MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 7038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008262	AGAA	2	8	519	526	75 %	0 %	25 %	0 %	110803386
2	NC_008262	ATGC	2	8	743	750	25 %	25 %	25 %	25 %	110803386
3	NC_008262	AAAT	2	8	1923	1930	75 %	25 %	0 %	0 %	110803106
4	NC_008262	AAAC	2	8	2674	2681	75 %	0 %	0 %	25 %	110803106
5	NC_008262	AAGG	2	8	2719	2726	50 %	0 %	50 %	0 %	110803106
6	NC_008262	TACT	2	8	2863	2870	25 %	50 %	0 %	25 %	110803106
7	NC_008262	AATT	3	12	3410	3421	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
8	NC_008262	AATT	2	8	3710	3717	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
9	NC_008262	GAAA	2	8	3868	3875	75 %	0 %	25 %	0 %	110802319
10	NC_008262	GATA	2	8	4666	4673	50 %	25 %	25 %	0 %	110802474
11	NC_008262	ATTA	2	8	4733	4740	50 %	50 %	0 %	0 %	110802474
12	NC_008262	TACA	2	8	5179	5186	50 %	25 %	0 %	25 %	110803693
13	NC_008262	AATG	2	8	5874	5881	50 %	25 %	25 %	0 %	110803693
14	NC_008262	ATAA	2	8	6961	6968	75 %	25 %	0 %	0 %	110801534
15	NC_008262	TTAG	2	8	7189	7196	25 %	50 %	25 %	0 %	110801534
16	NC_008262	ACAT	2	8	7552	7559	50 %	25 %	0 %	25 %	110801534
17	NC_008262	TGCT	2	8	7919	7926	0 %	50 %	25 %	25 %	110801534
18	NC_008262	TTAT	2	8	8752	8759	25 %	75 %	0 %	0 %	110801534
19	NC_008262	AAGA	2	8	8814	8821	75 %	0 %	25 %	0 %	110801534
20	NC_008262	TGTA	2	8	9177	9184	25 %	50 %	25 %	0 %	110801534
21	NC_008262	AATT	2	8	15744	15751	50 %	50 %	0 %	0 %	110801545
22	NC_008262	TATT	2	8	16329	16336	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
23	NC_008262	TTTA	2	8	16363	16370	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
24	NC_008262	TATT	2	8	16805	16812	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
25	NC_008262	AAAT	2	8	17355	17362	75 %	25 %	0 %	0 %	110802161
26	NC_008262	ATTT	2	8	17528	17535	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
27	NC_008262	GAAA	2	8	17684	17691	75 %	0 %	25 %	0 %	110802161
28	NC_008262	TAAT	2	8	17985	17992	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
29	NC_008262	TTTA	2	8	18016	18023	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
30	NC_008262	CAAA	2	8	18358	18365	75 %	0 %	0 %	25 %	110802161
31	NC_008262	ATGG	2	8	18392	18399	25 %	25 %	50 %	0 %	110802161
32	NC_008262	TTCT	2	8	18651	18658	0 %	75 %	0 %	25 %	110802161
33	NC_008262	ATTT	2	8	18813	18820	25 %	75 %	0 %	0 %	110802161
34	NC_008262	TAAA	2	8	18876	18883	75 %	25 %	0 %	0 %	110802161
35	NC_008262	AATA	2	8	19458	19465	75 %	25 %	0 %	0 %	110803344
36	NC_008262	ATTT	2	8	19468	19475	25 %	75 %	0 %	0 %	110803344
37	NC_008262	AAAG	2	8	19527	19534	75 %	0 %	25 %	0 %	110803344
38	NC_008262	TAAA	2	8	20162	20169	75 %	25 %	0 %	0 %	110803344
39	NC_008262	GATT	2	8	20634	20641	25 %	50 %	25 %	0 %	110803928
40	NC_008262	AGTT	2	8	21977	21984	25 %	50 %	25 %	0 %	110801909
41	NC_008262	ATTT	2	8	22870	22877	25 %	75 %	0 %	0 %	110802696
42	NC_008262	GATA	2	8	22995	23002	50 %	25 %	25 %	0 %	110802696
43	NC_008262	ATAA	2	8	23003	23010	75 %	25 %	0 %	0 %	110802696
44	NC_008262	ATGA	2	8	24840	24847	50 %	25 %	25 %	0 %	110803720
