MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 53733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008258	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804075
2	NC_008258	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804075
3	NC_008258	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804075
4	NC_008258	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804075
5	NC_008258	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804075
6	NC_008258	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804075
7	NC_008258	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804075
8	NC_008258	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804075
9	NC_008258	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804075
10	NC_008258	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804075
11	NC_008258	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804075
12	NC_008258	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804075
13	NC_008258	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804075
14	NC_008258	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804075
15	NC_008258	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804075
16	NC_008258	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804075
17	NC_008258	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804075
18	NC_008258	TGC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804075
19	NC_008258	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804075
20	NC_008258	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804075
21	NC_008258	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804075
22	NC_008258	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804075
23	NC_008258	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804075
24	NC_008258	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804075
25	NC_008258	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804075
26	NC_008258	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804075
27	NC_008258	GCG	2	6	1837	1842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804075
28	NC_008258	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804075
29	NC_008258	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804075
30	NC_008258	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804075
31	NC_008258	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804075
32	NC_008258	ATC	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804075
33	NC_008258	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804075
34	NC_008258	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804075
35	NC_008258	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804075
36	NC_008258	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804075
37	NC_008258	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804075
38	NC_008258	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804075
39	NC_008258	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804075
40	NC_008258	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804075
41	NC_008258	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804075
42	NC_008258	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804076
43	NC_008258	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804076
44	NC_008258	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804076
45	NC_008258	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804076
46	NC_008258	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804076
47	NC_008258	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804076
48	NC_008258	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804076
49	NC_008258	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804076
50	NC_008258	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804076
51	NC_008258	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804076
52	NC_008258	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804076
53	NC_008258	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804076
54	NC_008258	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804076
55	NC_008258	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804077
56	NC_008258	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804077
57	NC_008258	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804077
58	NC_008258	GAT	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804077
59	NC_008258	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804077
60	NC_008258	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804077
61	NC_008258	TTG	2	6	4387	4392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804077
62	NC_008258	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804077
63	NC_008258	AGG	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804077
64	NC_008258	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804077
65	NC_008258	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804077
66	NC_008258	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804077
67	NC_008258	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804077
68	NC_008258	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804077
69	NC_008258	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804077
70	NC_008258	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804077
71	NC_008258	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804077
72	NC_008258	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804077
73	NC_008258	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804077
74	NC_008258	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804077
75	NC_008258	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804078
76	NC_008258	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804078
77	NC_008258	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804078
78	NC_008258	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804078
79	NC_008258	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804078
80	NC_008258	CCA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804078
81	NC_008258	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804078
82	NC_008258	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804078
83	NC_008258	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804078
84	NC_008258	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804079
85	NC_008258	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804079
86	NC_008258	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804079
87	NC_008258	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804079
88	NC_008258	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804079
89	NC_008258	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804079
90	NC_008258	TGA	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804079
91	NC_008258	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804079
92	NC_008258	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804079
93	NC_008258	GCC	2	6	5944	5949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804079
94	NC_008258	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804079
95	NC_008258	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804079
96	NC_008258	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804079
97	NC_008258	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804079
98	NC_008258	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804079
99	NC_008258	GTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804079
100	NC_008258	ACC	2	6	8336	8341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162139365
101	NC_008258	CAG	2	6	8483	8488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139365
102	NC_008258	CAG	2	6	8504	8509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139365
103	NC_008258	TGC	2	6	8725	8730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139365
104	NC_008258	AAG	2	6	8745	8750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139365
105	NC_008258	CTG	2	6	8771	8776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139365
106	NC_008258	TTG	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162139365
107	NC_008258	AGA	2	6	8896	8901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139365
108	NC_008258	TAC	2	6	8936	8941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162139365
109	NC_008258	CTG	2	6	9044	9049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139365
110	NC_008258	GCA	2	6	9151	9156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139365
111	NC_008258	CTG	2	6	9248	9253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139365
112	NC_008258	TGA	2	6	9369	9374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804081
113	NC_008258	GCG	2	6	9420	9425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804081
114	NC_008258	GAA	2	6	9455	9460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804081
115	NC_008258	ATC	2	6	9527	9532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804081
116	NC_008258	TGG	2	6	9552	9557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804081
117	NC_008258	CAC	2	6	9583	9588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804081
118	NC_008258	CGT	2	6	9608	9613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804081
119	NC_008258	TGC	2	6	9913	9918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804081
120	NC_008258	GAT	2	6	10110	10115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804082
121	NC_008258	CAG	2	6	10146	10151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804082
122	NC_008258	GAA	2	6	10215	10220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804082
123	NC_008258	CAG	2	6	10308	10313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804082
124	NC_008258	CAG	2	6	10392	10397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804082
125	NC_008258	GCC	2	6	10419	10424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804082
126	NC_008258	AAT	2	6	10446	10451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804082
127	NC_008258	TGG	2	6	10496	10501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804082
128	NC_008258	TGC	2	6	10782	10787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804083
129	NC_008258	TGC	2	6	10813	10818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804083
130	NC_008258	TGC	2	6	10876	10881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804083
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499	NC_008258	CAG	2	6	39522	39527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804107
500	NC_008258	CAG	2	6	39573	39578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804107

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