265	TTTC	2	8	21258	21265	0 %	75 %	0 %	25 %	110804047
71	NC_008265	ATCT	2	8	21572	21579	25 %	50 %	0 %	25 %	110804031
72	NC_008265	TACA	2	8	21822	21829	50 %	25 %	0 %	25 %	110804069
73	NC_008265	AATT	2	8	21993	22000	50 %	50 %	0 %	0 %	110804066
74	NC_008265	TCTT	2	8	22296	22303	0 %	75 %	0 %	25 %	110804066
75	NC_008265	ATCT	2	8	22847	22854	25 %	50 %	0 %	25 %	110804066
76	NC_008265	TTGA	2	8	22934	22941	25 %	50 %	25 %	0 %	110804054
77	NC_008265	TAAA	2	8	22980	22987	75 %	25 %	0 %	0 %	110804054
78	NC_008265	TTAC	2	8	23086	23093	25 %	50 %	0 %	25 %	110804029
79	NC_008265	TTTA	2	8	23390	23397	25 %	75 %	0 %	0 %	110804058
80	NC_008265	TTCA	2	8	23584	23591	25 %	50 %	0 %	25 %	110804073
81	NC_008265	ATTT	2	8	23751	23758	25 %	75 %	0 %	0 %	110804073
82	NC_008265	TCTA	2	8	24345	24352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008265	ATTT	2	8	24461	24468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008265	GCTT	2	8	24554	24561	0 %	50 %	25 %	25 %	110804067
85	NC_008265	ATTT	2	8	24935	24942	25 %	75 %	0 %	0 %	110804041
86	NC_008265	TGTA	2	8	25219	25226	25 %	50 %	25 %	0 %	110804041
87	NC_008265	CTTC	2	8	25426	25433	0 %	50 %	0 %	50 %	110804043
88	NC_008265	TATC	2	8	25821	25828	25 %	50 %	0 %	25 %	110804043
89	NC_008265	TAAT	2	8	26786	26793	50 %	50 %	0 %	0 %	110804036
90	NC_008265	TTCT	2	8	27076	27083	0 %	75 %	0 %	25 %	110804036
91	NC_008265	TAAT	2	8	28257	28264	50 %	50 %	0 %	0 %	110804037
92	NC_008265	TTTA	2	8	28348	28355	25 %	75 %	0 %	0 %	110804037
93	NC_008265	CCTT	2	8	28824	28831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008265	ATTA	2	8	29609	29616	50 %	50 %	0 %	0 %	110804060
95	NC_008265	TAAA	2	8	29671	29678	75 %	25 %	0 %	0 %	110804060
96	NC_008265	AGAA	2	8	29867	29874	75 %	0 %	25 %	0 %	110804040
97	NC_008265	CACC	2	8	30114	30121	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_008265	TTTA	2	8	31036	31043	25 %	75 %	0 %	0 %	110804024
99	NC_008265	ATAA	2	8	31072	31079	75 %	25 %	0 %	0 %	110804024
100	NC_008265	AGAA	2	8	31152	31159	75 %	0 %	25 %	0 %	110804024
101	NC_008265	ATAA	2	8	31319	31326	75 %	25 %	0 %	0 %	110804024
102	NC_008265	GATT	2	8	31528	31535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008265	GAAA	2	8	31622	31629	75 %	0 %	25 %	0 %	110804022
104	NC_008265	ATAA	2	8	32104	32111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008265	AAAT	2	8	32782	32789	75 %	25 %	0 %	0 %	110804059
106	NC_008265	TAGG	2	8	32916	32923	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008265	ATTT	2	8	33066	33073	25 %	75 %	0 %	0 %	110804057
108	NC_008265	ACCA	2	8	33212	33219	50 %	0 %	0 %	50 %	110804057
109	NC_008265	TCAT	2	8	33394	33401	25 %	50 %	0 %	25 %	110804057
110	NC_008265	CTTG	2	8	34046	34053	0 %	50 %	25 %	25 %	110804053
111	NC_008265	TAAA	2	8	34572	34579	75 %	25 %	0 %	0 %	110804053
112	NC_008265	ACCC	2	8	34643	34650	25 %	0 %	0 %	75 %	110804053
113	NC_008265	ACTT	2	8	34716	34723	25 %	50 %	0 %	25 %	110804053
114	NC_008265	CTTT	2	8	35213	35220	0 %	75 %	0 %	25 %	110804061
115	NC_008265	CTTT	2	8	35238	35245	0 %	75 %	0 %	25 %	110804061
116	NC_008265	TAAA	2	8	35384	35391	75 %	25 %	0 %	0 %	110804030
117	NC_008265	CCAT	2	8	36300	36307	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008265	ATTG	2	8	36609	36616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008265	TATT	2	8	36961	36968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008265	ATTT	2	8	37724	37731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.