MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 38993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008262	AGA	2	6	231	236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803386
2	NC_008262	AAT	2	6	251	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803386
3	NC_008262	ATA	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803386
4	NC_008262	TTA	2	6	419	424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803386
5	NC_008262	AGA	3	9	490	498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803386
6	NC_008262	GAA	2	6	529	534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803386
7	NC_008262	ATA	2	6	537	542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803386
8	NC_008262	ATG	2	6	546	551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803386
9	NC_008262	TGA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803386
10	NC_008262	GCA	2	6	653	658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110803386
11	NC_008262	ATT	2	6	700	705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803386
12	NC_008262	TGG	2	6	712	717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110803386
13	NC_008262	TTC	2	6	765	770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110803386
14	NC_008262	AGT	2	6	790	795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803386
15	NC_008262	ATC	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803386
16	NC_008262	TTA	2	6	828	833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803386
17	NC_008262	GAT	2	6	845	850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803386
18	NC_008262	TTA	2	6	893	898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803386
19	NC_008262	GAT	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803386
20	NC_008262	AAG	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803386
21	NC_008262	TTC	2	6	947	952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110803386
22	NC_008262	ATC	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803386
23	NC_008262	ACC	2	6	1009	1014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110803386
24	NC_008262	AGA	2	6	1033	1038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803386
25	NC_008262	ACC	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110803386
26	NC_008262	CTA	2	6	1176	1181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803386
27	NC_008262	AAT	2	6	1225	1230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803386
28	NC_008262	ATA	2	6	1295	1300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803386
29	NC_008262	TAA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803386
30	NC_008262	ATT	2	6	1356	1361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803386
31	NC_008262	AGA	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803386
32	NC_008262	GAA	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803386
33	NC_008262	TGG	2	6	1489	1494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110803386
34	NC_008262	TAC	2	6	1504	1509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803386
35	NC_008262	TGA	2	6	1552	1557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803386
36	NC_008262	CAA	2	6	1976	1981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110803106
37	NC_008262	TAG	2	6	2102	2107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803106
38	NC_008262	TAA	2	6	2132	2137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803106
39	NC_008262	AGA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803106
40	NC_008262	TTA	2	6	2221	2226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803106
41	NC_008262	AGA	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803106
42	NC_008262	CTT	2	6	2324	2329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110803106
43	NC_008262	TTC	2	6	2360	2365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110803106
44	NC_008262	TAT	2	6	2372	2377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803106
45	NC_008262	TAG	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803106
46	NC_008262	AGA	2	6	2517	2522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803106
47	NC_008262	ATT	2	6	2565	2570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803106
48	NC_008262	ATG	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803106
49	NC_008262	TTA	2	6	2635	2640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803106
50	NC_008262	TGA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803106
51	NC_008262	AGA	2	6	2805	2810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803106
52	NC_008262	TAT	2	6	2937	2942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803106
53	NC_008262	AAG	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802524
54	NC_008262	TGA	2	6	3290	3295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802524
55	NC_008262	AGA	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802319
56	NC_008262	AAG	3	9	3783	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802319
57	NC_008262	TAT	2	6	3829	3834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802319
58	NC_008262	ATA	2	6	3851	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802319
59	NC_008262	AGA	2	6	4035	4040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802319
60	NC_008262	ATA	2	6	4079	4084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802319
61	NC_008262	GAT	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802319
62	NC_008262	ATA	2	6	4190	4195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802319
63	NC_008262	ATA	2	6	4270	4275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802319
64	NC_008262	TTA	3	9	4303	4311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802319
65	NC_008262	GAT	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802319
66	NC_008262	TAA	2	6	4385	4390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802319
67	NC_008262	AGA	2	6	4404	4409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802319
68	NC_008262	GTA	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802474
69	NC_008262	TTG	2	6	4617	4622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110802474
70	NC_008262	TCA	2	6	4703	4708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110802474
71	NC_008262	ATG	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803693
72	NC_008262	GTA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803693
73	NC_008262	TCA	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803693
74	NC_008262	TTG	2	6	5123	5128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110803693
75	NC_008262	TGA	2	6	5139	5144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803693
76	NC_008262	TGA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803693
77	NC_008262	GGA	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110803693
78	NC_008262	TGG	2	6	5331	5336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110803693
