MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 8211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008261	AGAA	2	8	694	701	75 %	0 %	25 %	0 %	110799791
2	NC_008261	ATGC	2	8	918	925	25 %	25 %	25 %	25 %	110799791
3	NC_008261	AAAT	2	8	2099	2106	75 %	25 %	0 %	0 %	110798947
4	NC_008261	AGTT	2	8	2275	2282	25 %	50 %	25 %	0 %	110798947
5	NC_008261	AAAC	2	8	2850	2857	75 %	0 %	0 %	25 %	110798947
6	NC_008261	AAGG	2	8	2895	2902	50 %	0 %	50 %	0 %	110798947
7	NC_008261	TACT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	0 %	25 %	110798947
8	NC_008261	AATT	3	12	3586	3597	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
9	NC_008261	AATT	2	8	3886	3893	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
10	NC_008261	GAAA	2	8	4044	4051	75 %	0 %	25 %	0 %	110801062
11	NC_008261	GATA	2	8	4842	4849	50 %	25 %	25 %	0 %	110800243
12	NC_008261	ATTA	2	8	4909	4916	50 %	50 %	0 %	0 %	110800243
13	NC_008261	TACA	2	8	5355	5362	50 %	25 %	0 %	25 %	110799437
14	NC_008261	AATG	2	8	6050	6057	50 %	25 %	25 %	0 %	110799437
15	NC_008261	ATAA	2	8	7137	7144	75 %	25 %	0 %	0 %	110800886
16	NC_008261	TTAG	2	8	7365	7372	25 %	50 %	25 %	0 %	110800886
17	NC_008261	ACAT	2	8	7728	7735	50 %	25 %	0 %	25 %	110800886
18	NC_008261	TGCT	2	8	8095	8102	0 %	50 %	25 %	25 %	110800886
19	NC_008261	TTAT	2	8	8928	8935	25 %	75 %	0 %	0 %	110800886
20	NC_008261	AAGA	2	8	8990	8997	75 %	0 %	25 %	0 %	110800886
21	NC_008261	TGTA	2	8	9353	9360	25 %	50 %	25 %	0 %	110800886
22	NC_008261	AATT	2	8	15920	15927	50 %	50 %	0 %	0 %	110799285
23	NC_008261	TATT	2	8	16440	16447	25 %	75 %	0 %	0 %	110798661
24	NC_008261	TTTA	2	8	16474	16481	25 %	75 %	0 %	0 %	110798661
25	NC_008261	TATT	2	8	16916	16923	25 %	75 %	0 %	0 %	110798661
26	NC_008261	AGAT	2	8	17413	17420	50 %	25 %	25 %	0 %	110798661
27	NC_008261	ATTT	2	8	17639	17646	25 %	75 %	0 %	0 %	110798661
28	NC_008261	GAAA	2	8	17795	17802	75 %	0 %	25 %	0 %	110798661
29	NC_008261	TAAT	2	8	18096	18103	50 %	50 %	0 %	0 %	110798661
30	NC_008261	TTTA	2	8	18127	18134	25 %	75 %	0 %	0 %	110798661
31	NC_008261	ATGG	2	8	18503	18510	25 %	25 %	50 %	0 %	110798661
32	NC_008261	ATTT	2	8	18710	18717	25 %	75 %	0 %	0 %	110798661
33	NC_008261	TTCT	2	8	18762	18769	0 %	75 %	0 %	25 %	110798661
34	NC_008261	ATTT	2	8	18924	18931	25 %	75 %	0 %	0 %	110798661
35	NC_008261	TAAA	2	8	18987	18994	75 %	25 %	0 %	0 %	110798661
36	NC_008261	AATA	2	8	19605	19612	75 %	25 %	0 %	0 %	110800557
37	NC_008261	ATTT	2	8	19615	19622	25 %	75 %	0 %	0 %	110800557
38	NC_008261	AAAG	2	8	19674	19681	75 %	0 %	25 %	0 %	110800557
39	NC_008261	TAAA	2	8	20309	20316	75 %	25 %	0 %	0 %	110800557
40	NC_008261	GATT	2	8	20781	20788	25 %	50 %	25 %	0 %	110799910
41	NC_008261	AGTT	2	8	22124	22131	25 %	50 %	25 %	0 %	110798993
42	NC_008261	GATA	2	8	23130	23137	50 %	25 %	25 %	0 %	110801223
43	NC_008261	AGTA	2	8	24477	24484	50 %	25 %	25 %	0 %	110800136
44	NC_008261	ATGA	2	8	24767	24774	50 %	25 %	25 %	0 %	110800432
