MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 9359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008262	AGAA	2	8	519	526	75 %	0 %	25 %	0 %	110803386
2	NC_008262	ATGC	2	8	743	750	25 %	25 %	25 %	25 %	110803386
3	NC_008262	AAAT	2	8	1923	1930	75 %	25 %	0 %	0 %	110803106
4	NC_008262	AAAC	2	8	2674	2681	75 %	0 %	0 %	25 %	110803106
5	NC_008262	AAGG	2	8	2719	2726	50 %	0 %	50 %	0 %	110803106
6	NC_008262	TACT	2	8	2863	2870	25 %	50 %	0 %	25 %	110803106
7	NC_008262	AATT	3	12	3410	3421	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
8	NC_008262	AATT	2	8	3710	3717	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
9	NC_008262	GAAA	2	8	3868	3875	75 %	0 %	25 %	0 %	110802319
10	NC_008262	GATA	2	8	4666	4673	50 %	25 %	25 %	0 %	110802474
11	NC_008262	ATTA	2	8	4733	4740	50 %	50 %	0 %	0 %	110802474
12	NC_008262	ATTT	2	8	4789	4796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008262	ATTT	2	8	4828	4835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008262	TACA	2	8	5179	5186	50 %	25 %	0 %	25 %	110803693
15	NC_008262	AATG	2	8	5874	5881	50 %	25 %	25 %	0 %	110803693
16	NC_008262	ATAA	2	8	6961	6968	75 %	25 %	0 %	0 %	110801534
17	NC_008262	TTAG	2	8	7189	7196	25 %	50 %	25 %	0 %	110801534
18	NC_008262	ACAT	2	8	7552	7559	50 %	25 %	0 %	25 %	110801534
19	NC_008262	TGCT	2	8	7919	7926	0 %	50 %	25 %	25 %	110801534
20	NC_008262	TTAT	2	8	8752	8759	25 %	75 %	0 %	0 %	110801534
21	NC_008262	AAGA	2	8	8814	8821	75 %	0 %	25 %	0 %	110801534
22	NC_008262	TGTA	2	8	9177	9184	25 %	50 %	25 %	0 %	110801534
23	NC_008262	ATAA	2	8	9543	9550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008262	AAAT	2	8	9625	9632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008262	GTGA	2	8	10394	10401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008262	GTTA	2	8	11084	11091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008262	AGAA	2	8	11909	11916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008262	GCGA	2	8	11938	11945	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008262	CATT	2	8	12802	12809	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008262	GCTA	2	8	13174	13181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008262	AGGT	2	8	13343	13350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008262	AAAT	2	8	15110	15117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008262	AATT	2	8	15744	15751	50 %	50 %	0 %	0 %	110801545
34	NC_008262	TAAA	2	8	15774	15781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008262	TTTA	2	8	16062	16069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008262	TATT	2	8	16329	16336	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
37	NC_008262	TTTA	2	8	16363	16370	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
38	NC_008262	TATT	2	8	16805	16812	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
39	NC_008262	AAAT	2	8	17355	17362	75 %	25 %	0 %	0 %	110802161
40	NC_008262	ATTT	2	8	17528	17535	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
41	NC_008262	GAAA	2	8	17684	17691	75 %	0 %	25 %	0 %	110802161
42	NC_008262	TAAT	2	8	17985	17992	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
43	NC_008262	TTTA	2	8	18016	18023	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
44	NC_008262	CAAA	2	8	18358	18365	75 %	0 %	0 %	25 %	110802161
45	NC_008262	ATGG	2	8	18392	18399	25 %	25 %	50 %	0 %	110802161
46	NC_008262	TTCT	2	8	18651	18658	0 %	75 %	0 %	25 %	110802161