45	NC_008262	AAAT	2	8	25014	25021	75 %	25 %	0 %	0 %	110803720
46	NC_008262	ATTT	2	8	25454	25461	25 %	75 %	0 %	0 %	110803720
47	NC_008262	TAAG	2	8	25472	25479	50 %	25 %	25 %	0 %	110803720
48	NC_008262	GAAT	2	8	25548	25555	50 %	25 %	25 %	0 %	110803720
49	NC_008262	ATAA	2	8	26263	26270	75 %	25 %	0 %	0 %	110802216
50	NC_008262	AATT	2	8	26285	26292	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
51	NC_008262	GATG	2	8	26749	26756	25 %	25 %	50 %	0 %	110802216
52	NC_008262	AGAT	2	8	27293	27300	50 %	25 %	25 %	0 %	110802216
53	NC_008262	TGGA	2	8	27490	27497	25 %	25 %	50 %	0 %	110802216
54	NC_008262	GAAA	2	8	27635	27642	75 %	0 %	25 %	0 %	110802216
55	NC_008262	AGCA	2	8	27803	27810	50 %	0 %	25 %	25 %	110802216
56	NC_008262	GAAA	2	8	28413	28420	75 %	0 %	25 %	0 %	110802216
57	NC_008262	AAGG	2	8	28434	28441	50 %	0 %	50 %	0 %	110802216
58	NC_008262	AGAT	2	8	28815	28822	50 %	25 %	25 %	0 %	110802216
59	NC_008262	CCTT	2	8	28947	28954	0 %	50 %	0 %	50 %	110802216
60	NC_008262	TTTA	2	8	28967	28974	25 %	75 %	0 %	0 %	110802216
61	NC_008262	TAGA	2	8	28985	28992	50 %	25 %	25 %	0 %	110802216
62	NC_008262	TAAA	2	8	29069	29076	75 %	25 %	0 %	0 %	110802216
63	NC_008262	TTTA	2	8	29108	29115	25 %	75 %	0 %	0 %	110802216
64	NC_008262	AGAA	2	8	31215	31222	75 %	0 %	25 %	0 %	110802763
65	NC_008262	TAAA	2	8	31278	31285	75 %	25 %	0 %	0 %	110802763
66	NC_008262	TAAA	2	8	31821	31828	75 %	25 %	0 %	0 %	110802763
67	NC_008262	ATTT	2	8	31864	31871	25 %	75 %	0 %	0 %	110802763
68	NC_008262	ATAA	2	8	32021	32028	75 %	25 %	0 %	0 %	110802763
69	NC_008262	ATTA	2	8	32359	32366	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
70	NC_008262	AAAC	2	8	32619	32626	75 %	0 %	0 %	25 %	110802763
71	NC_008262	GGAT	2	8	33274	33281	25 %	25 %	50 %	0 %	110802763
72	NC_008262	ATAA	2	8	33338	33345	75 %	25 %	0 %	0 %	110802763
73	NC_008262	TAAA	2	8	33381	33388	75 %	25 %	0 %	0 %	110802763
74	NC_008262	TTCT	2	8	34229	34236	0 %	75 %	0 %	25 %	110802983
75	NC_008262	AGAA	2	8	35815	35822	75 %	0 %	25 %	0 %	110803547
76	NC_008262	AAAT	2	8	36062	36069	75 %	25 %	0 %	0 %	110803943
77	NC_008262	TAAT	2	8	37015	37022	50 %	50 %	0 %	0 %	110803943
78	NC_008262	ATTT	2	8	37485	37492	25 %	75 %	0 %	0 %	110803414
79	NC_008262	TAAA	2	8	38165	38172	75 %	25 %	0 %	0 %	110803414
80	NC_008262	TAAT	2	8	39389	39396	50 %	50 %	0 %	0 %	110803370
81	NC_008262	TAAA	2	8	39444	39451	75 %	25 %	0 %	0 %	110803370
82	NC_008262	ATTT	2	8	39990	39997	25 %	75 %	0 %	0 %	110803517
83	NC_008262	TAAA	2	8	40051	40058	75 %	25 %	0 %	0 %	110803517
84	NC_008262	TTCT	2	8	40230	40237	0 %	75 %	0 %	25 %	110803517
85	NC_008262	ACTA	2	8	40401	40408	50 %	25 %	0 %	25 %	110803517
86	NC_008262	ATTT	2	8	40646	40653	25 %	75 %	0 %	0 %	110803517
87	NC_008262	CTAT	2	8	41306	41313	25 %	50 %	0 %	25 %	110802920
88	NC_008262	TCTT	2	8	41324	41331	0 %	75 %	0 %	25 %	110802920
89	NC_008262	CTTA	2	8	41941	41948	25 %	50 %	0 %	25 %	110802920
90	NC_008262	TAAA	2	8	43598	43605	75 %	25 %	0 %	0 %	110801484
91	NC_008262	CTAC	2	8	43781	43788	25 %	25 %	0 %	50 %	110801484
92	NC_008262	TAGA	2	8	44324	44331	50 %	25 %	25 %	0 %	110801484
