MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 7015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008258	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008258	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	110804075
3	NC_008258	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	110804075
4	NC_008258	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	110804075
5	NC_008258	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	110804075
6	NC_008258	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	110804077
7	NC_008258	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	110804077
8	NC_008258	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008258	CG	3	6	7619	7624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008258	CG	3	6	7811	7816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008258	TA	3	6	8090	8095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008258	TC	3	6	8411	8416	0 %	50 %	0 %	50 %	162139365
13	NC_008258	CG	3	6	8498	8503	0 %	0 %	50 %	50 %	162139365
14	NC_008258	TG	3	6	9543	9548	0 %	50 %	50 %	0 %	110804081
15	NC_008258	CG	4	8	10193	10200	0 %	0 %	50 %	50 %	110804082
16	NC_008258	AC	3	6	10926	10931	50 %	0 %	0 %	50 %	110804083
17	NC_008258	AG	3	6	11678	11683	50 %	0 %	50 %	0 %	110804084
18	NC_008258	AT	3	6	12207	12212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008258	CG	3	6	13624	13629	0 %	0 %	50 %	50 %	110804085
20	NC_008258	CG	3	6	14567	14572	0 %	0 %	50 %	50 %	110804086
21	NC_008258	CT	3	6	15622	15627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008258	CT	3	6	15785	15790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008258	CT	3	6	16751	16756	0 %	50 %	0 %	50 %	110804087
24	NC_008258	TG	3	6	16801	16806	0 %	50 %	50 %	0 %	110804087
25	NC_008258	GA	3	6	17425	17430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008258	TA	3	6	19542	19547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008258	GT	3	6	19749	19754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008258	TC	3	6	19755	19760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008258	GC	3	6	20068	20073	0 %	0 %	50 %	50 %	110804091
30	NC_008258	GT	3	6	20478	20483	0 %	50 %	50 %	0 %	110804092
31	NC_008258	CG	3	6	20524	20529	0 %	0 %	50 %	50 %	110804092
32	NC_008258	CG	3	6	21910	21915	0 %	0 %	50 %	50 %	110804093
33	NC_008258	GC	3	6	22583	22588	0 %	0 %	50 %	50 %	110804093
34	NC_008258	CG	3	6	22657	22662	0 %	0 %	50 %	50 %	110804093
35	NC_008258	CG	3	6	23385	23390	0 %	0 %	50 %	50 %	110804093
36	NC_008258	GC	3	6	24547	24552	0 %	0 %	50 %	50 %	110804094
37	NC_008258	AT	3	6	25356	25361	50 %	50 %	0 %	0 %	110804096
38	NC_008258	TG	3	6	25706	25711	0 %	50 %	50 %	0 %	110804096
39	NC_008258	CT	3	6	28925	28930	0 %	50 %	0 %	50 %	110804099
40	NC_008258	CG	3	6	29075	29080	0 %	0 %	50 %	50 %	110804099
41	NC_008258	GC	3	6	29888	29893	0 %	0 %	50 %	50 %	110804100
42	NC_008258	GC	3	6	30092	30097	0 %	0 %	50 %	50 %	110804100
43	NC_008258	CG	3	6	30228	30233	0 %	0 %	50 %	50 %	110804100
44	NC_008258	CA	3	6	30245	30250	50 %	0 %	0 %	50 %	110804100
45	NC_008258	TC	4	8	30390	30397	0 %	50 %	0 %	50 %	110804100
46	NC_008258	CG	3	6	31129	31134	0 %	0 %	50 %	50 %	110804100
