MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 2597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008261	ATTCA	2	10	1083	1092	40 %	40 %	0 %	20 %	110799791
2	NC_008261	AAATC	2	10	1357	1366	60 %	20 %	0 %	20 %	110799791
3	NC_008261	ACAAT	2	10	2635	2644	60 %	20 %	0 %	20 %	110798947
4	NC_008261	AACAT	2	10	2715	2724	60 %	20 %	0 %	20 %	110798947
5	NC_008261	AACTA	2	10	8939	8948	60 %	20 %	0 %	20 %	110800886
6	NC_008261	ATATT	2	10	9070	9079	40 %	60 %	0 %	0 %	110800886
7	NC_008261	AGTTT	2	10	15516	15525	20 %	60 %	20 %	0 %	110799285
8	NC_008261	ATTAT	2	10	15670	15679	40 %	60 %	0 %	0 %	110799285
9	NC_008261	AAATG	2	10	17170	17179	60 %	20 %	20 %	0 %	110798661
10	NC_008261	AGAAT	2	10	18582	18591	60 %	20 %	20 %	0 %	110798661
11	NC_008261	TAAAT	2	10	20292	20301	60 %	40 %	0 %	0 %	110800557
12	NC_008261	TAGAA	2	10	25634	25643	60 %	20 %	20 %	0 %	110800432
13	NC_008261	AAAAT	2	10	28437	28446	80 %	20 %	0 %	0 %	110798865
14	NC_008261	TAAAT	2	10	28924	28933	60 %	40 %	0 %	0 %	110798865
15	NC_008261	AGCAA	2	10	31895	31904	60 %	0 %	20 %	20 %	110799297
16	NC_008261	ATCAC	2	10	35600	35609	40 %	20 %	0 %	40 %	110799108
17	NC_008261	AATAT	2	10	36821	36830	60 %	40 %	0 %	0 %	110799840
18	NC_008261	AGAAA	2	10	38061	38070	80 %	0 %	20 %	0 %	110800422
19	NC_008261	AAATA	2	10	42480	42489	80 %	20 %	0 %	0 %	110801421
20	NC_008261	TGATA	2	10	44044	44053	40 %	40 %	20 %	0 %	110800603
21	NC_008261	ATGAA	2	10	44767	44776	60 %	20 %	20 %	0 %	110800043
22	NC_008261	ATGTT	2	10	45085	45094	20 %	60 %	20 %	0 %	110800043
23	NC_008261	TCATA	2	10	46121	46130	40 %	40 %	0 %	20 %	110799578
24	NC_008261	AAATA	2	10	47348	47357	80 %	20 %	0 %	0 %	110799806
25	NC_008261	ATAGT	2	10	47400	47409	40 %	40 %	20 %	0 %	110799806
26	NC_008261	TATAA	2	10	49545	49554	60 %	40 %	0 %	0 %	110800852
27	NC_008261	TTAAT	2	10	51027	51036	40 %	60 %	0 %	0 %	110799721
28	NC_008261	TAGTA	2	10	51315	51324	40 %	40 %	20 %	0 %	261876155
29	NC_008261	AATTT	2	10	52193	52202	40 %	60 %	0 %	0 %	110801031
30	NC_008261	TAAAT	2	10	54959	54968	60 %	40 %	0 %	0 %	110799596
31	NC_008261	AGGCA	2	10	61764	61773	40 %	0 %	40 %	20 %	110800126
32	NC_008261	TTTCT	2	10	61939	61948	0 %	80 %	0 %	20 %	110800126
33	NC_008261	ATTTA	2	10	63364	63373	40 %	60 %	0 %	0 %	110801125
34	NC_008261	AAGTT	2	10	64161	64170	40 %	40 %	20 %	0 %	110799142
35	NC_008261	TAAAT	2	10	66572	66581	60 %	40 %	0 %	0 %	110800818
36	NC_008261	GGAAT	2	10	67170	67179	40 %	20 %	40 %	0 %	110798765
37	NC_008261	CATAT	2	10	67441	67450	40 %	40 %	0 %	20 %	110798765
38	NC_008261	GTTTA	2	10	69678	69687	20 %	60 %	20 %	0 %	110800426
39	NC_008261	AAGAT	2	10	69750	69759	60 %	20 %	20 %	0 %	110800426
40	NC_008261	TATAA	2	10	69878	69887	60 %	40 %	0 %	0 %	110800426
41	NC_008261	TAGTT	2	10	70180	70189	20 %	60 %	20 %	0 %	110800426
42	NC_008261	AGTAA	2	10	70327	70336	60 %	20 %	20 %	0 %	110800426
43	NC_008261	AAAAT	2	10	70997	71006	80 %	20 %	0 %	0 %	110801197
44	NC_008261	ATTAT	2	10	77810	77819	40 %	60 %	0 %	0 %	110800004
45	NC_008261	CTTTA	2	10	87978	87987	20 %	60 %	0 %	20 %	110800853
