MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 4110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008255	ATTTC	2	10	1487	1496	20 %	60 %	0 %	20 %	110636429
2	NC_008255	AATTG	2	10	2311	2320	40 %	40 %	20 %	0 %	110636430
3	NC_008255	AGTGC	2	10	3942	3951	20 %	20 %	40 %	20 %	110636431
4	NC_008255	TTCCT	2	10	5075	5084	0 %	60 %	0 %	40 %	110636433
5	NC_008255	TAAAA	2	10	5627	5636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008255	TTTTG	2	10	5810	5819	0 %	80 %	20 %	0 %	110636434
7	NC_008255	AAATC	2	10	6105	6114	60 %	20 %	0 %	20 %	110636434
8	NC_008255	ATTTA	2	10	8814	8823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008255	CGGCG	2	10	9377	9386	0 %	0 %	60 %	40 %	110636436
10	NC_008255	ATGAA	2	10	13599	13608	60 %	20 %	20 %	0 %	110636440
11	NC_008255	AAAAC	2	10	15115	15124	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008255	AAAAC	2	10	15504	15513	80 %	0 %	0 %	20 %	110636441
13	NC_008255	AACGG	2	10	16389	16398	40 %	0 %	40 %	20 %	110636441
14	NC_008255	TATTT	2	10	16532	16541	20 %	80 %	0 %	0 %	110636441
15	NC_008255	ACAGA	2	10	16789	16798	60 %	0 %	20 %	20 %	110636441
16	NC_008255	TTAAT	2	10	17448	17457	40 %	60 %	0 %	0 %	110636442
17	NC_008255	CAAAC	2	10	17501	17510	60 %	0 %	0 %	40 %	110636442
18	NC_008255	CAACG	2	10	18494	18503	40 %	0 %	20 %	40 %	110636443
19	NC_008255	TAAAT	2	10	18775	18784	60 %	40 %	0 %	0 %	110636444
20	NC_008255	TTTCG	2	10	19687	19696	0 %	60 %	20 %	20 %	110636445
21	NC_008255	AATAA	2	10	24340	24349	80 %	20 %	0 %	0 %	110636448
22	NC_008255	AAAAG	2	10	25161	25170	80 %	0 %	20 %	0 %	110636450
23	NC_008255	CAGGA	2	10	27299	27308	40 %	0 %	40 %	20 %	110636452
24	NC_008255	TTAAA	2	10	29516	29525	60 %	40 %	0 %	0 %	110636453
25	NC_008255	ATGCC	2	10	30321	30330	20 %	20 %	20 %	40 %	110636454
26	NC_008255	ACAGC	2	10	32200	32209	40 %	0 %	20 %	40 %	110636455
27	NC_008255	CAATA	2	10	32644	32653	60 %	20 %	0 %	20 %	110636456
28	NC_008255	TTCAG	2	10	34085	34094	20 %	40 %	20 %	20 %	110636456
29	NC_008255	ATACC	2	10	38192	38201	40 %	20 %	0 %	40 %	110636456
30	NC_008255	GGATT	2	10	39275	39284	20 %	40 %	40 %	0 %	110636456
31	NC_008255	ATGAT	2	10	39380	39389	40 %	40 %	20 %	0 %	110636456
32	NC_008255	TTTTA	2	10	40093	40102	20 %	80 %	0 %	0 %	110636458
33	NC_008255	CATTT	2	10	41040	41049	20 %	60 %	0 %	20 %	110636459
34	NC_008255	TTGTT	2	10	41660	41669	0 %	80 %	20 %	0 %	110636459
35	NC_008255	ACAAT	2	10	41748	41757	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008255	GCTTT	2	10	43040	43049	0 %	60 %	20 %	20 %	110636460
37	NC_008255	ATTTT	2	10	43121	43130	20 %	80 %	0 %	0 %	110636460
38	NC_008255	ATCTT	2	10	43563	43572	20 %	60 %	0 %	20 %	110636460
39	NC_008255	AAAAG	2	10	44079	44088	80 %	0 %	20 %	0 %	110636460
40	NC_008255	GATTG	2	10	44933	44942	20 %	40 %	40 %	0 %	110636461
41	NC_008255	GAGAT	2	10	44992	45001	40 %	20 %	40 %	0 %	110636461
42	NC_008255	TTTTA	2	10	45935	45944	20 %	80 %	0 %	0 %	110636461
43	NC_008255	AATTT	2	10	47141	47150	40 %	60 %	0 %	0 %	110636463
44	NC_008255	ATTTC	2	10	47253	47262	20 %	60 %	0 %	20 %	110636463
45	NC_008255	TTGAT	2	10	47450	47459	20 %	60 %	20 %	0 %	110636463
46	NC_008255	TAAAT	2	10	50123	50132	60 %	40 %	0 %	0 %	110636466
47	NC_008255	TATTT	2	10	50218	50227	20 %	80 %	0 %	0 %	110636466
