MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium phage phiSM101 chromosome

Total Repeats: 653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008265	TTC	2	6	79	84	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008265	CTG	2	6	102	107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008265	GTA	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008265	GAA	2	6	386	391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008265	ACC	2	6	562	567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008265	ATT	2	6	578	583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008265	TTA	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008265	TAT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008265	ATT	2	6	727	732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008265	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008265	CTG	2	6	906	911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008265	TGT	2	6	937	942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008265	ATT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008265	CTT	2	6	1026	1031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008265	TTG	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008265	CTT	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008265	CAT	2	6	1218	1223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008265	TAG	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008265	TTG	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008265	ATT	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008265	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008265	CAA	2	6	1529	1534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008265	CCA	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_008265	TAT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008265	TCT	2	6	1784	1789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008265	ATT	3	9	1804	1812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008265	TAA	2	6	1881	1886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008265	TTA	2	6	1910	1915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008265	TGT	2	6	1924	1929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008265	TAT	2	6	2031	2036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008265	CTA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008265	TAT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008265	GAT	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008265	ACT	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008265	TTA	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008265	CTT	2	6	2218	2223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008265	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008265	TAT	2	6	2376	2381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008265	TCT	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008265	TTA	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008265	TTA	2	6	2522	2527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008265	TTA	2	6	2570	2575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008265	TAA	2	6	2581	2586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008265	TAC	2	6	2611	2616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008265	TAT	3	9	2667	2675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008265	TAA	2	6	2722	2727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008265	AGC	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008265	CCA	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008265	TTA	2	6	3011	3016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008265	TTA	2	6	3026	3031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008265	ATA	2	6	3138	3143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008265	GTT	2	6	3158	3163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008265	TTG	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008265	TAT	2	6	3441	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008265	TAT	2	6	3489	3494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008265	TTG	2	6	3523	3528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008265	TTA	2	6	3632	3637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008265	AAT	2	6	3672	3677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008265	AGG	2	6	3735	3740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008265	TTC	2	6	3757	3762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008265	TCT	2	6	3779	3784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008265	TTA	2	6	3839	3844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008265	ATT	2	6	3877	3882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008265	TAT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008265	TTA	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008265	CTA	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008265	AAG	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008265	TTC	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008265	CTT	2	6	4344	4349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008265	CTA	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008265	TCA	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008265	CTT	2	6	4374	4379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008265	TAA	2	6	4492	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008265	TAT	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008265	TTA	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008265	TTC	2	6	4636	4641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804056
77	NC_008265	TAT	2	6	4732	4737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804056
78	NC_008265	ATC	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804056
79	NC_008265	TTA	2	6	4760	4765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804056
80	NC_008265	CTT	2	6	5023	5028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008265	CTT	2	6	5390	5395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008265	AAT	2	6	5456	5461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804045
83	NC_008265	TAT	3	9	5558	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804045
84	NC_008265	TAA	2	6	5885	5890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804045
85	NC_008265	ATT	2	6	6074	6079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804045
86	NC_008265	ATT	2	6	6089	6094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804045
87	NC_008265	ATT	2	6	6104	6109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804068
88	NC_008265	ACT	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804068
89	NC_008265	TTC	2	6	6174	6179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
90	NC_008265	CTT	2	6	6221	6226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
91	NC_008265	TTC	2	6	6288	6293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
92	NC_008265	TCC	2	6	6372	6377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804068
93	NC_008265	CTG	2	6	6410	6415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804068
94	NC_008265	CCA	2	6	6480	6485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804068
95	NC_008265	AGT	3	9	6522	6530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804068
96	NC_008265	TTC	2	6	6594	6599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
97	NC_008265	TCT	2	6	6637	6642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
98	NC_008265	CTG	2	6	6662	6667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804068
99	NC_008265	ATT	2	6	6697	6702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804068
100	NC_008265	TTC	2	6	6723	6728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
101	NC_008265	TGC	2	6	6732	6737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804068
102	NC_008265	TCA	2	6	6748	6753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804068
103	NC_008265	CTG	2	6	6794	6799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804068
104	NC_008265	TCA	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804068
105	NC_008265	TAC	2	6	6902	6907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804068
106	NC_008265	TCT	2	6	6925	6930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
107	NC_008265	TTC	2	6	6945	6950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
108	NC_008265	GCT	2	6	6952	6957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804068
109	NC_008265	TCA	2	6	6991	6996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804068
110	NC_008265	CTT	2	6	7098	7103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
111	NC_008265	CTT	2	6	7109	7114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
112	NC_008265	TTC	2	6	7254	7259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
113	NC_008265	CTT	2	6	7266	7271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
114	NC_008265	TAT	2	6	7302	7307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804068
115	NC_008265	CTT	2	6	7353	7358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
116	NC_008265	TTC	2	6	7386	7391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
117	NC_008265	TCT	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
118	NC_008265	CTA	2	6	7718	7723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804068
119	NC_008265	ACT	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804068
120	NC_008265	CAG	2	6	7784	7789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804068
121	NC_008265	CAG	2	6	7811	7816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804068
122	NC_008265	GCT	2	6	7825	7830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804068
123	NC_008265	TAA	2	6	7899	7904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804068
124	NC_008265	ACC	2	6	7923	7928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804068
125	NC_008265	AGC	2	6	7980	7985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804068
126	NC_008265	TAG	2	6	8039	8044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804068
127	NC_008265	TGC	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804068
128	NC_008265	TAT	2	6	8250	8255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804068
129	NC_008265	CTT	2	6	8276	8281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
130	NC_008265	CAG	2	6	8300	8305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804068
131	NC_008265	CAG	2	6	8423	8428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804068
132	NC_008265	TGC	2	6	8574	8579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804068
133	NC_008265	CAT	2	6	8598	8603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804068
134	NC_008265	GAT	2	6	8626	8631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804068
135	NC_008265	GCT	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804068
136	NC_008265	TGT	2	6	8715	8720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804068
137	NC_008265	TTC	2	6	8727	8732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
138	NC_008265	TCT	2	6	8866	8871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
139	NC_008265	TCT	2	6	8896	8901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804068
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266	NC_008265	GTA	2	6	16018	16023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_008265	TAT	2	6	16029	16034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_008265	TAA	2	6	16035	16040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_008265	TCT	2	6	16060	16065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_008265	AAG	2	6	16124	16129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804033
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392	NC_008265	TGC	2	6	22890	22895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804066
393	NC_008265	CTT	2	6	22921	22926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804054
394	NC_008265	CTT	2	6	23030	23035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804054
395	NC_008265	AAT	2	6	23053	23058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804054
396	NC_008265	CTT	2	6	23189	23194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804029
397	NC_008265	TTC	2	6	23228	23233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804029
398	NC_008265	TAA	2	6	23459	23464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804058
399	NC_008265	TTC	2	6	23495	23500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804058
400	NC_008265	TCA	2	6	23635	23640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804073
401	NC_008265	ACA	2	6	23644	23649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804073
402	NC_008265	TCT	2	6	23695	23700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804073
403	NC_008265	TCT	2	6	23730	23735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804073
404	NC_008265	ATC	2	6	23853	23858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804073
405	NC_008265	ATT	2	6	23935	23940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804073
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411	NC_008265	CTT	2	6	24083	24088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804073
412	NC_008265	ACT	2	6	24219	24224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804073
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414	NC_008265	ATT	2	6	24522	24527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804067
415	NC_008265	TAT	2	6	24587	24592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804067
416	NC_008265	AAT	2	6	24614	24619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804067
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441	NC_008265	AAT	4	12	26160	26171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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