MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alcanivorax borkumensis SK2 chromosome

Total Repeats: 1077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008260	GTAT	2	8	2579	2586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008260	ATTT	2	8	8088	8095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008260	TTTA	2	8	8172	8179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008260	AATC	2	8	16378	16385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008260	AAAT	2	8	16424	16431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008260	TATT	2	8	16447	16454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008260	TTCA	2	8	20408	20415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008260	AATC	2	8	25073	25080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008260	CAGC	2	8	26106	26113	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008260	ATTT	2	8	27192	27199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008260	ACCA	2	8	27477	27484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008260	TCAC	2	8	27713	27720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008260	CTCG	2	8	35504	35511	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008260	GCGG	2	8	35535	35542	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008260	AAAG	2	8	44462	44469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008260	TGCA	2	8	45310	45317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008260	GGAG	2	8	47362	47369	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008260	TTTA	2	8	47597	47604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008260	TGGG	2	8	47646	47653	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008260	CGGG	2	8	47824	47831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008260	ATTG	2	8	55391	55398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008260	TTGT	2	8	55530	55537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008260	GCGG	2	8	58376	58383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008260	TGTC	2	8	60302	60309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008260	TTGC	2	8	67514	67521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008260	TTTG	2	8	76256	76263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008260	GAGT	2	8	76323	76330	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008260	TCGC	2	8	80317	80324	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008260	CGGA	2	8	83211	83218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008260	AGGC	2	8	83457	83464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008260	GCCA	2	8	83572	83579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008260	GCTT	2	8	86991	86998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008260	TGAG	2	8	87511	87518	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008260	ATGG	2	8	88378	88385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008260	TATG	2	8	93489	93496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008260	CGCA	2	8	96532	96539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008260	CTTG	2	8	102002	102009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008260	TGTT	2	8	102087	102094	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008260	TGGG	2	8	113398	113405	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008260	TTTC	2	8	113507	113514	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008260	CTTA	2	8	118041	118048	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008260	GCTG	2	8	124348	124355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008260	TACG	2	8	126744	126751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008260	AGGG	2	8	136802	136809	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008260	GCTT	2	8	149112	149119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008260	GCCC	2	8	149793	149800	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_008260	CTTG	2	8	149823	149830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008260	ATTG	2	8	154311	154318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008260	TCAT	2	8	156363	156370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008260	TTCT	2	8	157364	157371	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008260	TGAT	2	8	157467	157474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008260	GCGG	2	8	161376	161383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008260	CTTA	2	8	170628	170635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008260	CCCG	2	8	170637	170644	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_008260	CTTA	2	8	172062	172069	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008260	TACA	2	8	172076	172083	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008260	AAGG	2	8	174153	174160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008260	GGCA	2	8	174874	174881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008260	CCAA	2	8	180747	180754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008260	GAGC	2	8	184215	184222	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008260	TCTG	2	8	186810	186817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008260	GCCG	2	8	187223	187230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008260	GCTA	2	8	199271	199278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008260	GAGC	2	8	199556	199563	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008260	ATAG	2	8	199581	199588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008260	CTAC	2	8	200003	200010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008260	TTAA	2	8	200945	200952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008260	TTCA	2	8	204348	204355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008260	TAGG	2	8	204466	204473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008260	TTTC	2	8	204577	204584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008260	CATT	2	8	204708	204715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008260	TGTC	2	8	204765	204772	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008260	GCTT	2	8	205135	205142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008260	TTTG	2	8	210024	210031	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008260	TTTC	2	8	212952	212959	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008260	ACCA	2	8	214787	214794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008260	CTGG	2	8	221803	221810	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008260	ATGA	2	8	221811	221818	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008260	CCCT	2	8	221978	221985	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_008260	AACA	2	8	222012	222019	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008260	CTTT	2	8	222368	222375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008260	CACC	2	8	223278	223285	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_008260	AAGG	2	8	224343	224350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008260	CTTG	2	8	230847	230854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008260	GCGA	2	8	230929	230936	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008260	TGCC	2	8	234341	234348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008260	TTTG	2	8	234716	234723	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008260	CCGG	2	8	234745	234752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008260	ATGG	2	8	240021	240028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008260	AGAA	2	8	240121	240128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008260	AAAG	2	8	245643	245650	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008260	ATCA	2	8	246284	246291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008260	TCGG	2	8	246473	246480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008260	GCAT	2	8	246679	246686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008260	GGCT	2	8	246809	246816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008260	GAGG	2	8	246940	246947	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008260	GTTT	2	8	247574	247581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008260	TTCA	2	8	247636	247643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008260	AATA	2	8	247646	247653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008260	TTTG	2	8	255771	255778	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008260	GGCG	2	8	257376	257383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008260	TATG	2	8	257561	257568	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008260	ACCC	2	8	259086	259093	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_008260	CTGC	2	8	270379	270386	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008260	CGAA	2	8	277732	277739	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008260	GAAT	2	8	286203	286210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008260	ATTG	2	8	294184	294191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008260	CCTT	2	8	294244	294251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008260	TACC	2	8	294305	294312	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008260	CAAG	2	8	295742	295749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008260	GATG	2	8	298821	