48	NC_008255	AAATA	2	10	51273	51282	80 %	20 %	0 %	0 %	110636467
49	NC_008255	GAAAA	2	10	51605	51614	80 %	0 %	20 %	0 %	110636467
50	NC_008255	AAAAG	2	10	51851	51860	80 %	0 %	20 %	0 %	110636467
51	NC_008255	CTTTA	2	10	53356	53365	20 %	60 %	0 %	20 %	110636467
52	NC_008255	GGTAA	2	10	53650	53659	40 %	20 %	40 %	0 %	110636467
53	NC_008255	GAAGC	2	10	54256	54265	40 %	0 %	40 %	20 %	110636468
54	NC_008255	AGATG	2	10	55868	55877	40 %	20 %	40 %	0 %	110636470
55	NC_008255	ATTAT	2	10	56213	56222	40 %	60 %	0 %	0 %	110636470
56	NC_008255	CAATT	2	10	57576	57585	40 %	40 %	0 %	20 %	110636474
57	NC_008255	ATTAA	2	10	58087	58096	60 %	40 %	0 %	0 %	110636475
58	NC_008255	TTGAT	2	10	58163	58172	20 %	60 %	20 %	0 %	110636475
59	NC_008255	AGAAT	2	10	58649	58658	60 %	20 %	20 %	0 %	110636476
60	NC_008255	CAATA	2	10	59059	59068	60 %	20 %	0 %	20 %	110636476
61	NC_008255	TTTCT	2	10	59145	59154	0 %	80 %	0 %	20 %	110636476
62	NC_008255	TATTT	2	10	59264	59273	20 %	80 %	0 %	0 %	110636476
63	NC_008255	ATTTC	2	10	59759	59768	20 %	60 %	0 %	20 %	110636476
64	NC_008255	TTAGT	2	10	60153	60162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008255	GCAAG	2	10	60175	60184	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_008255	AAAAT	2	10	61412	61421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008255	GTTGG	2	10	62309	62318	0 %	40 %	60 %	0 %	110636478
68	NC_008255	AAAAG	2	10	63045	63054	80 %	0 %	20 %	0 %	110636478
69	NC_008255	AAATT	2	10	63528	63537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008255	TTAAC	2	10	64298	64307	40 %	40 %	0 %	20 %	110636479
71	NC_008255	AGAAA	2	10	65534	65543	80 %	0 %	20 %	0 %	110636480
72	NC_008255	GATTT	2	10	67089	67098	20 %	60 %	20 %	0 %	110636481
73	NC_008255	TCTGA	2	10	67161	67170	20 %	40 %	20 %	20 %	110636481
74	NC_008255	TAATT	2	10	67591	67600	40 %	60 %	0 %	0 %	110636482
75	NC_008255	CGTAT	2	10	69470	69479	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008255	AGCAG	2	10	69956	69965	40 %	0 %	40 %	20 %	110636484
77	NC_008255	CTGCT	2	10	69989	69998	0 %	40 %	20 %	40 %	110636484
78	NC_008255	TTTTG	2	10	70132	70141	0 %	80 %	20 %	0 %	110636484
79	NC_008255	TGAAA	2	10	70721	70730	60 %	20 %	20 %	0 %	110636485
80	NC_008255	GCTTC	2	10	74568	74577	0 %	40 %	20 %	40 %	110636488
81	NC_008255	CGCTG	2	10	76105	76114	0 %	20 %	40 %	40 %	110636489
82	NC_008255	ATATT	2	10	82831	82840	40 %	60 %	0 %	0 %	110636496
83	NC_008255	TTGAA	2	10	83161	83170	40 %	40 %	20 %	0 %	110636496
84	NC_008255	TTGGT	2	10	83185	83194	0 %	60 %	40 %	0 %	110636496
85	NC_008255	CTGAA	2	10	83572	83581	40 %	20 %	20 %	20 %	110636496
86	NC_008255	ATCAT	2	10	83782	83791	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_008255	AAACT	2	10	84723	84732	60 %	20 %	0 %	20 %	110636498
88	NC_008255	GAAAA	2	10	84756	84765	80 %	0 %	20 %	0 %	110636498
89	NC_008255	GTAAA	2	10	86384	86393	60 %	20 %	20 %	0 %	110636500
90	NC_008255	CTCTT	2	10	86917	86926	0 %	60 %	0 %	40 %	110636500
91	NC_008255	ACGAA	2	10	87488	87497	60 %	0 %	20 %	20 %	110636500
92	NC_008255	AGAAA	2	10	89628	89637	80 %	0 %	20 %	0 %	110636502
93	NC_008255	ACAAA	2	10	90999	91008	80 %	0 %	0 %	20 %	110636503
94	NC_008255	ATAAA	2	10	91959	91968	80 %	20 %	0 %	0 %	110636503
95	NC_008255	GAAAT	2	10	92640	92649	60 %	20 %	20 %	0 %	110636504
96	NC_008255	AAAAT	2	10	92965	92974	80 %	20 %	0 %	0 %	110636504
