MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 plasmid pSM101A

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008263	TA	3	6	1247	1252	50 %	50 %	0 %	0 %	110804002
2	NC_008263	AT	4	8	2151	2158	50 %	50 %	0 %	0 %	110804008
3	NC_008263	AG	3	6	2189	2194	50 %	0 %	50 %	0 %	110804008
4	NC_008263	TA	3	6	2595	2600	50 %	50 %	0 %	0 %	110804008
5	NC_008263	TA	3	6	2726	2731	50 %	50 %	0 %	0 %	110804005
6	NC_008263	AT	3	6	4053	4058	50 %	50 %	0 %	0 %	110804004
7	NC_008263	TA	3	6	4235	4240	50 %	50 %	0 %	0 %	110804004
8	NC_008263	AT	3	6	4368	4373	50 %	50 %	0 %	0 %	110804004
9	NC_008263	AT	3	6	4436	4441	50 %	50 %	0 %	0 %	110804004
10	NC_008263	AG	3	6	5281	5286	50 %	0 %	50 %	0 %	110804003
11	NC_008263	TA	3	6	5768	5773	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
12	NC_008263	TA	4	8	6122	6129	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
13	NC_008263	AT	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
14	NC_008263	TA	3	6	6449	6454	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
15	NC_008263	TA	3	6	6562	6567	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
16	NC_008263	AT	3	6	6849	6854	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
17	NC_008263	TA	3	6	6983	6988	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
18	NC_008263	AT	3	6	7059	7064	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
19	NC_008263	TA	4	8	7079	7086	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
20	NC_008263	AT	3	6	7391	7396	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
21	NC_008263	TA	4	8	7413	7420	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
22	NC_008263	TA	3	6	7429	7434	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
23	NC_008263	AT	3	6	7960	7965	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
24	NC_008263	TA	3	6	11183	11188	50 %	50 %	0 %	0 %	110804006

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.