93	NC_008262	ATGT	2	8	44598	44605	25 %	50 %	25 %	0 %	110803707
94	NC_008262	GTAA	2	8	44819	44826	50 %	25 %	25 %	0 %	110803707
95	NC_008262	CCTA	2	8	46168	46175	25 %	25 %	0 %	50 %	110801812
96	NC_008262	ATCT	2	8	46601	46608	25 %	50 %	0 %	25 %	110802546
97	NC_008262	ATGA	2	8	47079	47086	50 %	25 %	25 %	0 %	110802546
98	NC_008262	TATT	2	8	47155	47162	25 %	75 %	0 %	0 %	110802546
99	NC_008262	TACT	2	8	47342	47349	25 %	50 %	0 %	25 %	110802546
100	NC_008262	TTGA	2	8	47804	47811	25 %	50 %	25 %	0 %	110802546
101	NC_008262	AAAG	2	8	48161	48168	75 %	0 %	25 %	0 %	110802823
102	NC_008262	TTGT	2	8	48182	48189	0 %	75 %	25 %	0 %	110802823
103	NC_008262	CATG	2	8	48372	48379	25 %	25 %	25 %	25 %	110802823
104	NC_008262	AATT	2	8	49711	49718	50 %	50 %	0 %	0 %	110803864
105	NC_008262	AATA	2	8	49879	49886	75 %	25 %	0 %	0 %	110803864
106	NC_008262	TAAG	2	8	50082	50089	50 %	25 %	25 %	0 %	110803864
107	NC_008262	AGAA	2	8	50098	50105	75 %	0 %	25 %	0 %	110803864
108	NC_008262	TAAA	2	8	50433	50440	75 %	25 %	0 %	0 %	110803864
109	NC_008262	TAAA	2	8	50914	50921	75 %	25 %	0 %	0 %	110802115
110	NC_008262	AAGG	2	8	51012	51019	50 %	0 %	50 %	0 %	110802115
111	NC_008262	AAAG	2	8	51039	51046	75 %	0 %	25 %	0 %	110802115
112	NC_008262	TAAA	2	8	51084	51091	75 %	25 %	0 %	0 %	110801537
113	NC_008262	ATTT	2	8	53105	53112	25 %	75 %	0 %	0 %	110802679
114	NC_008262	ATTT	2	8	53262	53269	25 %	75 %	0 %	0 %	110802679
115	NC_008262	AGAT	2	8	53541	53548	50 %	25 %	25 %	0 %	110802679
116	NC_008262	TTAG	2	8	53659	53666	25 %	50 %	25 %	0 %	110802679
117	NC_008262	CAAT	2	8	54611	54618	50 %	25 %	0 %	25 %	110802003
118	NC_008262	ATTT	2	8	55815	55822	25 %	75 %	0 %	0 %	110802801
119	NC_008262	CTTG	2	8	56303	56310	0 %	50 %	25 %	25 %	110802801
120	NC_008262	ATTC	2	8	56530	56537	25 %	50 %	0 %	25 %	110802801
121	NC_008262	CTTA	2	8	56587	56594	25 %	50 %	0 %	25 %	110802801
122	NC_008262	TTTG	2	8	57088	57095	0 %	75 %	25 %	0 %	110802411
123	NC_008262	TTTA	2	8	57326	57333	25 %	75 %	0 %	0 %	110802411
124	NC_008262	TATT	2	8	58324	58331	25 %	75 %	0 %	0 %	110802027
125	NC_008262	CTTT	2	8	58413	58420	0 %	75 %	0 %	25 %	110802027
126	NC_008262	AATT	2	8	58807	58814	50 %	50 %	0 %	0 %	110802620
127	NC_008262	TAAA	2	8	59040	59047	75 %	25 %	0 %	0 %	110802620
128	NC_008262	TATT	2	8	59325	59332	25 %	75 %	0 %	0 %	110802620
129	NC_008262	TAAT	2	8	59583	59590	50 %	50 %	0 %	0 %	110803070
130	NC_008262	TCTT	2	8	60426	60433	0 %	75 %	0 %	25 %	110802975
131	NC_008262	ATTT	2	8	60937	60944	25 %	75 %	0 %	0 %	110803673
132	NC_008262	ATTT	2	8	61558	61565	25 %	75 %	0 %	0 %	110803673
133	NC_008262	TTTA	2	8	61861	61868	25 %	75 %	0 %	0 %	110803673
134	NC_008262	AATA	2	8	61934	61941	75 %	25 %	0 %	0 %	110803673
135	NC_008262	AAGA	2	8	62272	62279	75 %	0 %	25 %	0 %	110803673
136	NC_008262	AAGC	2	8	62622	62629	50 %	0 %	25 %	25 %	110801488
137	NC_008262	CAAT	2	8	62652	62659	50 %	25 %	0 %	25 %	110801488
138	NC_008262	GAAA	2	8	62731	62738	75 %	0 %	25 %	0 %	110801488
139	NC_008262	AAGC	2	8	62823	62830	50 %	0 %	25 %	25 %	110801488
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