79	NC_008262	GAA	2	6	5524	5529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803693
80	NC_008262	TGA	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803693
81	NC_008262	AGA	2	6	5619	5624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803693
82	NC_008262	AGA	2	6	5634	5639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803693
83	NC_008262	GGT	2	6	5656	5661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110803693
84	NC_008262	ATG	2	6	5708	5713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803693
85	NC_008262	ATG	2	6	5774	5779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803693
86	NC_008262	TAA	2	6	5808	5813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803693
87	NC_008262	GGT	2	6	5830	5835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110803693
88	NC_008262	AGA	2	6	5890	5895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803693
89	NC_008262	CTG	2	6	5957	5962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110803693
90	NC_008262	AGA	2	6	6081	6086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803693
91	NC_008262	TTA	2	6	6124	6129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803693
92	NC_008262	AAG	2	6	6153	6158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803693
93	NC_008262	AAG	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803693
94	NC_008262	TCA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803693
95	NC_008262	TGG	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110803693
96	NC_008262	AAT	2	6	6342	6347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803693
97	NC_008262	ATA	2	6	6461	6466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803693
98	NC_008262	AAT	3	9	6468	6476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803693
99	NC_008262	TAT	2	6	6518	6523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803693
100	NC_008262	TTC	2	6	6529	6534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110803693
101	NC_008262	ACC	2	6	6585	6590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110803693
102	NC_008262	TGC	3	9	6639	6647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110803693
103	NC_008262	ATA	2	6	6655	6660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803693
104	NC_008262	TGG	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110803693
105	NC_008262	TAG	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803693
106	NC_008262	ACT	2	6	6745	6750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803693
107	NC_008262	ATT	2	6	6771	6776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803693
108	NC_008262	TGA	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803693
109	NC_008262	AAG	2	6	6849	6854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803693
110	NC_008262	AGA	2	6	6866	6871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803693
111	NC_008262	TTG	2	6	7010	7015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110801534
112	NC_008262	AGA	2	6	7060	7065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801534
113	NC_008262	ACC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110801534
114	NC_008262	TCA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110801534
115	NC_008262	ATG	2	6	7181	7186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801534
116	NC_008262	TTG	2	6	7229	7234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110801534
117	NC_008262	CAG	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110801534
118	NC_008262	TAA	2	6	7338	7343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801534
119	NC_008262	TCA	2	6	7435	7440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110801534
120	NC_008262	CTA	2	6	7460	7465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110801534
121	NC_008262	ACC	2	6	7470	7475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110801534
122	NC_008262	CAG	2	6	7580	7585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110801534
123	NC_008262	AAT	3	9	7587	7595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801534
124	NC_008262	GCT	2	6	7615	7620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110801534
125	NC_008262	TAG	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801534
126	NC_008262	ATA	2	6	7693	7698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801534
127	NC_008262	TAA	2	6	7722	7727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801534
128	NC_008262	AGA	2	6	8008	8013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801534
129	NC_008262	TAA	2	6	8028	8033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801534
130	NC_008262	TAA	2	6	8066	8071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801534
131	NC_008262	ATA	2	6	8081	8086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801534
132	NC_008262	TGA	2	6	8088	8093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801534
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134	NC_008262	GCT	2	6	8179	8184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110801534
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136	NC_008262	ATT	2	6	8307	8312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801534
137	NC_008262	AGA	2	6	8325	8330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801534
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150	NC_008262	AAG	2	6	9185	9190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801534
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152	NC_008262	AGA	2	6	9300	9305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801534
153	NC_008262	TGT	2	6	9312	9317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110801534
154	NC_008262	GAA	3	9	9355	9363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801534
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157	NC_008262	AGA	2	6	9405	9410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801534
158	NC_008262	GAA	2	6	9433	9438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801534
159	NC_008262	TAA	2	6	9442	9447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801534
160	NC_008262	ATT	2	6	15473	15478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801545
161	NC_008262	TTA	2	6	15599	15604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801545
162	NC_008262	GAT	2	6	15642	15647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801545
163	NC_008262	TGA	2	6	15734	15739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801545
164	NC_008262	TTA	2	6	16191	16196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802161
165	NC_008262	TAT	2	6	16240	16245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802161
166	NC_008262	AAG	2	6	16424	16429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802161
167	NC_008262	TAT	2	6	16437	16442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802161
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