47	NC_008262	ATTT	2	8	18813	18820	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
48	NC_008262	TAAA	2	8	18876	18883	75 %	25 %	0 %	0 %	110802161
49	NC_008262	TAAA	2	8	18994	19001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008262	AATA	2	8	19458	19465	75 %	25 %	0 %	0 %	110803344
51	NC_008262	ATTT	2	8	19468	19475	25 %	75 %	0 %	0 %	110803344
52	NC_008262	AAAG	2	8	19527	19534	75 %	0 %	25 %	0 %	110803344
53	NC_008262	TAAA	2	8	20162	20169	75 %	25 %	0 %	0 %	110803344
54	NC_008262	GATT	2	8	20634	20641	25 %	50 %	25 %	0 %	110803928
55	NC_008262	AGTT	2	8	21977	21984	25 %	50 %	25 %	0 %	110801909
56	NC_008262	ATAA	2	8	22449	22456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008262	ATTT	2	8	22870	22877	25 %	75 %	0 %	0 %	110802696
58	NC_008262	GATA	2	8	22995	23002	50 %	25 %	25 %	0 %	110802696
59	NC_008262	ATAA	2	8	23003	23010	75 %	25 %	0 %	0 %	110802696
60	NC_008262	GCGT	2	8	23387	23394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008262	TTTA	2	8	23582	23589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008262	TAAT	2	8	23662	23669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008262	TAAA	2	8	23714	23721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008262	TTTG	2	8	23757	23764	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008262	GCGT	2	8	24233	24240	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008262	ATTT	2	8	24747	24754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008262	ATGA	2	8	24840	24847	50 %	25 %	25 %	0 %	110803720
68	NC_008262	AAAT	2	8	25014	25021	75 %	25 %	0 %	0 %	110803720
69	NC_008262	ATTT	2	8	25454	25461	25 %	75 %	0 %	0 %	110803720
70	NC_008262	TAAG	2	8	25472	25479	50 %	25 %	25 %	0 %	110803720
71	NC_008262	GAAT	2	8	25548	25555	50 %	25 %	25 %	0 %	110803720
72	NC_008262	AAAT	2	8	26166	26173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008262	ATAA	2	8	26263	26270	75 %	25 %	0 %	0 %	110802216
74	NC_008262	AATT	2	8	26285	26292	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
75	NC_008262	GATG	2	8	26749	26756	25 %	25 %	50 %	0 %	110802216
76	NC_008262	AGAT	2	8	27293	27300	50 %	25 %	25 %	0 %	110802216
77	NC_008262	TGGA	2	8	27490	27497	25 %	25 %	50 %	0 %	110802216
78	NC_008262	GAAA	2	8	27635	27642	75 %	0 %	25 %	0 %	110802216
79	NC_008262	AGCA	2	8	27803	27810	50 %	0 %	25 %	25 %	110802216
80	NC_008262	GAAA	2	8	28413	28420	75 %	0 %	25 %	0 %	110802216
81	NC_008262	AAGG	2	8	28434	28441	50 %	0 %	50 %	0 %	110802216
82	NC_008262	AGAT	2	8	28815	28822	50 %	25 %	25 %	0 %	110802216
83	NC_008262	CCTT	2	8	28947	28954	0 %	50 %	0 %	50 %	110802216
84	NC_008262	TTTA	2	8	28967	28974	25 %	75 %	0 %	0 %	110802216
85	NC_008262	TAGA	2	8	28985	28992	50 %	25 %	25 %	0 %	110802216
86	NC_008262	TAAA	2	8	29069	29076	75 %	25 %	0 %	0 %	110802216
87	NC_008262	TTTA	2	8	29108	29115	25 %	75 %	0 %	0 %	110802216
88	NC_008262	AGAA	2	8	31215	31222	75 %	0 %	25 %	0 %	110802763
89	NC_008262	TAAA	2	8	31278	31285	75 %	25 %	0 %	0 %	110802763
90	NC_008262	TAAA	2	8	31821	31828	75 %	25 %	0 %	0 %	110802763
91	NC_008262	ATTT	2	8	31864	31871	25 %	75 %	0 %	0 %	110802763
92	NC_008262	ATAA	2	8	32021	32028	75 %	25 %	0 %	0 %	110802763
93	NC_008262	ATTA	2	8	32359	32366	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
94	NC_008262	AAAC	2	8	32619	32626	75 %	0 %	0 %	25 %	110802763
95	NC_008262	GGAT	2	8	33274	33281	25 %	25 %	50 %	0 %	110802763
96	NC_008262	ATAA	2	8	33338	33345	75 %	25 %	0 %	0 %	110802763
