MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 plasmid pSM101B

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008264	TA	4	8	958	965	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
2	NC_008264	AT	3	6	1102	1107	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
3	NC_008264	AT	3	6	1471	1476	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
4	NC_008264	AT	3	6	1729	1734	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
5	NC_008264	TA	4	8	2009	2016	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
6	NC_008264	TA	3	6	2344	2349	50 %	50 %	0 %	0 %	110804016
7	NC_008264	TA	3	6	3901	3906	50 %	50 %	0 %	0 %	110804015
8	NC_008264	TA	3	6	3988	3993	50 %	50 %	0 %	0 %	110804015
9	NC_008264	TA	3	6	4210	4215	50 %	50 %	0 %	0 %	110804015
10	NC_008264	TA	3	6	4260	4265	50 %	50 %	0 %	0 %	110804015
11	NC_008264	AT	3	6	4895	4900	50 %	50 %	0 %	0 %	110804011
12	NC_008264	TA	3	6	5597	5602	50 %	50 %	0 %	0 %	110804011
13	NC_008264	TC	3	6	5842	5847	0 %	50 %	0 %	50 %	110804014
14	NC_008264	AT	3	6	5960	5965	50 %	50 %	0 %	0 %	110804014
15	NC_008264	TA	3	6	6118	6123	50 %	50 %	0 %	0 %	110804012
16	NC_008264	TA	3	6	6181	6186	50 %	50 %	0 %	0 %	110804012
17	NC_008264	CT	3	6	6297	6302	0 %	50 %	0 %	50 %	110804012
18	NC_008264	AT	3	6	6503	6508	50 %	50 %	0 %	0 %	110804012
19	NC_008264	CT	3	6	6524	6529	0 %	50 %	0 %	50 %	110804012
20	NC_008264	AT	4	8	6560	6567	50 %	50 %	0 %	0 %	110804012
21	NC_008264	TA	3	6	7217	7222	50 %	50 %	0 %	0 %	110804010
22	NC_008264	TA	3	6	7577	7582	50 %	50 %	0 %	0 %	110804018
23	NC_008264	TG	3	6	8211	8216	0 %	50 %	50 %	0 %	110804018
24	NC_008264	AT	3	6	9480	9485	50 %	50 %	0 %	0 %	110804019
25	NC_008264	TA	3	6	9673	9678	50 %	50 %	0 %	0 %	110804019
26	NC_008264	AT	3	6	9808	9813	50 %	50 %	0 %	0 %	110804019
27	NC_008264	AT	3	6	10457	10462	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
28	NC_008264	AT	3	6	10475	10480	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
29	NC_008264	AT	3	6	10648	10653	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
30	NC_008264	TA	3	6	10865	10870	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
31	NC_008264	AT	3	6	11065	11070	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
32	NC_008264	AT	3	6	11084	11089	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
33	NC_008264	TA	3	6	11189	11194	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
34	NC_008264	TA	3	6	11454	11459	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017
35	NC_008264	TA	3	6	11583	11588	50 %	50 %	0 %	0 %	110804017

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.