MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium phage phiSM101 chromosome

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008265	ATCT	2	8	4786	4793	25 %	50 %	0 %	25 %	110804056
2	NC_008265	ATTG	2	8	4797	4804	25 %	50 %	25 %	0 %	110804056
3	NC_008265	ACTT	2	8	4927	4934	25 %	50 %	0 %	25 %	110804056
4	NC_008265	TGTT	2	8	5258	5265	0 %	75 %	25 %	0 %	110804063
5	NC_008265	TCCT	2	8	5525	5532	0 %	50 %	0 %	50 %	110804045
6	NC_008265	TATC	2	8	5629	5636	25 %	50 %	0 %	25 %	110804045
7	NC_008265	TAAC	2	8	5932	5939	50 %	25 %	0 %	25 %	110804045
8	NC_008265	TTTA	2	8	6020	6027	25 %	75 %	0 %	0 %	110804045
9	NC_008265	TTAC	2	8	6142	6149	25 %	50 %	0 %	25 %	110804068
10	NC_008265	ATTT	2	8	6758	6765	25 %	75 %	0 %	0 %	110804068
11	NC_008265	ATTC	2	8	7473	7480	25 %	50 %	0 %	25 %	110804068
12	NC_008265	AAAT	2	8	7644	7651	75 %	25 %	0 %	0 %	110804068
13	NC_008265	AACC	2	8	8260	8267	50 %	0 %	0 %	50 %	110804068
14	NC_008265	AGTT	2	8	8453	8460	25 %	50 %	25 %	0 %	110804068
15	NC_008265	TTTA	2	8	9150	9157	25 %	75 %	0 %	0 %	110804068
16	NC_008265	CTTC	2	8	9656	9663	0 %	50 %	0 %	50 %	110804072
17	NC_008265	ACTA	2	8	9687	9694	50 %	25 %	0 %	25 %	110804072
18	NC_008265	ACTA	2	8	9965	9972	50 %	25 %	0 %	25 %	110804055
19	NC_008265	CTTT	2	8	10232	10239	0 %	75 %	0 %	25 %	110804055
20	NC_008265	ACAT	2	8	10380	10387	50 %	25 %	0 %	25 %	110804026
21	NC_008265	CTTG	2	8	10423	10430	0 %	50 %	25 %	25 %	110804026
22	NC_008265	TTGT	2	8	10691	10698	0 %	75 %	25 %	0 %	110804026
23	NC_008265	CTTA	2	8	11462	11469	25 %	50 %	0 %	25 %	110804042
24	NC_008265	ATTT	2	8	11685	11692	25 %	75 %	0 %	0 %	110804035
25	NC_008265	AATT	2	8	12169	12176	50 %	50 %	0 %	0 %	110804032
26	NC_008265	ATTC	2	8	12520	12527	25 %	50 %	0 %	25 %	110804046
27	NC_008265	ATTT	2	8	13199	13206	25 %	75 %	0 %	0 %	110804052
28	NC_008265	ATTT	2	8	13629	13636	25 %	75 %	0 %	0 %	110804052
29	NC_008265	TTTA	2	8	13878	13885	25 %	75 %	0 %	0 %	110804052
30	NC_008265	AATT	2	8	14030	14037	50 %	50 %	0 %	0 %	110804048
31	NC_008265	ATTA	2	8	14744	14751	50 %	50 %	0 %	0 %	110804051
32	NC_008265	TAAT	2	8	14940	14947	50 %	50 %	0 %	0 %	110804051
33	NC_008265	ATTG	2	8	14970	14977	25 %	50 %	25 %	0 %	110804051
34	NC_008265	AATA	2	8	15669	15676	75 %	25 %	0 %	0 %	110804051
35	NC_008265	ATTT	2	8	16143	16150	25 %	75 %	0 %	0 %	110804033
36	NC_008265	AACT	2	8	16279	16286	50 %	25 %	0 %	25 %	110804033
37	NC_008265	ATAA	2	8	17050	17057	75 %	25 %	0 %	0 %	110804033
38	NC_008265	ATTT	2	8	17875	17882	25 %	75 %	0 %	0 %	110804034
39	NC_008265	TAAG	2	8	18245	18252	50 %	25 %	25 %	0 %	110804034
40	NC_008265	TAAA	2	8	18948	18955	75 %	25 %	0 %	0 %	110804039
41	NC_008265	TTTC	2	8	19365	19372	0 %	75 %	0 %	25 %	110804064
42	NC_008265	TAAT	2	8	19907	19914	50 %	50 %	0 %	0 %	110804038
43	NC_008265	TTTC	2	8	20002	20009	0 %	75 %	0 %	25 %	110804038
44	NC_008265	TTAT	2	8	20025	20032	25 %	75 %	0 %	0 %	110804038
