MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens SM101 plasmid pSM101B

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008264	TTAT	2	8	244	251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008264	TAAA	2	8	659	666	75 %	25 %	0 %	0 %	110804016
3	NC_008264	TTTA	2	8	968	975	25 %	75 %	0 %	0 %	110804016
4	NC_008264	CTAA	2	8	984	991	50 %	25 %	0 %	25 %	110804016
5	NC_008264	AGGA	2	8	1437	1444	50 %	0 %	50 %	0 %	110804016
6	NC_008264	TTGT	2	8	2025	2032	0 %	75 %	25 %	0 %	110804016
7	NC_008264	CATA	2	8	2127	2134	50 %	25 %	0 %	25 %	110804016
8	NC_008264	AGTT	2	8	2464	2471	25 %	50 %	25 %	0 %	110804016
9	NC_008264	TTGC	2	8	2531	2538	0 %	50 %	25 %	25 %	110804016
10	NC_008264	TAAC	2	8	2541	2548	50 %	25 %	0 %	25 %	110804016
11	NC_008264	TAAA	2	8	3019	3026	75 %	25 %	0 %	0 %	110804016
12	NC_008264	TAAA	2	8	3363	3370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008264	TATT	2	8	3444	3451	25 %	75 %	0 %	0 %	110804013
14	NC_008264	AATA	2	8	3570	3577	75 %	25 %	0 %	0 %	110804013
15	NC_008264	TTTA	2	8	3660	3667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008264	GACT	2	8	3950	3957	25 %	25 %	25 %	25 %	110804015
17	NC_008264	TATT	2	8	4092	4099	25 %	75 %	0 %	0 %	110804015
18	NC_008264	ACTA	2	8	4102	4109	50 %	25 %	0 %	25 %	110804015
19	NC_008264	TATT	2	8	4178	4185	25 %	75 %	0 %	0 %	110804015
20	NC_008264	TTAT	2	8	4202	4209	25 %	75 %	0 %	0 %	110804015
21	NC_008264	ATTT	2	8	4295	4302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008264	CTTT	2	8	4498	4505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008264	AAGA	2	8	4567	4574	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008264	TAAA	2	8	4983	4990	75 %	25 %	0 %	0 %	110804011
25	NC_008264	GTTT	2	8	5018	5025	0 %	75 %	25 %	0 %	110804011
26	NC_008264	TAAA	2	8	5115	5122	75 %	25 %	0 %	0 %	110804011
27	NC_008264	ATTT	2	8	5184	5191	25 %	75 %	0 %	0 %	110804011
28	NC_008264	TAAA	2	8	5352	5359	75 %	25 %	0 %	0 %	110804011
29	NC_008264	ACAG	2	8	5389	5396	50 %	0 %	25 %	25 %	110804011
30	NC_008264	AAGA	2	8	5502	5509	75 %	0 %	25 %	0 %	110804011
31	NC_008264	TACT	2	8	5548	5555	25 %	50 %	0 %	25 %	110804011
32	NC_008264	TTTA	2	8	5815	5822	25 %	75 %	0 %	0 %	110804014
33	NC_008264	GTTT	2	8	6144	6151	0 %	75 %	25 %	0 %	110804012
34	NC_008264	TTCC	2	8	6237	6244	0 %	50 %	0 %	50 %	110804012
35	NC_008264	TCTA	2	8	6416	6423	25 %	50 %	0 %	25 %	110804012
36	NC_008264	ATTT	2	8	6682	6689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008264	AAAG	2	8	6861	6868	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008264	CTTT	2	8	7177	7184	0 %	75 %	0 %	25 %	110804010
39	NC_008264	ATTA	2	8	7334	7341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008264	ATAA	2	8	7398	7405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008264	AATG	2	8	7439	7446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008264	ATTT	2	8	7563	7570	25 %	75 %	0 %	0 %	110804018
43	NC_008264	ATCT	2	8	7801	7808	25 %	50 %	0 %	25 %	110804018
44	NC_008264	CTTC	2	8	8385	8392	0 %	50 %	0 %	50 %	110804018
45	NC_008264	ATCC	2	8	8414	8421	25 %	25 %	0 %	50 %	110804018
46	NC_008264	ATTT	2	8	8434	8441	25 %	75 %	0 %	0 %	110804018
47	NC_008264	TAAA	2	8	8652	8659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008264	AATT	2	8	8773	8780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008264	ATTT	2	8	9067	9074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008264	TTAT	2	8	9271	9278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008264	ATTT	2	8	9365	9372	25 %	75 %	0 %	0 %	110804019
52	NC_008264	TAAC	2	8	9867	9874	50 %	25 %	0 %	25 %	110804019
53	NC_008264	TAAT	2	8	9907	9914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008264	AACT	2	8	10240	10247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008264	ATTT	2	8	10980	10987	25 %	75 %	0 %	0 %	110804017
56	NC_008264	CTAT	2	8	11278	11285	25 %	50 %	0 %	25 %	110804017
57	NC_008264	TAAA	2	8	11387	11394	75 %	25 %	0 %	0 %	110804017
58	NC_008264	ATCT	2	8	11864	11871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008264	TATT	2	8	12091	12098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008264	ATAA	2	8	12122	12129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.