97	NC_008255	ATGAA	2	10	93226	93235	60 %	20 %	20 %	0 %	110636504
98	NC_008255	TATGG	2	10	93672	93681	20 %	40 %	40 %	0 %	110636505
99	NC_008255	ATTTA	2	10	96208	96217	40 %	60 %	0 %	0 %	110636507
100	NC_008255	GCTCA	2	10	98015	98024	20 %	20 %	20 %	40 %	110636887
101	NC_008255	CTAAA	2	10	98328	98337	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_008255	CATGG	2	10	100569	100578	20 %	20 %	40 %	20 %	110636512
103	NC_008255	GAACA	2	10	101182	101191	60 %	0 %	20 %	20 %	110636512
104	NC_008255	TTAAA	2	10	101636	101645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008255	ATATA	2	10	103825	103834	60 %	40 %	0 %	0 %	110636515
106	NC_008255	GCAGA	2	10	104573	104582	40 %	0 %	40 %	20 %	110636516
107	NC_008255	AAAAC	2	10	106664	106673	80 %	0 %	0 %	20 %	110636516
108	NC_008255	TGAAT	2	10	106783	106792	40 %	40 %	20 %	0 %	110636516
109	NC_008255	TGAAT	2	10	107613	107622	40 %	40 %	20 %	0 %	110636517
110	NC_008255	TTCAA	2	10	112400	112409	40 %	40 %	0 %	20 %	110636521
111	NC_008255	CAATA	2	10	112692	112701	60 %	20 %	0 %	20 %	110636521
112	NC_008255	TGCTT	2	10	113154	113163	0 %	60 %	20 %	20 %	110636521
113	NC_008255	TTTCA	2	10	113746	113755	20 %	60 %	0 %	20 %	110636521
114	NC_008255	GCCCA	2	10	114363	114372	20 %	0 %	20 %	60 %	110636522
115	NC_008255	TAAAG	2	10	116993	117002	60 %	20 %	20 %	0 %	110636525
116	NC_008255	GCCGG	2	10	118441	118450	0 %	0 %	60 %	40 %	110636526
117	NC_008255	AAAAG	2	10	119072	119081	80 %	0 %	20 %	0 %	110636527
118	NC_008255	AAGAA	2	10	119575	119584	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008255	GGAAA	2	10	119881	119890	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008255	AATAG	2	10	119911	119920	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008255	TAAAT	2	10	119928	119937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008255	CATGA	2	10	120218	120227	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008255	CAATT	2	10	121634	121643	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008255	GACCT	2	10	124408	124417	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_008255	GTGCA	2	10	124472	124481	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008255	GTTTT	2	10	125124	125133	0 %	80 %	20 %	0 %	110636528
127	NC_008255	ACGTT	2	10	125223	125232	20 %	40 %	20 %	20 %	110636528
128	NC_008255	ATCGG	2	10	125601	125610	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008255	TTATT	2	10	125813	125822	20 %	80 %	0 %	0 %	110636529
130	NC_008255	CAATC	2	10	126332	126341	40 %	20 %	0 %	40 %	110636529
131	NC_008255	TAATT	2	10	126499	126508	40 %	60 %	0 %	0 %	110636529
132	NC_008255	TGAAT	2	10	127736	127745	40 %	40 %	20 %	0 %	110636531
133	NC_008255	TATCG	2	10	128325	128334	20 %	40 %	20 %	20 %	110636532
134	NC_008255	GCTTT	2	10	128518	128527	0 %	60 %	20 %	20 %	110636532
135	NC_008255	GTTGC	2	10	130426	130435	0 %	40 %	40 %	20 %	110636533
136	NC_008255	ACGGT	2	10	132915	132924	20 %	20 %	40 %	20 %	110636536
137	NC_008255	GTTGG	2	10	137300	137309	0 %	40 %	60 %	0 %	110636538
138	NC_008255	CAATA	2	10	137845	137854	60 %	20 %	0 %	20 %	110636539
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401	NC_008255	TGCGT	2	10	408533	408542	0 %	40 %	40 %	20 %	110636763
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