97	NC_008262	TAAA	2	8	33381	33388	75 %	25 %	0 %	0 %	110802763
98	NC_008262	TTCT	2	8	34229	34236	0 %	75 %	0 %	25 %	110802983
99	NC_008262	GAAA	2	8	34892	34899	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008262	AGAA	2	8	35815	35822	75 %	0 %	25 %	0 %	110803547
101	NC_008262	AAAT	2	8	36062	36069	75 %	25 %	0 %	0 %	110803943
102	NC_008262	TAAT	2	8	37015	37022	50 %	50 %	0 %	0 %	110803943
103	NC_008262	ATTT	2	8	37097	37104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008262	ATTT	2	8	37485	37492	25 %	75 %	0 %	0 %	110803414
105	NC_008262	TAAA	2	8	38165	38172	75 %	25 %	0 %	0 %	110803414
106	NC_008262	TAAA	2	8	38488	38495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008262	TAAT	2	8	38519	38526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008262	ATTT	2	8	38556	38563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008262	ACTT	2	8	38580	38587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008262	TAAT	2	8	39389	39396	50 %	50 %	0 %	0 %	110803370
111	NC_008262	TAAA	2	8	39444	39451	75 %	25 %	0 %	0 %	110803370
112	NC_008262	ATTT	2	8	39990	39997	25 %	75 %	0 %	0 %	110803517
113	NC_008262	TAAA	2	8	40051	40058	75 %	25 %	0 %	0 %	110803517
114	NC_008262	TTCT	2	8	40230	40237	0 %	75 %	0 %	25 %	110803517
115	NC_008262	ACTA	2	8	40401	40408	50 %	25 %	0 %	25 %	110803517
116	NC_008262	ATTT	2	8	40646	40653	25 %	75 %	0 %	0 %	110803517
117	NC_008262	ATAA	2	8	41058	41065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008262	CTAT	2	8	41306	41313	25 %	50 %	0 %	25 %	110802920
119	NC_008262	TCTT	2	8	41324	41331	0 %	75 %	0 %	25 %	110802920
120	NC_008262	CTTA	2	8	41941	41948	25 %	50 %	0 %	25 %	110802920
121	NC_008262	TAAA	2	8	43598	43605	75 %	25 %	0 %	0 %	110801484
122	NC_008262	CTAC	2	8	43781	43788	25 %	25 %	0 %	50 %	110801484
123	NC_008262	TAGA	2	8	44324	44331	50 %	25 %	25 %	0 %	110801484
124	NC_008262	ATGT	2	8	44598	44605	25 %	50 %	25 %	0 %	110803707
125	NC_008262	GTAA	2	8	44819	44826	50 %	25 %	25 %	0 %	110803707
126	NC_008262	TTAC	2	8	44831	44838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008262	AGTA	2	8	45356	45363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008262	TACT	2	8	45370	45377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008262	TAAT	2	8	45397	45404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008262	ATAA	2	8	45534	45541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008262	GAAG	2	8	45603	45610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008262	CCTA	2	8	46168	46175	25 %	25 %	0 %	50 %	110801812
133	NC_008262	ATCT	2	8	46601	46608	25 %	50 %	0 %	25 %	110802546
134	NC_008262	ATGA	2	8	47079	47086	50 %	25 %	25 %	0 %	110802546
135	NC_008262	TATT	2	8	47155	47162	25 %	75 %	0 %	0 %	110802546
136	NC_008262	TACT	2	8	47342	47349	25 %	50 %	0 %	25 %	110802546
137	NC_008262	TTGA	2	8	47804	47811	25 %	50 %	25 %	0 %	110802546
138	NC_008262	ATTT	2	8	47850	47857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008262	AAAG	2	8	48161	48168	75 %	0 %	25 %	0 %	110802823
140	NC_008262	TTGT	2	8	48182	48189	0 %	75 %	25 %	0 %	110802823
141	NC_008262	CATG	2	8	48372	48379	25 %	25 %	25 %	25 %	110802823
142	NC_008262	TCTT	2	8	49420	49427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008262	AATT	2	8	49711	49718	50 %	50 %	0 %	0 %	110803864
144	NC_008262	AATA	2	8	49879	49886	75 %	25 %	0 %	0 %	110803864
145	NC_008262	TAAG	2	8	50082	50089	50 %	25 %	25 %	0 %	110803864
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