298828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008260	TTGC	2	8	298926	298933	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008260	GTCA	2	8	300275	300282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008260	CTAG	2	8	308947	308954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008260	CCTG	2	8	314955	314962	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008260	TGGG	2	8	319325	319332	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008260	ATAG	2	8	320685	320692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008260	CGGG	2	8	322658	322665	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008260	TACT	2	8	322666	322673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008260	GGGC	2	8	323899	323906	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008260	CACG	2	8	328492	328499	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008260	CAGC	2	8	329275	329282	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008260	CAAT	2	8	330486	330493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008260	GTGA	2	8	330593	330600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008260	ATTG	2	8	330692	330699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008260	AATG	2	8	330759	330766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008260	CGTC	2	8	332429	332436	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008260	CAGG	2	8	332600	332607	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008260	TGTC	2	8	334029	334036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008260	ATTG	2	8	336650	336657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008260	AACG	2	8	339528	339535	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008260	TTGG	2	8	340645	340652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008260	AACG	2	8	341510	341517	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008260	TGGC	2	8	364442	364449	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008260	TGCT	2	8	367110	367117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008260	TGCC	2	8	367228	367235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008260	GCCA	2	8	369503	369510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008260	TTAA	2	8	382055	382062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008260	CCTG	2	8	390561	390568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008260	TAAA	2	8	398307	398314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008260	CGAC	2	8	398364	398371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008260	TCAA	2	8	398441	398448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008260	AGGT	2	8	401664	401671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008260	GCAA	2	8	403053	403060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008260	GATG	2	8	403409	403416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008260	GGAA	2	8	403895	403902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008260	AGAT	2	8	404201	404208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008260	GCCT	2	8	404926	404933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008260	GCTT	2	8	405029	405036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008260	GCGA	2	8	405499	405506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008260	GGCC	2	8	405557	405564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008260	GTAC	2	8	405761	405768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_008260	CGTC	2	8	406200	406207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_008260	AAAG	2	8	406323	406330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008260	TATG	2	8	406412	406419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008260	GTTG	2	8	406689	406696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008260	CCTC	2	8	408005	408012	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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159	NC_008260	GCAA	2	8	413651	413658	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_008260	GTAG	2	8	413796	413803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008260	CTCG	2	8	415231	415238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_008260	TGTT	2	8	415245	415252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008260	GTAA	2	8	417690	417697	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_008260	TGGT	2	8	432533	432540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_008260	CTTC	2	8	448120	448127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_008260	TACG	2	8	448242	448249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_008260	TTGA	2	8	448324	448331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_008260	AACC	2	8	448391	448398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_008260	AACG	2	8	452609	452616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_008260	TGTT	2	8	477159	477166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
177	NC_008260	ACTG	2	8	479642	479649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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179	NC_008260	TGGG	2	8	490285	490292	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_008260	CGCC	2	8	492430	492437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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184	NC_008260	TTCA	2	8	503903	503910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
185	NC_008260	ATCG	2	8	514677	514684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
186	NC_008260	GGGC	2	8	522108	522115	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
187	NC_008260	TTGA	2	8	522683	522690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
188	NC_008260	GCAG	2	8	522967	522974	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
189	NC_008260	TCCC	2	8	527344	527351	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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198	NC_008260	GGCC	2	8	533090	533097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
199	NC_008260	GTAC	2	8	533294	533301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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201	NC_008260	AAAG	2	8	533856	533863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_008260	AAGC	2	8	695710	695717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
242	NC_008260	TTTA	2	8	697950	697957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_008260	TGGC	2	8	698950	698957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
245	NC_008260	CAGG	2	8	699095	699102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
246	NC_008260	CAGA	2	8	699620	699627	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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261	NC_008260	GGTT	2	8	722526	722533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
262	NC_008260	CGGT	2	8	723235	723242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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264	NC_008260	ATTG	2	8	730822	730829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
265	NC_008260	ATAA	2	8	735470	735477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_008260	AACC	2	8	773577	773584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
272	NC_008260	TCTG	2	8	774728	774735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
273	NC_008260	AATT	2	8	783422	783429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_008260	ATGG	2	8	783604	783611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
275	NC_008260	TGAG	2	8	783697	783704	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
276	NC_008260	TCTG	2	8	787169	787176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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278	NC_008260	TGGT	2	8	789811	789818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
279	NC_008260	TTCA	2	8	791504	791511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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282	NC_008260	TTGT	2	8	798508	798515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_008260	CTGT	2	8	798523	798530	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
284	NC_008260	CTTG	2	8	798683	798690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
285	NC_008260	TGCT	2	8	798824	798831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
286	NC_008260	TTTG	2	8	801705	801712	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_008260	GGCG	2	8	817086	817093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
289	NC_008260	TTGA	2	8	820323	820330	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_008260	AAGA	2	8	1417672	1417679	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_008260	TAGC	2	8	1432792	1432799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
490	NC_008260	ATGC	2	8	1433372	1433379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
491	NC_008260	CACG	2	8	1435755	1435762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_008260	AACT	2	8	1437723	1437730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
493	NC_008260	GTAC	2	8	1449556	1449563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_008260	CCGT	2	8	1475018	1475025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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