MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 10060

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008261	TA	3	6	223	228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008261	TA	4	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	110799791
3	NC_008261	CT	3	6	1415	1420	0 %	50 %	0 %	50 %	110799791
4	NC_008261	AT	3	6	2007	2012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008261	GA	3	6	2302	2307	50 %	0 %	50 %	0 %	110798947
6	NC_008261	TG	3	6	3292	3297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008261	TA	3	6	3570	3575	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
8	NC_008261	TA	3	6	3692	3697	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
9	NC_008261	CA	3	6	3718	3723	50 %	0 %	0 %	50 %	110801062
10	NC_008261	TC	3	6	3916	3921	0 %	50 %	0 %	50 %	110801062
11	NC_008261	AT	3	6	4095	4100	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
12	NC_008261	GA	3	6	4123	4128	50 %	0 %	50 %	0 %	110801062
13	NC_008261	AT	3	6	4151	4156	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
14	NC_008261	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
15	NC_008261	AT	4	8	4354	4361	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
16	NC_008261	GA	3	6	4682	4687	50 %	0 %	50 %	0 %	110800243
17	NC_008261	TA	3	6	5146	5151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008261	AT	3	6	6716	6721	50 %	50 %	0 %	0 %	110799437
19	NC_008261	GA	3	6	6722	6727	50 %	0 %	50 %	0 %	110799437
20	NC_008261	TA	3	6	6750	6755	50 %	50 %	0 %	0 %	110799437
21	NC_008261	TA	3	6	6769	6774	50 %	50 %	0 %	0 %	110799437
22	NC_008261	AG	3	6	6794	6799	50 %	0 %	50 %	0 %	110799437
23	NC_008261	AT	3	6	7072	7077	50 %	50 %	0 %	0 %	110799437
24	NC_008261	AT	3	6	7397	7402	50 %	50 %	0 %	0 %	110800886
25	NC_008261	AT	3	6	7919	7924	50 %	50 %	0 %	0 %	110800886
26	NC_008261	AG	3	6	8017	8022	50 %	0 %	50 %	0 %	110800886
27	NC_008261	TA	3	6	8053	8058	50 %	50 %	0 %	0 %	110800886
28	NC_008261	AC	3	6	8060	8065	50 %	0 %	0 %	50 %	110800886
29	NC_008261	TA	3	6	8154	8159	50 %	50 %	0 %	0 %	110800886
30	NC_008261	AG	4	8	8216	8223	50 %	0 %	50 %	0 %	110800886
31	NC_008261	AC	3	6	8317	8322	50 %	0 %	0 %	50 %	110800886
32	NC_008261	AT	3	6	8633	8638	50 %	50 %	0 %	0 %	110800886
33	NC_008261	AG	3	6	8674	8679	50 %	0 %	50 %	0 %	110800886
34	NC_008261	AC	3	6	8748	8753	50 %	0 %	0 %	50 %	110800886
35	NC_008261	AT	3	6	8854	8859	50 %	50 %	0 %	0 %	110800886
36	NC_008261	CT	3	6	10876	10881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008261	AC	3	6	11364	11369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008261	AG	3	6	11389	11394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008261	AC	3	6	11532	11537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008261	GA	3	6	11747	11752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008261	TC	3	6	11756	11761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008261	TC	3	6	12716	12721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008261	GA	3	6	13013	13018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008261	GT	3	6	13345	13350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008261	AG	4	8	13484	13491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008261	TG	3	6	14959	14964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008261	AT	3	6	15192	15197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008261	CA	3	6	15276	15281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008261	TA	3	6	15294	15299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008261	AG	3	6	15305	15310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008261	TA	3	6	15345	15350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008261	AG	3	6	15616	15621	50 %	0 %	50 %	0 %	110799285
53	NC_008261	AT	4	8	15767	15774	50 %	50 %	0 %	0 %	110799285
54	NC_008261	TA	3	6	16111	16116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008261	TA	3	6	16143	16148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008261	TA	3	6	16174	16179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008261	TA	3	6	16238	16243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008261	TA	3	6	16468	16473	50 %	50 %	0 %	0 %	110798661