45	NC_008265	TTAC	2	8	20073	20080	25 %	50 %	0 %	25 %	110804038
46	NC_008265	TAAA	2	8	20237	20244	75 %	25 %	0 %	0 %	110804038
47	NC_008265	CTTT	2	8	20669	20676	0 %	75 %	0 %	25 %	110804065
48	NC_008265	ATTT	2	8	21008	21015	25 %	75 %	0 %	0 %	110804027
49	NC_008265	TTTA	2	8	21061	21068	25 %	75 %	0 %	0 %	110804047
50	NC_008265	TTTC	2	8	21258	21265	0 %	75 %	0 %	25 %	110804047
51	NC_008265	ATCT	2	8	21572	21579	25 %	50 %	0 %	25 %	110804031
52	NC_008265	TACA	2	8	21822	21829	50 %	25 %	0 %	25 %	110804069
53	NC_008265	AATT	2	8	21993	22000	50 %	50 %	0 %	0 %	110804066
54	NC_008265	TCTT	2	8	22296	22303	0 %	75 %	0 %	25 %	110804066
55	NC_008265	ATCT	2	8	22847	22854	25 %	50 %	0 %	25 %	110804066
56	NC_008265	TTGA	2	8	22934	22941	25 %	50 %	25 %	0 %	110804054
57	NC_008265	TAAA	2	8	22980	22987	75 %	25 %	0 %	0 %	110804054
58	NC_008265	TTAC	2	8	23086	23093	25 %	50 %	0 %	25 %	110804029
59	NC_008265	TTTA	2	8	23390	23397	25 %	75 %	0 %	0 %	110804058
60	NC_008265	TTCA	2	8	23584	23591	25 %	50 %	0 %	25 %	110804073
61	NC_008265	ATTT	2	8	23751	23758	25 %	75 %	0 %	0 %	110804073
62	NC_008265	GCTT	2	8	24554	24561	0 %	50 %	25 %	25 %	110804067
63	NC_008265	ATTT	2	8	24935	24942	25 %	75 %	0 %	0 %	110804041
64	NC_008265	TGTA	2	8	25219	25226	25 %	50 %	25 %	0 %	110804041
65	NC_008265	CTTC	2	8	25426	25433	0 %	50 %	0 %	50 %	110804043
66	NC_008265	TATC	2	8	25821	25828	25 %	50 %	0 %	25 %	110804043
67	NC_008265	TAAT	2	8	26786	26793	50 %	50 %	0 %	0 %	110804036
68	NC_008265	TTCT	2	8	27076	27083	0 %	75 %	0 %	25 %	110804036
69	NC_008265	TAAT	2	8	28257	28264	50 %	50 %	0 %	0 %	110804037
70	NC_008265	TTTA	2	8	28348	28355	25 %	75 %	0 %	0 %	110804037
71	NC_008265	ATTA	2	8	29609	29616	50 %	50 %	0 %	0 %	110804060
72	NC_008265	TAAA	2	8	29671	29678	75 %	25 %	0 %	0 %	110804060
73	NC_008265	AGAA	2	8	29867	29874	75 %	0 %	25 %	0 %	110804040
74	NC_008265	TTTA	2	8	31036	31043	25 %	75 %	0 %	0 %	110804024
75	NC_008265	ATAA	2	8	31072	31079	75 %	25 %	0 %	0 %	110804024
76	NC_008265	AGAA	2	8	31152	31159	75 %	0 %	25 %	0 %	110804024
77	NC_008265	ATAA	2	8	31319	31326	75 %	25 %	0 %	0 %	110804024
78	NC_008265	GAAA	2	8	31622	31629	75 %	0 %	25 %	0 %	110804022
79	NC_008265	AAAT	2	8	32782	32789	75 %	25 %	0 %	0 %	110804059
80	NC_008265	ATTT	2	8	33066	33073	25 %	75 %	0 %	0 %	110804057
81	NC_008265	ACCA	2	8	33212	33219	50 %	0 %	0 %	50 %	110804057
82	NC_008265	TCAT	2	8	33394	33401	25 %	50 %	0 %	25 %	110804057
83	NC_008265	CTTG	2	8	34046	34053	0 %	50 %	25 %	25 %	110804053
84	NC_008265	TAAA	2	8	34572	34579	75 %	25 %	0 %	0 %	110804053
85	NC_008265	ACCC	2	8	34643	34650	25 %	0 %	0 %	75 %	110804053
86	NC_008265	ACTT	2	8	34716	34723	25 %	50 %	0 %	25 %	110804053
87	NC_008265	CTTT	2	8	35213	35220	0 %	75 %	0 %	25 %	110804061
88	NC_008265	CTTT	2	8	35238	35245	0 %	75 %	0 %	25 %	110804061
89	NC_008265	TAAA	2	8	35384	35391	75 %	25 %	0 %	0 %	110804030

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.