46	NC_008261	GAAAA	2	10	88392	88401	80 %	0 %	20 %	0 %	110800853
47	NC_008261	GATAA	2	10	88895	88904	60 %	20 %	20 %	0 %	110800853
48	NC_008261	AAATT	2	10	89412	89421	60 %	40 %	0 %	0 %	110800853
49	NC_008261	TACAT	2	10	89578	89587	40 %	40 %	0 %	20 %	110800853
50	NC_008261	TGGAA	2	10	89779	89788	40 %	20 %	40 %	0 %	110800853
51	NC_008261	GAATG	2	10	93816	93825	40 %	20 %	40 %	0 %	110800392
52	NC_008261	AAGAG	2	10	96202	96211	60 %	0 %	40 %	0 %	110799131
53	NC_008261	AATGC	2	10	96326	96335	40 %	20 %	20 %	20 %	110799131
54	NC_008261	GAAAA	2	10	97538	97547	80 %	0 %	20 %	0 %	110800026
55	NC_008261	AAGAG	2	10	98132	98141	60 %	0 %	40 %	0 %	110800026
56	NC_008261	TAAAA	2	10	98712	98721	80 %	20 %	0 %	0 %	110798642
57	NC_008261	CAAAA	2	10	99546	99555	80 %	0 %	0 %	20 %	110801040
58	NC_008261	GAAAA	2	10	102514	102523	80 %	0 %	20 %	0 %	110800111
59	NC_008261	AAGAA	2	10	103094	103103	80 %	0 %	20 %	0 %	110800111
60	NC_008261	CAAAT	2	10	105445	105454	60 %	20 %	0 %	20 %	110799870
61	NC_008261	AATTT	2	10	106535	106544	40 %	60 %	0 %	0 %	110801109
62	NC_008261	AAAAG	2	10	107633	107642	80 %	0 %	20 %	0 %	110801121
63	NC_008261	GAAAT	2	10	112758	112767	60 %	20 %	20 %	0 %	110799394
64	NC_008261	AATTA	2	10	113597	113606	60 %	40 %	0 %	0 %	110799394
65	NC_008261	AGATA	2	10	113609	113618	60 %	20 %	20 %	0 %	110799394
66	NC_008261	CTAAT	2	10	118161	118170	40 %	40 %	0 %	20 %	110800638
67	NC_008261	TAATT	2	10	121144	121153	40 %	60 %	0 %	0 %	110798663
68	NC_008261	AGAAA	2	10	122540	122549	80 %	0 %	20 %	0 %	110800459
69	NC_008261	AATTA	2	10	122746	122755	60 %	40 %	0 %	0 %	110800459
70	NC_008261	CTATT	2	10	123640	123649	20 %	60 %	0 %	20 %	110798691
71	NC_008261	CTTAT	2	10	126768	126777	20 %	60 %	0 %	20 %	110799003
72	NC_008261	TAACA	2	10	128156	128165	60 %	20 %	0 %	20 %	110799003
73	NC_008261	TTCTT	2	10	128388	128397	0 %	80 %	0 %	20 %	110799461
74	NC_008261	CAAGA	2	10	129455	129464	60 %	0 %	20 %	20 %	110800767
75	NC_008261	GATTA	2	10	129701	129710	40 %	40 %	20 %	0 %	110800767
76	NC_008261	GTAAT	2	10	130313	130322	40 %	40 %	20 %	0 %	110800767
77	NC_008261	ATTTT	2	10	132185	132194	20 %	80 %	0 %	0 %	110799774
78	NC_008261	ATTTC	2	10	132596	132605	20 %	60 %	0 %	20 %	110800644
79	NC_008261	TATAT	2	10	135433	135442	40 %	60 %	0 %	0 %	110799956
80	NC_008261	TAGAT	2	10	135909	135918	40 %	40 %	20 %	0 %	110800417
81	NC_008261	AAGAG	2	10	135961	135970	60 %	0 %	40 %	0 %	110800417
82	NC_008261	TTAAT	2	10	137714	137723	40 %	60 %	0 %	0 %	110799157
83	NC_008261	TGGAA	2	10	139437	139446	40 %	20 %	40 %	0 %	110800368
84	NC_008261	ATTAA	2	10	139693	139702	60 %	40 %	0 %	0 %	110800368
85	NC_008261	ATACC	2	10	141651	141660	40 %	20 %	0 %	40 %	110799196
86	NC_008261	ATTTA	2	10	141688	141697	40 %	60 %	0 %	0 %	110799196
87	NC_008261	ATTTT	2	10	141761	141770	20 %	80 %	0 %	0 %	110799196
88	NC_008261	AGAAA	2	10	142259	142268	80 %	0 %	20 %	0 %	110799597
89	NC_008261	TTAAA	2	10	142341	142350	60 %	40 %	0 %	0 %	110799597
90	NC_008261	AGGTA	2	10	145063	145072	40 %	20 %	40 %	0 %	110798879
91	NC_008261	TAAAT	2	10	146566	146575	60 %	40 %	0 %	0 %	110798879