45	NC_008261	TATC	2	8	24912	24919	25 %	50 %	0 %	25 %	110800432
46	NC_008261	AAAT	2	8	24941	24948	75 %	25 %	0 %	0 %	110800432
47	NC_008261	ATTT	2	8	25381	25388	25 %	75 %	0 %	0 %	110800432
48	NC_008261	TAAG	2	8	25399	25406	50 %	25 %	25 %	0 %	110800432
49	NC_008261	GAAT	2	8	25475	25482	50 %	25 %	25 %	0 %	110800432
50	NC_008261	ATAA	2	8	26189	26196	75 %	25 %	0 %	0 %	110798865
51	NC_008261	GATG	2	8	26675	26682	25 %	25 %	50 %	0 %	110798865
52	NC_008261	AGAT	2	8	27219	27226	50 %	25 %	25 %	0 %	110798865
53	NC_008261	TGGA	2	8	27416	27423	25 %	25 %	50 %	0 %	110798865
54	NC_008261	GAAA	2	8	27561	27568	75 %	0 %	25 %	0 %	110798865
55	NC_008261	GCAG	2	8	27730	27737	25 %	0 %	50 %	25 %	110798865
56	NC_008261	GAAA	2	8	28339	28346	75 %	0 %	25 %	0 %	110798865
57	NC_008261	AAGG	2	8	28360	28367	50 %	0 %	50 %	0 %	110798865
58	NC_008261	AGAT	2	8	28741	28748	50 %	25 %	25 %	0 %	110798865
59	NC_008261	CTTC	2	8	28874	28881	0 %	50 %	0 %	50 %	110798865
60	NC_008261	TTTA	2	8	28893	28900	25 %	75 %	0 %	0 %	110798865
61	NC_008261	TAGA	2	8	28911	28918	50 %	25 %	25 %	0 %	110798865
62	NC_008261	TAAA	2	8	28995	29002	75 %	25 %	0 %	0 %	110798865
63	NC_008261	TTTA	2	8	29034	29041	25 %	75 %	0 %	0 %	110798865
64	NC_008261	AAAG	2	8	30228	30235	75 %	0 %	25 %	0 %	110799297
65	NC_008261	AGAA	2	8	31141	31148	75 %	0 %	25 %	0 %	110799297
66	NC_008261	TAAA	2	8	31204	31211	75 %	25 %	0 %	0 %	110799297
67	NC_008261	CTTA	2	8	31406	31413	25 %	50 %	0 %	25 %	110799297
68	NC_008261	ATTT	2	8	31793	31800	25 %	75 %	0 %	0 %	110799297
69	NC_008261	ATAA	2	8	31950	31957	75 %	25 %	0 %	0 %	110799297
70	NC_008261	ATTA	2	8	32288	32295	50 %	50 %	0 %	0 %	110799297
71	NC_008261	CTTT	2	8	33187	33194	0 %	75 %	0 %	25 %	110799297
72	NC_008261	ATAA	2	8	33267	33274	75 %	25 %	0 %	0 %	110799297
73	NC_008261	TAAA	2	8	33310	33317	75 %	25 %	0 %	0 %	110799297
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75	NC_008261	ATTG	2	8	33827	33834	25 %	50 %	25 %	0 %	110800095
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79	NC_008261	ATTT	2	8	36403	36410	25 %	75 %	0 %	0 %	110799840
80	NC_008261	TAAT	2	8	36945	36952	50 %	50 %	0 %	0 %	110799840
81	NC_008261	ATTT	2	8	37415	37422	25 %	75 %	0 %	0 %	110800422
82	NC_008261	TAAA	2	8	38095	38102	75 %	25 %	0 %	0 %	110800422
83	NC_008261	TTGT	2	8	38693	38700	0 %	75 %	25 %	0 %	110801244
84	NC_008261	TAAT	2	8	39319	39326	50 %	50 %	0 %	0 %	110801244
85	NC_008261	ATTT	2	8	39919	39926	25 %	75 %	0 %	0 %	110798802
86	NC_008261	TAAA	2	8	39980	39987	75 %	25 %	0 %	0 %	110798802
87	NC_008261	ACTA	2	8	40330	40337	50 %	25 %	0 %	25 %	110798802
88	NC_008261	ATTT	2	8	40575	40582	25 %	75 %	0 %	0 %	110798802
89	NC_008261	TATT	2	8	41087	41094	25 %	75 %	0 %	0 %	110798633
90	NC_008261	CTAT	2	8	41159	41166	25 %	50 %	0 %	25 %	110798633
91	NC_008261	TCTT	2	8	41177	41184	0 %	75 %	0 %	25 %	110798633
92	NC_008261	CTTA	2	8	41794	41801	25 %	50 %	0 %	25 %	110798633
