MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium phage phiSM101 chromosome

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008265	TTC	2	6	79	84	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008265	CTG	2	6	102	107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008265	GTA	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008265	GAA	2	6	386	391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008265	ACC	2	6	562	567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008265	ATT	2	6	578	583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008265	TTA	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008265	TAT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008265	ATT	2	6	727	732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008265	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008265	CTG	2	6	906	911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008265	TGT	2	6	937	942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008265	ATT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008265	CTT	2	6	1026	1031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008265	TTG	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008265	CTT	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008265	CAT	2	6	1218	1223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008265	TAG	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008265	TTG	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008265	ATT	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008265	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008265	CAA	2	6	1529	1534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008265	CCA	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_008265	TAT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008265	TCT	2	6	1784	1789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008265	ATT	3	9	1804	1812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008265	TAA	2	6	1881	1886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008265	TTA	2	6	1910	1915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008265	TGT	2	6	1924	1929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008265	TAT	2	6	2031	2036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008265	CTA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008265	TAT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008265	GAT	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008265	ACT	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008265	TTA	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008265	CTT	2	6	2218	2223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008265	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008265	TAT	2	6	2376	2381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008265	TCT	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008265	TTA	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008265	TTA	2	6	2522	2527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008265	TTA	2	6	2570	2575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008265	TAA	2	6	2581	2586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008265	TAC	2	6	2611	2616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008265	TAT	3	9	2667	2675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008265	TAA	2	6	2722	2727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008265	AGC	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008265	CCA	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008265	TTA	2	6	3011	3016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008265	TTA	2	6	3026	3031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008265	ATA	2	6	3138	3143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008265	GTT	2	6	3158	3163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008265	TTG	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008265	TAT	2	6	3441	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008265	TAT	2	6	3489	3494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008265	TTG	2	6	3523	3528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008265	TTA	2	6	3632	3637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008265	AAT	2	6	3672	3677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008265	AGG	2	6	3735	3740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008265	TTC	2	6	3757	3762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008265	TCT	2	6	3779	3784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008265	TTA	2	6	3839	3844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008265	ATT	2	6	3877	3882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008265	TAT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008265	TTA	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008265	CTA	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008265	AAG	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008265	TTC	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008265	CTT	2	6	4344	4349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008265	CTA	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008265	TCA	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008265	CTT	2	6	4374	4379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008265	TAA	2	6	4492	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008265	TAT	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008265	TTA	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008265	CTT	2	6	5023	5028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008265	CTT	2	6	5390	5395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008265	TCC	2	6	9647	9652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_008265	CTA	2	6	10993	10998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008265	CTT	2	6	11030	11035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008265	AGA	2	6	11040	11045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008265	AAT	2	6	11081	11086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008265	CTT	2	6	11105	11110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008265	TAA	2	6	11132	11137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008265	TCA	2	6	11218	11223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008265	ATT	2	6	12056	12061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008265	TAA	2	6	12074	12079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008265	CCT	2	6	15924	15929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008265	TAA	2	6	15966	15971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008265	GTA	2	6	16018	16023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008265	TAT	2	6	16029	16034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008265	TAA	2	6	16035	16040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008265	TCT	2	6	16060	16065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008265	TAA	2	6	19163	19168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008265	AAT	2	6	19282	19287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008265	CAT	3	9	19505	19513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008265	TTA	2	6	19516	19521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008265	CTA	2	6	19526	19531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008265	AAG	2	6	19639	19644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008265	CTT	2	6	19653	19658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008265	TCT	2	6	20754	20759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008265	AAC	2	6	20780	20785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008265	CAT	2	6	24418	24423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008265	TTA	2	6	26099	26104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008265	ACT	2	6	26148	26153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008265	AAT	4	12	26160	26171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008265	TTA	2	6	26625	26630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008265	TTA	2	6	26671	26676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008265	TGT	2	6	26728	26733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008265	AGG	2	6	26778	26783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008265	AAG	2	6	27156	27161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008265	TTC	2	6	27322	27327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008265	ATT	2	6	27333	27338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008265	TAA	2	6	27440	27445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008265	AGA	2	6	27470	27475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008265	TCG	2	6	27479	27484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008265	AAC	2	6	27489	27494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008265	ATT	2	6	27629	27634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008265	AAT	3	9	27645	27653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008265	TGC	2	6	27669	27674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008265	GTT	2	6	27682	27687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008265	CTC	2	6	28582	28587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008265	CAA	2	6	28602	28607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008265	AAG	2	6	28620	28625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008265	TAT	2	6	28654	28659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008265	AAT	2	6	28662	28667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008265	TAA	2	6	28791	28796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008265	ATT	2	6	28867	28872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008265	AGG	2	6	30187	30192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008265	TTA	2	6	30248	30253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008265	CAA	2	6	30265	30270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008265	TAT	2	6	30328	30333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008265	ATT	2	6	30846	30851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008265	ATA	2	6	30911	30916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008265	TAA	2	6	31371	31376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008265	CTT	2	6	31445	31450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008265	TAA	2	6	31484	31489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008265	TAA	2	6	32085	32090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008265	AGG	2	6	32121	32126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008265	AAC	2	6	32128	32133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008265	TGG	2	6	32552	32557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008265	AAT	2	6	32876	32881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008265	CTT	2	6	33987	33992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008265	CTT	2	6	35368	35373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008265	CCT	2	6	35885	35890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.