MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens SM101 plasmid pSM101B

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008264	A	6	6	4	9	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008264	T	6	6	16	21	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008264	T	8	8	419	426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008264	T	6	6	791	796	0 %	100 %	0 %	0 %	110804016
5	NC_008264	T	6	6	2209	2214	0 %	100 %	0 %	0 %	110804016
6	NC_008264	T	7	7	3003	3009	0 %	100 %	0 %	0 %	110804016
7	NC_008264	A	6	6	3096	3101	100 %	0 %	0 %	0 %	110804016
8	NC_008264	T	6	6	3214	3219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008264	T	7	7	3328	3334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008264	T	7	7	3336	3342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008264	A	6	6	3406	3411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008264	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008264	T	7	7	3736	3742	0 %	100 %	0 %	0 %	110804015
14	NC_008264	T	6	6	4300	4305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008264	T	11	11	4319	4329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008264	T	7	7	4452	4458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008264	T	6	6	4480	4485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008264	A	6	6	4942	4947	100 %	0 %	0 %	0 %	110804011
19	NC_008264	A	6	6	5494	5499	100 %	0 %	0 %	0 %	110804011
20	NC_008264	A	6	6	5646	5651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008264	T	7	7	5671	5677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008264	T	6	6	5720	5725	0 %	100 %	0 %	0 %	110804014
23	NC_008264	T	6	6	5754	5759	0 %	100 %	0 %	0 %	110804014
24	NC_008264	T	7	7	5829	5835	0 %	100 %	0 %	0 %	110804014
25	NC_008264	T	7	7	5865	5871	0 %	100 %	0 %	0 %	110804014
26	NC_008264	T	7	7	5907	5913	0 %	100 %	0 %	0 %	110804014
27	NC_008264	T	6	6	6085	6090	0 %	100 %	0 %	0 %	110804012
28	NC_008264	A	6	6	6333	6338	100 %	0 %	0 %	0 %	110804012
29	NC_008264	T	6	6	6550	6555	0 %	100 %	0 %	0 %	110804012
30	NC_008264	T	6	6	6672	6677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008264	T	6	6	6738	6743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008264	T	6	6	6771	6776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008264	A	7	7	6783	6789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008264	A	6	6	6798	6803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008264	T	6	6	6830	6835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008264	T	7	7	6880	6886	0 %	100 %	0 %	0 %	110804010
37	NC_008264	T	6	6	6987	6992	0 %	100 %	0 %	0 %	110804010
38	NC_008264	T	6	6	7057	7062	0 %	100 %	0 %	0 %	110804010
39	NC_008264	T	6	6	7367	7372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008264	T	7	7	8016	8022	0 %	100 %	0 %	0 %	110804018
41	NC_008264	A	6	6	8597	8602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008264	T	6	6	8613	8618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008264	A	6	6	8734	8739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008264	T	6	6	8779	8784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008264	A	6	6	8800	8805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008264	T	6	6	8822	8827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008264	A	6	6	8852	8857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008264	A	7	7	8872	8878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008264	A	8	8	8884	8891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008264	T	7	7	9072	9078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008264	A	7	7	9139	9145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008264	A	6	6	9172	9177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008264	T	6	6	9287	9292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008264	A	6	6	9326	9331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008264	T	6	6	9370	9375	0 %	100 %	0 %	0 %	110804019
56	NC_008264	A	6	6	9376	9381	100 %	0 %	0 %	0 %	110804019
57	NC_008264	A	7	7	9388	9394	100 %	0 %	0 %	0 %	110804019
58	NC_008264	T	7	7	9396	9402	0 %	100 %	0 %	0 %	110804019
59	NC_008264	T	6	6	9420	9425	0 %	100 %	0 %	0 %	110804019
60	NC_008264	T	7	7	9505	9511	0 %	100 %	0 %	0 %	110804019
61	NC_008264	T	6	6	9937	9942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008264	T	6	6	10180	10185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008264	A	6	6	10202	10207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008264	A	6	6	10253	10258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008264	A	7	7	10278	10284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008264	A	6	6	10318	10323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008264	T	8	8	10517	10524	0 %	100 %	0 %	0 %	110804017
68	NC_008264	T	6	6	10538	10543	0 %	100 %	0 %	0 %	110804017
69	NC_008264	T	8	8	10588	10595	0 %	100 %	0 %	0 %	110804017
70	NC_008264	T	6	6	11001	11006	0 %	100 %	0 %	0 %	110804017
71	NC_008264	T	6	6	11526	11531	0 %	100 %	0 %	0 %	110804017
72	NC_008264	A	7	7	11676	11682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008264	T	6	6	11880	11885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008264	T	6	6	12160	12165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.