MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 1509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008258	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008258	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008258	CG	3	6	7619	7624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008258	CG	3	6	7811	7816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008258	TA	3	6	8090	8095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008258	AT	3	6	12207	12212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008258	CT	3	6	15622	15627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008258	CT	3	6	15785	15790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008258	GA	3	6	17425	17430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008258	TA	3	6	19542	19547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008258	GT	3	6	19749	19754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008258	TC	3	6	19755	19760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008258	GC	3	6	42719	42724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008258	GT	3	6	56329	56334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008258	AG	3	6	67599	67604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008258	GC	3	6	75264	75269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008258	AT	3	6	81580	81585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008258	TG	3	6	82900	82905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008258	CT	3	6	82908	82913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008258	CA	3	6	87594	87599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008258	GA	3	6	103583	103588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008258	CT	3	6	105807	105812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008258	GC	3	6	111441	111446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008258	GT	3	6	114319	114324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008258	CG	3	6	114743	114748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008258	AG	3	6	118105	118110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008258	GT	3	6	119530	119535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008258	TA	3	6	119876	119881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008258	AT	3	6	125818	125823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008258	TC	3	6	136583	136588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008258	TG	3	6	139051	139056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008258	AG	3	6	148655	148660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008258	TG	3	6	152172	152177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008258	GC	3	6	156038	156043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008258	GA	3	6	156106	156111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008258	CT	3	6	168325	168330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008258	AT	4	8	180143	180150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008258	GC	3	6	180309	180314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008258	AC	4	8	180379	180386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008258	TA	3	6	180459	180464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008258	GC	3	6	183285	183290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008258	TG	4	8	183425	183432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008258	AG	3	6	185336	185341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008258	GC	3	6	203065	203070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008258	AG	3	6	203591	203596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008258	CG	3	6	203694	203699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008258	CA	3	6	214068	214073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008258	TG	3	6	214212	214217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008258	AC	3	6	215553	215558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008258	AC	3	6	215722	215727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008258	CA	3	6	215898	215903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008258	TC	3	6	216169	216174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008258	GT	5	10	216507	216516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008258	AC	3	6	217167	217172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008258	GA	3	6	217873	217878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008258	GT	3	6	219068	219073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008258	GA	3	6	219156	219161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008258	CT	3	6	220439	220444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008258	GC	3	6	232498	232503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008258	CG	3	6	232849	232854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008258	TC	4	8	233188	233195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008258	TC	3	6	233801	233806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008258	TA	3	6	238352	238357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008258	AT	3	6	239315	239320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008258	CG	3	6	273692	273697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008258	CT	3	6	282000	282005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008258	AT	3	6	285627	285632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008258	GA	3	6	285816	285821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008258	GA	3	6	285894	285899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008258	TG	3	6	285914	285919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008258	GT	3	6	286171	286176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008258	AT	3	6	286210	286215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008258	TG	3	6	286829	286834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008258	TC	3	6	292801	292806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008258	GT	4	8	292853	292860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008258	AG	3	6	297426	297431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008258	TC	3	6	300497	300502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008258	AT	3	6	304218	304223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008258	CG	3	6	304284	304289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008258	CG	3	6	310095	310100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008258	GT	3	6	317966	317971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008258	AT	3	6	332886	332891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008258	GA	3	6	333638	333643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008258	CT	3	6	337267	337272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008258	TA	3	6	338094	338099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008258	AT	3	6	344162	344167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008258	TA	3	6	344168	344173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008258	CG	3	6	347487	347492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008258	AG	3	6	348122	348127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008258	TC	3	6	348154	348159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008258	AG	3	6	348160	348165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008258	GC	3	6	348280	348285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008258	AC	3	6	348437	348442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008258	AG	3	6	348558	348563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008258	AG	3	6	353013	353018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008258	TA	3	6	353291	353296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008258	AT	3	6	363197	363202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008258	TG	3	6	363252	363257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008258	CT	3	6	371848	371853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008258	AT	3	6	371900	371905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008258	TA	3	6	382962	382967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008258	TG	3	6	387954	387959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008258	AT	3	6	394606	394611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008258	AC	3	6	395773	395778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008258	AG	3	6	414278	414283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008258	TC	3	6	414308	414313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008258	AT	3	6	414568	414573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008258	TA	3	6	415947	415952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008258	AG	3	6	418106	418111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008258	CA	3	6	418122	418127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008258	GC	3	6	418223	418228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008258	AG	4	8	418335	418342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008258	GA	3	6	418762	418767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008258	AC	3	6	418843	418848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008258	CG	3	6	420577	420582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008258	GC	3	6	421295	421300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008258	GA	3	6	421465	421470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008258	GC	3	6	421545	421550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008258	CT	3	6	427423	427428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008258	GC	3	6	427692	427697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008258	AG	4	8	431627	431634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008258	GC	3	6	434607	434612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008258	TA	3	6	440100	440105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008258	CA	3	6	445688	445693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008258	TG	3	6	448030	448035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008258	TG	3	6	454177	454182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008258	AT	3	6	464192	464197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008258	GA	4	8	468239	468246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008258	TC	3	6	469242	469247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008258	TC	3	6	469362	469367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008258	CG	3	6	469719	469724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008258	CG	3	6	474134	474139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008258	GA	3	6	478976	478981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008258	CG	3	6	479695	479700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008258	GC	3	6	482180	482185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008258	CT	3	6	487841	487846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008258	AG	3	6	489819	489824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008258	GC	4	8	492294	492301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008258	GC	3	6	493496	493501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008258	AT	3	6	496771	496776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008258	TC	4	8	497104	497111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008258	GC	3	6	498547	498552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008258	AG	3	6	509243	509248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008258	AT	3	6	510564	510569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008258	CG	3	6	510626	510631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008258	CA	3	6	510665	510670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008258	AG	4	8	513810	513817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008258	GC	3	6	513872	513877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008258	AT	3	6	514110	514115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008258	CT	3	6	514144	514149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008258	TA	3	6	514245	514250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008258	TA	3	6	514836	514841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008258	AC	3	6	515411	515416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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