MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens SM101 plasmid pSM101B

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008264	AT	3	6	451	456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008264	AT	3	6	527	532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008264	TA	4	8	958	965	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
4	NC_008264	AT	3	6	1102	1107	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
5	NC_008264	AT	3	6	1471	1476	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
6	NC_008264	AT	3	6	1729	1734	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
7	NC_008264	TA	4	8	2009	2016	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
8	NC_008264	TA	3	6	2344	2349	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
9	NC_008264	CT	3	6	3200	3205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008264	TA	3	6	3901	3906	50 %	50 %	0 %	0 %	110804015
11	NC_008264	TA	3	6	3988	3993	50 %	50 %	0 %	0 %	110804015
12	NC_008264	TA	3	6	4210	4215	50 %	50 %	0 %	0 %	110804015
13	NC_008264	TA	3	6	4260	4265	50 %	50 %	0 %	0 %	110804015
14	NC_008264	TA	3	6	4440	4445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008264	AT	3	6	4545	4550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008264	AT	3	6	4895	4900	50 %	50 %	0 %	0 %	110804011
17	NC_008264	TA	3	6	5597	5602	50 %	50 %	0 %	0 %	110804011
18	NC_008264	TC	3	6	5842	5847	0 %	50 %	0 %	50 %	110804014
19	NC_008264	AT	3	6	5960	5965	50 %	50 %	0 %	0 %	110804014
20	NC_008264	AT	3	6	6080	6085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008264	TA	3	6	6118	6123	50 %	50 %	0 %	0 %	110804012
22	NC_008264	TA	3	6	6181	6186	50 %	50 %	0 %	0 %	110804012
23	NC_008264	CT	3	6	6297	6302	0 %	50 %	0 %	50 %	110804012
24	NC_008264	AT	3	6	6503	6508	50 %	50 %	0 %	0 %	110804012
25	NC_008264	CT	3	6	6524	6529	0 %	50 %	0 %	50 %	110804012
26	NC_008264	AT	4	8	6560	6567	50 %	50 %	0 %	0 %	110804012
27	NC_008264	AT	3	6	6845	6850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008264	TA	3	6	7217	7222	50 %	50 %	0 %	0 %	110804010
29	NC_008264	TA	3	6	7577	7582	50 %	50 %	0 %	0 %	110804018
30	NC_008264	TG	3	6	8211	8216	0 %	50 %	50 %	0 %	110804018
31	NC_008264	TA	4	8	8865	8872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008264	AT	3	6	9480	9485	50 %	50 %	0 %	0 %	110804019
33	NC_008264	TA	3	6	9673	9678	50 %	50 %	0 %	0 %	110804019
34	NC_008264	AT	3	6	9808	9813	50 %	50 %	0 %	0 %	110804019
35	NC_008264	AT	3	6	10457	10462	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
36	NC_008264	AT	3	6	10475	10480	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
37	NC_008264	AT	3	6	10648	10653	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
38	NC_008264	TA	3	6	10865	10870	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
39	NC_008264	AT	3	6	11065	11070	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
40	NC_008264	AT	3	6	11084	11089	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
41	NC_008264	TA	3	6	11189	11194	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
42	NC_008264	TA	3	6	11454	11459	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
43	NC_008264	TA	3	6	11583	11588	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
44	NC_008264	AT	3	6	11666	11671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008264	AT	3	6	11768	11773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008264	TA	3	6	11806	11811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.