93	NC_008261	TAAA	2	8	43452	43459	75 %	25 %	0 %	0 %	110800603
94	NC_008261	CTAC	2	8	43635	43642	25 %	25 %	0 %	50 %	110800603
95	NC_008261	TAGA	2	8	44178	44185	50 %	25 %	25 %	0 %	110800603
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99	NC_008261	CCTA	2	8	46358	46365	25 %	25 %	0 %	50 %	110799578
100	NC_008261	ATGA	2	8	47282	47289	50 %	25 %	25 %	0 %	110799806
101	NC_008261	TATT	2	8	47358	47365	25 %	75 %	0 %	0 %	110799806
102	NC_008261	TTGA	2	8	48007	48014	25 %	50 %	25 %	0 %	110799806
103	NC_008261	AAAG	2	8	48367	48374	75 %	0 %	25 %	0 %	110800852
104	NC_008261	CATG	2	8	48578	48585	25 %	25 %	25 %	25 %	110800852
105	NC_008261	GAAA	2	8	48915	48922	75 %	0 %	25 %	0 %	110800852
106	NC_008261	AATT	2	8	49917	49924	50 %	50 %	0 %	0 %	110798981
107	NC_008261	AATA	2	8	50085	50092	75 %	25 %	0 %	0 %	110798981
108	NC_008261	TAAG	2	8	50288	50295	50 %	25 %	25 %	0 %	110798981
109	NC_008261	AGAA	2	8	50304	50311	75 %	0 %	25 %	0 %	110798981
110	NC_008261	TAAA	2	8	50639	50646	75 %	25 %	0 %	0 %	110798981
111	NC_008261	TAAA	2	8	51120	51127	75 %	25 %	0 %	0 %	110799721
112	NC_008261	AAGG	2	8	51218	51225	50 %	0 %	50 %	0 %	110799721
113	NC_008261	AAAG	2	8	51245	51252	75 %	0 %	25 %	0 %	110799721
114	NC_008261	TAAA	2	8	51290	51297	75 %	25 %	0 %	0 %	261876155
115	NC_008261	ATTT	2	8	53310	53317	25 %	75 %	0 %	0 %	110798717
116	NC_008261	ATTT	2	8	53467	53474	25 %	75 %	0 %	0 %	110798717
117	NC_008261	AGAT	2	8	53746	53753	50 %	25 %	25 %	0 %	110798717
118	NC_008261	TTAG	2	8	53864	53871	25 %	50 %	25 %	0 %	110798717
119	NC_008261	GAAA	2	8	53925	53932	75 %	0 %	25 %	0 %	110798717
120	NC_008261	CAAT	2	8	54817	54824	50 %	25 %	0 %	25 %	110799596
121	NC_008261	TAAA	2	8	55090	55097	75 %	25 %	0 %	0 %	110799596
122	NC_008261	TTAT	2	8	56200	56207	25 %	75 %	0 %	0 %	110800785
123	NC_008261	CTTG	2	8	56512	56519	0 %	50 %	25 %	25 %	110800785
124	NC_008261	CTTA	2	8	56796	56803	25 %	50 %	0 %	25 %	110800785
125	NC_008261	TAAA	2	8	56959	56966	75 %	25 %	0 %	0 %	110800785
126	NC_008261	TCTT	2	8	57393	57400	0 %	75 %	0 %	25 %	110800841
127	NC_008261	ATTT	2	8	57904	57911	25 %	75 %	0 %	0 %	110799164
128	NC_008261	ATTT	2	8	58525	58532	25 %	75 %	0 %	0 %	110799164
129	NC_008261	TTTA	2	8	58828	58835	25 %	75 %	0 %	0 %	110799164
130	NC_008261	AATA	2	8	58901	58908	75 %	25 %	0 %	0 %	110799164
131	NC_008261	AAGA	2	8	59239	59246	75 %	0 %	25 %	0 %	110799164
132	NC_008261	AAGC	2	8	59589	59596	50 %	0 %	25 %	25 %	110800382
133	NC_008261	CAAT	2	8	59619	59626	50 %	25 %	0 %	25 %	110800382
134	NC_008261	GAAA	2	8	59698	59705	75 %	0 %	25 %	0 %	110800382
135	NC_008261	AAGC	2	8	59790	59797	50 %	0 %	25 %	25 %	110800382
136	NC_008261	GTTA	2	8	60789	60796	25 %	50 %	25 %	0 %	110800903
137	NC_008261	TTAT	2	8	62373	62380	25 %	75 %	0 %	0 %	110800126
138	NC_008261	TAGA	2	8	62421	62428	50 %	25 %	25 %	0 %	110800126
139	NC_008261	TTTA	2	8	62456	62463	25 %	75 %	0 %	0 %	110800126
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