92	NC_008261	AGTAA	2	10	148615	148624	60 %	20 %	20 %	0 %	110800193
93	NC_008261	AGTTT	2	10	150662	150671	20 %	60 %	20 %	0 %	110800621
94	NC_008261	AAAAG	2	10	150712	150721	80 %	0 %	20 %	0 %	110800621
95	NC_008261	TAAAA	2	10	153580	153589	80 %	20 %	0 %	0 %	110801077
96	NC_008261	TAACA	2	10	154620	154629	60 %	20 %	0 %	20 %	110799419
97	NC_008261	AAGAG	2	10	155790	155799	60 %	0 %	40 %	0 %	110799435
98	NC_008261	ATTTA	2	10	160300	160309	40 %	60 %	0 %	0 %	110798656
99	NC_008261	GATGA	2	10	161616	161625	40 %	20 %	40 %	0 %	110800414
100	NC_008261	TAAAT	2	10	163410	163419	60 %	40 %	0 %	0 %	110800701
101	NC_008261	GAAAT	2	10	163679	163688	60 %	20 %	20 %	0 %	110800701
102	NC_008261	AATAG	2	10	164029	164038	60 %	20 %	20 %	0 %	110800701
103	NC_008261	TAAGA	2	10	164616	164625	60 %	20 %	20 %	0 %	110800701
104	NC_008261	ATATA	2	10	164747	164756	60 %	40 %	0 %	0 %	110800701
105	NC_008261	AAATT	2	10	166523	166532	60 %	40 %	0 %	0 %	110798956
106	NC_008261	ATGGA	2	10	166725	166734	40 %	20 %	40 %	0 %	110798956
107	NC_008261	TTTAA	2	10	167453	167462	40 %	60 %	0 %	0 %	110801371
108	NC_008261	TAAAG	2	10	168309	168318	60 %	20 %	20 %	0 %	110800148
109	NC_008261	AAAAG	2	10	169018	169027	80 %	0 %	20 %	0 %	110800148
110	NC_008261	ATTAT	2	10	172414	172423	40 %	60 %	0 %	0 %	110799180
111	NC_008261	ATAAA	2	10	173166	173175	80 %	20 %	0 %	0 %	110799180
112	NC_008261	AGAAA	2	10	176802	176811	80 %	0 %	20 %	0 %	110799552
113	NC_008261	ATTAA	2	10	176941	176950	60 %	40 %	0 %	0 %	110799552
114	NC_008261	ACTTT	2	10	178198	178207	20 %	60 %	0 %	20 %	110801253
115	NC_008261	TAACA	2	10	178416	178425	60 %	20 %	0 %	20 %	110801253
116	NC_008261	AGAGT	2	10	181063	181072	40 %	20 %	40 %	0 %	110801199
117	NC_008261	TGATT	2	10	186067	186076	20 %	60 %	20 %	0 %	110800486
118	NC_008261	TTATT	2	10	187874	187883	20 %	80 %	0 %	0 %	110799203
119	NC_008261	AAATA	2	10	191064	191073	80 %	20 %	0 %	0 %	110800290
120	NC_008261	AAGGA	2	10	192226	192235	60 %	0 %	40 %	0 %	110800897
121	NC_008261	TTACT	2	10	192372	192381	20 %	60 %	0 %	20 %	110800897
122	NC_008261	ATTAA	2	10	192621	192630	60 %	40 %	0 %	0 %	110800897
123	NC_008261	ATGGA	2	10	193343	193352	40 %	20 %	40 %	0 %	110801213
124	NC_008261	TAAAT	2	10	195080	195089	60 %	40 %	0 %	0 %	110799455
125	NC_008261	GCTAT	2	10	195344	195353	20 %	40 %	20 %	20 %	110799455
126	NC_008261	GAAAA	2	10	195463	195472	80 %	0 %	20 %	0 %	110799455
127	NC_008261	CTTTA	2	10	197688	197697	20 %	60 %	0 %	20 %	110798785
128	NC_008261	TTTAT	2	10	197704	197713	20 %	80 %	0 %	0 %	110798785
129	NC_008261	AATAG	2	10	198490	198499	60 %	20 %	20 %	0 %	110798785
130	NC_008261	ACAAA	2	10	200925	200934	80 %	0 %	0 %	20 %	110798785
131	NC_008261	TTTGA	2	10	205213	205222	20 %	60 %	20 %	0 %	110799571
132	NC_008261	CATAA	2	10	208672	208681	60 %	20 %	0 %	20 %	110799684
133	NC_008261	GAAGT	2	10	210488	210497	40 %	20 %	40 %	0 %	110799541
134	NC_008261	AAGCA	2	10	211641	211650	60 %	0 %	20 %	20 %	110800735
135	NC_008261	AAAGA	2	10	212042	212051	80 %	0 %	20 %	0 %	110800696
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