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60	NC_008261	TA	3	6	16765	16770	50 %	50 %	0 %	0 %	110798661
61	NC_008261	AT	3	6	17917	17922	50 %	50 %	0 %	0 %	110798661
62	NC_008261	TA	3	6	18014	18019	50 %	50 %	0 %	0 %	110798661
63	NC_008261	AT	3	6	18116	18121	50 %	50 %	0 %	0 %	110798661
64	NC_008261	GA	3	6	18303	18308	50 %	0 %	50 %	0 %	110798661
65	NC_008261	TA	4	8	18559	18566	50 %	50 %	0 %	0 %	110798661
66	NC_008261	TA	3	6	18652	18657	50 %	50 %	0 %	0 %	110798661
67	NC_008261	TA	3	6	19090	19095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008261	TA	4	8	19213	19220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008261	AT	3	6	19245	19250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71	NC_008261	AT	3	6	20208	20213	50 %	50 %	0 %	0 %	110800557
72	NC_008261	AT	3	6	20564	20569	50 %	50 %	0 %	0 %	110800557
73	NC_008261	AG	3	6	20575	20580	50 %	0 %	50 %	0 %	110800557
74	NC_008261	AT	3	6	20690	20695	50 %	50 %	0 %	0 %	110799910
75	NC_008261	AT	3	6	20950	20955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008261	TA	3	6	20999	21004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008261	AG	3	6	21013	21018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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83	NC_008261	AT	3	6	22564	22569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008261	TA	3	6	22585	22590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008261	AT	3	6	22883	22888	50 %	50 %	0 %	0 %	110801223
86	NC_008261	TA	3	6	23169	23174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008261	GA	3	6	23281	23286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008261	TC	3	6	23360	23365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008261	GA	3	6	24131	24136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008261	TC	3	6	24210	24215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008261	AT	3	6	24485	24490	50 %	50 %	0 %	0 %	110800136
92	NC_008261	AT	3	6	24713	24718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_008261	AT	3	6	26086	26091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_008261	AG	3	6	27493	27498	50 %	0 %	50 %	0 %	110798865
107	NC_008261	AG	3	6	27512	27517	50 %	0 %	50 %	0 %	110798865
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109	NC_008261	AG	3	6	28468	28473	50 %	0 %	50 %	0 %	110798865
110	NC_008261	TA	3	6	28499	28504	50 %	50 %	0 %	0 %	110798865
111	NC_008261	AT	3	6	28535	28540	50 %	50 %	0 %	0 %	110798865
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115	NC_008261	GA	5	10	29780	29789	50 %	0 %	50 %	0 %	110799297
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118	NC_008261	AT	3	6	30938	30943	50 %	50 %	0 %	0 %	110799297
119	NC_008261	AG	3	6	30951	30956	50 %	0 %	50 %	0 %	110799297
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121	NC_008261	AT	3	6	31198	31203	50 %	50 %	0 %	0 %	110799297
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124	NC_008261	TA	3	6	32673	32678	50 %	50 %	0 %	0 %	110799297
125	NC_008261	AG	3	6	32722	32727	50 %	0 %	50 %	0 %	110799297
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127	NC_008261	TA	3	6	33076	33081	50 %	50 %	0 %	0 %	110799297
128	NC_008261	TA	3	6	33295	33300	50 %	50 %	0 %	0 %	110799297
129	NC_008261	AT	3	6	33631	33636	50 %	50 %	0 %	0 %	110800095
130	NC_008261	AT	3	6	33655	33660	50 %	50 %	0 %	0 %	110800095
131	NC_008261	AT	3	6	34674	34679	50 %	50 %	0 %	0 %	110800095
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139	NC_008261	AT	3	6	38438	38443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008261	AT	3	6	38461	38466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_008261	TA	3	6	38595	38600	50 %	50 %	0 %	0 %	110801244
143	NC_008261	CT	3	6	39078	39083	0 %	50 %	0 %	50 %	110801244
144	NC_008261	AT	3	6	39280	39285	50 %	50 %	0 %	0 %	110801244
145	NC_008261	TA	3	6	39469	39474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008261	AT	3	6	39557	39562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008261	TA	3	6	39703	39708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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