47	NC_008258	GC	3	6	31297	31302	0 %	0 %	50 %	50 %	110804100
48	NC_008258	AT	3	6	33197	33202	50 %	50 %	0 %	0 %	110804101
49	NC_008258	TG	3	6	33284	33289	0 %	50 %	50 %	0 %	110804101
50	NC_008258	AG	3	6	33364	33369	50 %	0 %	50 %	0 %	110804101
51	NC_008258	CG	3	6	33543	33548	0 %	0 %	50 %	50 %	110804101
52	NC_008258	CT	3	6	34017	34022	0 %	50 %	0 %	50 %	110804102
53	NC_008258	CA	3	6	34085	34090	50 %	0 %	0 %	50 %	110804102
54	NC_008258	TC	3	6	34974	34979	0 %	50 %	0 %	50 %	110804103
55	NC_008258	GC	3	6	38586	38591	0 %	0 %	50 %	50 %	110804106
56	NC_008258	CG	3	6	38858	38863	0 %	0 %	50 %	50 %	110804106
57	NC_008258	TG	3	6	39061	39066	0 %	50 %	50 %	0 %	110804106
58	NC_008258	GC	4	8	39736	39743	0 %	0 %	50 %	50 %	110804107
59	NC_008258	CG	3	6	41617	41622	0 %	0 %	50 %	50 %	110804108
60	NC_008258	GC	3	6	42719	42724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008258	GC	3	6	43526	43531	0 %	0 %	50 %	50 %	110804109
62	NC_008258	CG	3	6	44695	44700	0 %	0 %	50 %	50 %	110804110
63	NC_008258	TG	3	6	45092	45097	0 %	50 %	50 %	0 %	110804111
64	NC_008258	TC	3	6	46135	46140	0 %	50 %	0 %	50 %	110804111
65	NC_008258	AT	3	6	46178	46183	50 %	50 %	0 %	0 %	110804111
66	NC_008258	CT	3	6	46331	46336	0 %	50 %	0 %	50 %	110804112
67	NC_008258	CT	3	6	46389	46394	0 %	50 %	0 %	50 %	110804112
68	NC_008258	GC	3	6	46710	46715	0 %	0 %	50 %	50 %	110804112
69	NC_008258	CT	3	6	47300	47305	0 %	50 %	0 %	50 %	110804113
70	NC_008258	CG	3	6	47954	47959	0 %	0 %	50 %	50 %	110804113
71	NC_008258	CG	3	6	48457	48462	0 %	0 %	50 %	50 %	110804113
72	NC_008258	CG	4	8	49797	49804	0 %	0 %	50 %	50 %	110804115
73	NC_008258	CG	4	8	50085	50092	0 %	0 %	50 %	50 %	110804115
74	NC_008258	AC	3	6	50569	50574	50 %	0 %	0 %	50 %	110804116
75	NC_008258	GC	4	8	53087	53094	0 %	0 %	50 %	50 %	110804119
76	NC_008258	AT	3	6	54105	54110	50 %	50 %	0 %	0 %	110804120
77	NC_008258	GC	4	8	54559	54566	0 %	0 %	50 %	50 %	110804120
78	NC_008258	GT	3	6	56329	56334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008258	AT	3	6	56346	56351	50 %	50 %	0 %	0 %	110804121
80	NC_008258	CG	3	6	59389	59394	0 %	0 %	50 %	50 %	110804123
81	NC_008258	AG	3	6	60269	60274	50 %	0 %	50 %	0 %	110804123
82	NC_008258	CG	3	6	60343	60348	0 %	0 %	50 %	50 %	110804123
83	NC_008258	CG	4	8	60462	60469	0 %	0 %	50 %	50 %	110804123
84	NC_008258	GC	3	6	64503	64508	0 %	0 %	50 %	50 %	110804126
85	NC_008258	TG	3	6	65117	65122	0 %	50 %	50 %	0 %	110804126
86	NC_008258	CG	3	6	65432	65437	0 %	0 %	50 %	50 %	110804126
87	NC_008258	CG	3	6	66171	66176	0 %	0 %	50 %	50 %	110804127
88	NC_008258	GC	3	6	67326	67331	0 %	0 %	50 %	50 %	110804127
89	NC_008258	AG	3	6	67599	67604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008258	GA	3	6	68126	68131	50 %	0 %	50 %	0 %	110804128
91	NC_008258	CG	3	6	68195	68200	0 %	0 %	50 %	50 %	110804128
92	NC_008258	CG	3	6	69498	69503	0 %	0 %	50 %	50 %	110804129
93	NC_008258	GC	3	6	70662	70667	0 %	0 %	50 %	50 %	110804131
94	NC_008258	AC	3	6	71273	71278	50 %	0 %	0 %	50 %	110804131
95	NC_008258	AG	3	6	71822	71827	50 %	0 %	50 %	0 %	110804131
96	NC_008258	GA	3	6	71835	71840	50 %	0 %	50 %	0 %	110804131
97	NC_008258	GC	3	6	72504	72509	0 %	0 %	50 %	50 %	110804132
98	NC_008258	TC	3	6	73468	73473	0 %	50 %	0 %	50 %	110804133
