MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chelativorans sp. BNC1 chromosome

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008254	ATCGCT	2	12	15698	15709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008254	TTCTGC	2	12	15742	15753	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008254	TCTCCC	2	12	112507	112518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008254	CTGGCG	2	12	115118	115129	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008254	GGGCCG	2	12	153865	153876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008254	ATGGCG	2	12	189521	189532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008254	CCGAAC	2	12	215709	215720	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008254	GCCGTC	2	12	245099	245110	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008254	GCCAAG	2	12	278620	278631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008254	CTTCCT	2	12	283247	283258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008254	CGAAAA	2	12	299882	299893	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008254	TCGAGA	2	12	372909	372920	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008254	CAGGAC	2	12	382028	382039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008254	GCCGGT	2	12	427609	427620	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008254	CTTTGC	2	12	540299	540310	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008254	CGCAAG	2	12	579073	579084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008254	GACCGC	2	12	583657	583668	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008254	CACTCT	2	12	594018	594029	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008254	GCCGCT	2	12	614318	614329	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008254	GAATTA	2	12	634258	634269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008254	CGCCGA	2	12	645835	645846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008254	CGCTGC	2	12	666386	666397	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008254	AGGTTG	2	12	680752	680763	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008254	GGCATC	2	12	782040	782051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008254	GCGGGC	2	12	833487	833498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008254	GTATCC	2	12	854554	854565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008254	GGGCGC	2	12	895912	895923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008254	CTTAAC	2	12	942822	942833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008254	GTGACG	2	12	977577	977588	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008254	ACGGTG	2	12	980436	980447	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008254	CGCCAT	2	12	1024844	1024855	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008254	ATGCCA	2	12	1042164	1042175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008254	CAGGCG	2	12	1049645	1049656	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008254	GTTCCG	2	12	1114341	1114352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008254	AAAACG	2	12	1128612	1128623	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008254	AAGCAT	2	12	1212003	1212014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008254	GCTTCA	2	12	1296243	1296254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008254	CGGTGC	2	12	1297522	1297533	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008254	CCCGGC	2	12	1339088	1339099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008254	AAAATC	2	12	1343224	1343235	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008254	CAGTGA	2	12	1353470	1353481	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008254	GCTACC	2	12	1413031	1413042	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008254	GGCATA	2	12	1459885	1459896	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008254	GGCGAT	2	12	1504417	1504428	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008254	AAGATC	2	12	1518045	1518056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008254	TCCTTC	2	12	1570753	1570764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008254	AACAAT	2	12	1684514	1684525	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008254	CCGCGC	2	12	1737492	1737503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008254	TTTGAT	2	12	1769102	1769113	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008254	CAAAAG	2	12	1782167	1782178	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008254	CCGGCA	2	12	1867095	1867106	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008254	GTTGCC	2	12	1867234	1867245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008254	TCTGCG	2	12	1872260	1872271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008254	CCTGAA	2	12	1885137	1885148	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008254	CCCTCG	2	12	1916478	1916489	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008254	TTTGTA	2	12	1965535	1965546	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008254	CGAGAA	2	12	2015453	2015464	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008254	GCCGGC	2	12	2016557	2016568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008254	CGCCCG	2	12	2037272	2037283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008254	CCTGGA	2	12	2142168	2142179	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008254	TCTGTG	2	12	2144869	2144880	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008254	CACCCG	2	12	2165273	2165284	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008254	AACCGG	2	12	2221581	2221592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008254	CTCCTT	2	12	2240742	2240753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008254	GCTTTT	2	12	2240990	2241001	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008254	GCTGGC	2	12	2263523	2263534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008254	CGGCGA	2	12	2289977	2289988	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008254	CCCCTC	2	12	2336917	2336928	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
69	NC_008254	CAAGAA	2	12	2351126	2351137	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008254	CTGCCG	2	12	2402219	2402230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008254	TCTCCC	2	12	2420605	2420616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008254	CGACCA	2	12	2445087	2445098	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008254	GAGTGT	2	12	2486358	2486369	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008254	CACTCT	2	12	2498520	2498531	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008254	CAGCGC	2	12	2530958	2530969	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008254	ATCGCG	2	12	2530970	2530981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008254	CCGCGC	2	12	2738154	2738165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008254	AACGCG	2	12	2750289	2750300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008254	AAAACC	2	12	2937432	2937443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008254	GCGAAG	2	12	2961296	2961307	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008254	TCCATT	2	12	3013893	3013904	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008254	CGGTGG	2	12	3131433	3131444	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008254	TGAGTT	2	12	3148923	3148934	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008254	CGGAAT	2	12	3149255	3149266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008254	GGCGCA	2	12	3160209	3160220	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008254	ATCAAA	2	12	3160361	3160372	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008254	CCGCGC	2	12	3255666	3255677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008254	CTCCAT	2	12	3283639	3283650	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008254	GAACCG	2	12	3288567	3288578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008254	CAGACA	2	12	3399458	3399469	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008254	TCGCCG	2	12	3418452	3418463	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008254	TGAAAT	2	12	3433744	3433755	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008254	AGCCGT	2	12	3461354	3461365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008254	CCTGCA	2	12	3505386	3505397	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008254	GAACGG	2	12	3630050	3630061	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008254	GATTCT	2	12	3754998	3755009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_008254	GGGCAA	2	12	3790200	3790211	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008254	CTGTGG	2	12	3802111	3802122	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_008254	GCCGTC	2	12	3819874	3819885	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008254	GAAGCC	2	12	3835785	3835796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008254	GCAAAG	2	12	3884142	3884153	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008254	CCGGAC	2	12	3913774	3913785	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008254	CCGCGC	2	12	3992515	3992526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_008254	ATGAAC	2	12	3992538	3992549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_008254	CGAAGG	2	12	4096864	4096875	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008254	AGGGTA	2	12	4106671	4106682	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008254	CGATGA	2	12	4109922	4109933	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008254	GCAGCC	2	12	4125378	4125389	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008254	GAGAGG	2	12	4132525	4132536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008254	ACCCGG	2	12	4138212	4138223	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008254	GTCGGT	2	12	4140325	4140336	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008254	TCGCAC	2	12	4164285	4164296	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008254	GAACAA	2	12	4177653	4177664	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_008254	GTTCGT	2	12	4194469	4194480	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008254	GGCCGA	2	12	4248477	4248488	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008254	TGGCCT	2	12	4264711	4264722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.