MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens SM101 plasmid pSM101A

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008263	CA	3	6	313	318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008263	TA	3	6	947	952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008263	TA	3	6	1247	1252	50 %	50 %	0 %	0 %	110804002
4	NC_008263	TA	3	6	1695	1700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008263	GA	3	6	1988	1993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008263	TA	3	6	1994	1999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008263	AT	4	8	2151	2158	50 %	50 %	0 %	0 %	110804008
8	NC_008263	AG	3	6	2189	2194	50 %	0 %	50 %	0 %	110804008
9	NC_008263	TA	3	6	2595	2600	50 %	50 %	0 %	0 %	110804008
10	NC_008263	TA	3	6	2726	2731	50 %	50 %	0 %	0 %	110804005
11	NC_008263	TA	3	6	3788	3793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008263	AT	3	6	4053	4058	50 %	50 %	0 %	0 %	110804004
13	NC_008263	TA	3	6	4235	4240	50 %	50 %	0 %	0 %	110804004
14	NC_008263	AT	3	6	4368	4373	50 %	50 %	0 %	0 %	110804004
15	NC_008263	AT	3	6	4436	4441	50 %	50 %	0 %	0 %	110804004
16	NC_008263	TA	3	6	4869	4874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008263	AG	3	6	5281	5286	50 %	0 %	50 %	0 %	110804003
18	NC_008263	TA	3	6	5768	5773	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
19	NC_008263	TA	4	8	6122	6129	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
20	NC_008263	AT	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
21	NC_008263	TA	3	6	6449	6454	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
22	NC_008263	TA	3	6	6562	6567	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
23	NC_008263	AT	3	6	6849	6854	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
24	NC_008263	TA	3	6	6983	6988	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
25	NC_008263	AT	3	6	7059	7064	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
26	NC_008263	TA	4	8	7079	7086	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
27	NC_008263	AT	3	6	7391	7396	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
28	NC_008263	TA	4	8	7413	7420	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
29	NC_008263	TA	3	6	7429	7434	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
30	NC_008263	AT	3	6	7960	7965	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
31	NC_008263	AT	3	6	8424	8429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008263	TA	3	6	8485	8490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008263	TA	3	6	9198	9203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008263	TA	3	6	9345	9350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008263	AT	3	6	9619	9624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008263	GT	4	8	9817	9824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008263	AT	3	6	10119	10124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008263	AG	3	6	10149	10154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008263	TA	3	6	10158	10163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008263	AT	3	6	10281	10286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008263	AT	3	6	10550	10555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008263	TA	3	6	11183	11188	50 %	50 %	0 %	0 %	110804006
43	NC_008263	TA	3	6	11659	11664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008263	TA	3	6	12339	12344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.