MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium phage phiSM101 chromosome

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008265	TA	4	8	421	428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008265	TA	3	6	1345	1350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008265	AT	3	6	1476	1481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008265	TA	3	6	1567	1572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008265	CT	3	6	2186	2191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008265	AT	3	6	3000	3005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008265	TC	3	6	3808	3813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008265	TC	3	6	4034	4039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008265	AT	3	6	4233	4238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008265	AT	3	6	4337	4342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008265	AG	3	6	4393	4398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008265	CT	3	6	4424	4429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008265	AC	3	6	4506	4511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008265	TC	3	6	6685	6690	0 %	50 %	0 %	50 %	110804068
15	NC_008265	TC	3	6	6825	6830	0 %	50 %	0 %	50 %	110804068
16	NC_008265	TA	3	6	7160	7165	50 %	50 %	0 %	0 %	110804068
17	NC_008265	AT	3	6	9935	9940	50 %	50 %	0 %	0 %	110804055
18	NC_008265	AT	3	6	11389	11394	50 %	50 %	0 %	0 %	110804042
19	NC_008265	TA	3	6	12615	12620	50 %	50 %	0 %	0 %	110804046
20	NC_008265	TC	3	6	13392	13397	0 %	50 %	0 %	50 %	110804052
21	NC_008265	TA	3	6	13529	13534	50 %	50 %	0 %	0 %	110804052
22	NC_008265	TA	3	6	14627	14632	50 %	50 %	0 %	0 %	110804048
23	NC_008265	TA	3	6	15457	15462	50 %	50 %	0 %	0 %	110804051
24	NC_008265	TA	3	6	15915	15920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008265	AT	3	6	16001	16006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008265	TA	3	6	16531	16536	50 %	50 %	0 %	0 %	110804033
27	NC_008265	AT	3	6	16875	16880	50 %	50 %	0 %	0 %	110804033
28	NC_008265	CA	3	6	18683	18688	50 %	0 %	0 %	50 %	110804050
29	NC_008265	CT	3	6	18741	18746	0 %	50 %	0 %	50 %	110804050
30	NC_008265	AG	3	6	19572	19577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008265	TA	3	6	19856	19861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008265	AT	3	6	20031	20036	50 %	50 %	0 %	0 %	110804038
33	NC_008265	TC	3	6	20256	20261	0 %	50 %	0 %	50 %	110804038
34	NC_008265	AT	3	6	20314	20319	50 %	50 %	0 %	0 %	110804038
35	NC_008265	AT	4	8	20410	20417	50 %	50 %	0 %	0 %	110804065
36	NC_008265	AT	3	6	20580	20585	50 %	50 %	0 %	0 %	110804065
37	NC_008265	AT	3	6	20836	20841	50 %	50 %	0 %	0 %	110804027
38	NC_008265	TA	3	6	21557	21562	50 %	50 %	0 %	0 %	110804031
39	NC_008265	CA	3	6	21813	21818	50 %	0 %	0 %	50 %	110804069
40	NC_008265	TA	3	6	22655	22660	50 %	50 %	0 %	0 %	110804066
41	NC_008265	AT	3	6	23824	23829	50 %	50 %	0 %	0 %	110804073
42	NC_008265	AT	4	8	24002	24009	50 %	50 %	0 %	0 %	110804073
43	NC_008265	TC	3	6	24319	24324	0 %	50 %	0 %	50 %	110804073
44	NC_008265	AT	3	6	24862	24867	50 %	50 %	0 %	0 %	110804067
45	NC_008265	TA	3	6	24928	24933	50 %	50 %	0 %	0 %	110804041
46	NC_008265	CA	3	6	25231	25236	50 %	0 %	0 %	50 %	110804041
47	NC_008265	TA	4	8	25317	25324	50 %	50 %	0 %	0 %	110804043
48	NC_008265	AT	3	6	26183	26188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008265	TA	3	6	26234	26239	50 %	50 %	0 %	0 %	110804023
50	NC_008265	CT	3	6	26252	26257	0 %	50 %	0 %	50 %	110804023
51	NC_008265	TA	3	6	26469	26474	50 %	50 %	0 %	0 %	110804049
52	NC_008265	AG	3	6	27724	27729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008265	AT	3	6	27900	27905	50 %	50 %	0 %	0 %	110804037
54	NC_008265	TA	4	8	28101	28108	50 %	50 %	0 %	0 %	110804037
55	NC_008265	TA	3	6	28937	28942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008265	CT	3	6	29338	29343	0 %	50 %	0 %	50 %	110804060
57	NC_008265	TA	3	6	29542	29547	50 %	50 %	0 %	0 %	110804060
58	NC_008265	AG	3	6	29648	29653	50 %	0 %	50 %	0 %	110804060
59	NC_008265	AT	3	6	29954	29959	50 %	50 %	0 %	0 %	110804040
60	NC_008265	CT	3	6	31388	31393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008265	GA	3	6	32426	32431	50 %	0 %	50 %	0 %	110804021
62	NC_008265	AT	3	6	32836	32841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008265	TG	3	6	32846	32851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008265	AT	3	6	34503	34508	50 %	50 %	0 %	0 %	110804053
65	NC_008265	AC	3	6	34675	34680	50 %	0 %	0 %	50 %	110804053
66	NC_008265	AT	3	6	34809	34814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008265	AT	3	6	35634	35639	50 %	50 %	0 %	0 %	110804071
68	NC_008265	TA	3	6	36011	36016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008265	AG	3	6	36105	36110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008265	TA	3	6	36143	36148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008265	CT	3	6	37120	37125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008265	GT	3	6	37226	37231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008265	TA	3	6	37484	37489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008265	AT	3	6	37966	37971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.