99	NC_008258	GC	3	6	75264	75269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008258	TC	3	6	76492	76497	0 %	50 %	0 %	50 %	110804134
101	NC_008258	GC	3	6	76840	76845	0 %	0 %	50 %	50 %	110804134
102	NC_008258	TG	3	6	76937	76942	0 %	50 %	50 %	0 %	110804134
103	NC_008258	CG	3	6	77304	77309	0 %	0 %	50 %	50 %	110804135
104	NC_008258	GC	3	6	78135	78140	0 %	0 %	50 %	50 %	110804135
105	NC_008258	GC	3	6	78238	78243	0 %	0 %	50 %	50 %	110804135
106	NC_008258	AT	3	6	78295	78300	50 %	50 %	0 %	0 %	110804135
107	NC_008258	GC	3	6	79186	79191	0 %	0 %	50 %	50 %	229774943
108	NC_008258	AT	3	6	81580	81585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008258	TC	3	6	82742	82747	0 %	50 %	0 %	50 %	110804138
110	NC_008258	TG	3	6	82900	82905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008258	CT	3	6	82908	82913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008258	GC	3	6	84211	84216	0 %	0 %	50 %	50 %	162139364
113	NC_008258	TC	3	6	84693	84698	0 %	50 %	0 %	50 %	162139364
114	NC_008258	GA	3	6	84854	84859	50 %	0 %	50 %	0 %	162139364
115	NC_008258	GC	3	6	85103	85108	0 %	0 %	50 %	50 %	110804140
116	NC_008258	CG	3	6	85334	85339	0 %	0 %	50 %	50 %	110804140
117	NC_008258	GC	3	6	86095	86100	0 %	0 %	50 %	50 %	110804142
118	NC_008258	CG	3	6	86164	86169	0 %	0 %	50 %	50 %	110804142
119	NC_008258	CA	3	6	87594	87599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008258	AG	3	6	89305	89310	50 %	0 %	50 %	0 %	110804146
121	NC_008258	AG	3	6	90930	90935	50 %	0 %	50 %	0 %	110804148
122	NC_008258	GA	3	6	91521	91526	50 %	0 %	50 %	0 %	110804149
123	NC_008258	AT	3	6	91603	91608	50 %	50 %	0 %	0 %	110804149
124	NC_008258	CG	3	6	92452	92457	0 %	0 %	50 %	50 %	110804149
125	NC_008258	GC	3	6	92567	92572	0 %	0 %	50 %	50 %	110804149
126	NC_008258	GC	3	6	93235	93240	0 %	0 %	50 %	50 %	110804150
127	NC_008258	CG	3	6	95296	95301	0 %	0 %	50 %	50 %	110804151
128	NC_008258	CG	3	6	96231	96236	0 %	0 %	50 %	50 %	110804152
129	NC_008258	GC	3	6	96495	96500	0 %	0 %	50 %	50 %	110804152
130	NC_008258	TC	3	6	96700	96705	0 %	50 %	0 %	50 %	110804153
131	NC_008258	GT	3	6	98482	98487	0 %	50 %	50 %	0 %	110804154
132	NC_008258	TG	3	6	99738	99743	0 %	50 %	50 %	0 %	110804155
133	NC_008258	CG	3	6	100149	100154	0 %	0 %	50 %	50 %	110804155
134	NC_008258	CG	3	6	100212	100217	0 %	0 %	50 %	50 %	110804155
135	NC_008258	TC	3	6	101168	101173	0 %	50 %	0 %	50 %	110804156
136	NC_008258	CA	3	6	102951	102956	50 %	0 %	0 %	50 %	110804158
137	NC_008258	GC	3	6	103345	103350	0 %	0 %	50 %	50 %	110804158
138	NC_008258	GA	3	6	103583	103588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008258	CT	3	6	104066	104071	0 %	50 %	0 %	50 %	110804159
140	NC_008258	GC	4	8	104359	104366	0 %	0 %	50 %	50 %	110804159
141	NC_008258	TG	3	6	105590	105595	0 %	50 %	50 %	0 %	110804160
142	NC_008258	CT	3	6	105807	105812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008258	GC	3	6	106360	106365	0 %	0 %	50 %	50 %	110804161
144	NC_008258	GC	3	6	107508	107513	0 %	0 %	50 %	50 %	110804162
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146	NC_008258	GC	3	6	110651	110656	0 %	0 %	50 %	50 %	110804165
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