MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chelativorans sp. BNC1 chromosome

Total Repeats: 1346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008254	GAAG	2	8	9470	9477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008254	AGGT	2	8	9563	9570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008254	GCTA	2	8	11162	11169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008254	GAAG	2	8	15516	15523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008254	AGGT	2	8	17109	17116	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008254	CATC	2	8	17236	17243	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008254	GATA	2	8	26306	26313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008254	GAGT	2	8	26436	26443	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008254	CCGC	2	8	27021	27028	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_008254	GAGG	2	8	73053	73060	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008254	GAGG	2	8	92972	92979	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008254	TTGA	2	8	99148	99155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008254	CAGC	2	8	108161	108168	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008254	TCAC	2	8	108468	108475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008254	TCAT	2	8	111035	111042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008254	TGTT	2	8	111294	111301	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008254	CCGG	2	8	113807	113814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008254	AGGG	2	8	115063	115070	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008254	CGGC	2	8	115279	115286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008254	CGTC	2	8	115677	115684	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008254	GGCG	2	8	116622	116629	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008254	CTGC	2	8	117975	117982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008254	CGAT	3	12	122136	122147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008254	GAAA	2	8	123433	123440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008254	TCAA	2	8	124970	124977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008254	GCCG	2	8	124994	125001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008254	TACA	2	8	125475	125482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008254	GTAA	2	8	125749	125756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008254	GCGG	2	8	126632	126639	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008254	CCGT	2	8	129380	129387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008254	GTGC	2	8	141357	141364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008254	GGCC	2	8	141557	141564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008254	CGTC	2	8	141584	141591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008254	TTGC	2	8	144871	144878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008254	GCAG	2	8	144921	144928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008254	ATTC	2	8	147835	147842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008254	GGAA	2	8	148408	148415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008254	GAAT	2	8	148947	148954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008254	TCAT	2	8	157450	157457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008254	TGGA	2	8	167726	167733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008254	GTTT	2	8	172474	172481	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008254	CTTG	2	8	172990	172997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008254	AAGG	2	8	177285	177292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008254	CGGA	2	8	179343	179350	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008254	TGAA	2	8	179381	179388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008254	TCGG	2	8	179420	179427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008254	CCTT	2	8	182040	182047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008254	TCCC	2	8	185302	185309	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_008254	TTAG	2	8	189566	189573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008254	AGCC	2	8	195660	195667	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008254	AGAA	2	8	198573	198580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008254	ACGT	2	8	199175	199182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008254	TGCT	2	8	205515	205522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008254	TCTT	2	8	210584	210591	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008254	CGTT	2	8	215063	215070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008254	CTCC	2	8	215088	215095	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_008254	CCCT	2	8	215319	215326	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_008254	CCGG	2	8	215583	215590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008254	CTGG	2	8	220449	220456	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008254	TTCG	2	8	229541	229548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008254	CTGC	2	8	230017	230024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008254	CTGC	2	8	240703	240710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008254	ATTC	2	8	240768	240775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008254	GTGC	2	8	244283	244290	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008254	CGAC	2	8	247628	247635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008254	TTTC	2	8	248117	248124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008254	CGGG	2	8	249172	249179	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008254	CAGA	2	8	250105	250112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008254	GACC	2	8	250647	250654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008254	TCAA	2	8	252525	252532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008254	GTTC	2	8	253178	253185	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008254	CAAG	2	8	253192	253199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008254	CTTT	2	8	253256	253263	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008254	ATTG	2	8	253403	253410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008254	ACCA	2	8	265906	265913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008254	CGGG	2	8	276639	276646	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008254	ATTG	2	8	276716	276723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008254	CGCT	2	8	278608	278615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008254	TCAT	2	8	280741	280748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008254	GCAC	2	8	280896	280903	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008254	TTCT	2	8	281555	281562	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008254	CCAT	2	8	282839	282846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008254	TTGC	2	8	282992	282999	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008254	CCAG	2	8	283039	283046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008254	TTGC	2	8	283101	283108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008254	TTGC	2	8	283158	283165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008254	CGCC	2	8	287010	287017	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_008254	TGGG	2	8	287258	287265	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008254	CAAC	2	8	287314	287321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008254	CCGC	2	8	300123	300130	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_008254	CGGC	2	8	300975	300982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008254	AGGC	2	8	306946	306953	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008254	GCAG	2	8	308110	308117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008254	TTTC	2	8	314541	314548	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008254	GCGG	2	8	325916	325923	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008254	ACTC	2	8	327946	327953	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008254	CATG	2	8	327957	327964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008254	GGAA	2	8	346536	346543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008254	AGGC	2	8	346547	346554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008254	GATA	2	8	358942	358949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008254	GCAT	2	8	367629	367636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008254	GGCA	2	8	368850	368857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008254	TGTC	2	8	371301	371308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008254	TCAC	2	8	386261	386268	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008254	TGGC	2	8	386283	386290	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008254	CCGC	2	8	386344	386351	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_008254	CGCT	2	8	390113	390120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008254	AGAA	2	8	392318	392325	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008254	AAGC	2	8	392525	392532	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008254	ACGG	2	8	392580	392587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008254	CCTC	2	8	396596	396603	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_008254	AGCA	2	8	402659	402666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008254	GCCG	2	8	403515	403522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008254	CGAG	2	8	408141	408148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008254	CCGT	2	8	414268	414275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008254	CGGC	2	8	414564	414571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008254	TGCC	2	8	416077	416084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008254	AGCG	2	8	417524	417531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008254	CGGG	2	8	417545	417552	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008254	CCTT	2	8	420140	420147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008254	GTCG	2	8	421668	421675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008254	GAAC	2	8	426087	426094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008254	ACCC	2	8	427579	427586	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_008254	ATCC	2	8	428964	428971	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008254	GTCG	2	8	447319	447326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008254	GATG	2	8	457563	457570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008254	CTGG	2	8	458202	458209	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008254	AGCG	2	8	468696	468703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008254	CGTT	2	8	478216	478223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008254	CCGC	2	8	493496	493503	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_008254	TTTC	2	8	493532	493539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008254	GAGG	2	8	493702	493709	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008254	TTTC	2	8	495189	495196	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008254	CGAT	2	8	495199	495206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008254	AGCC	2	8	497543	497550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008254	GTGA	2	8	497555	497562	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008254	GGCC	2	8	503449	503456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008254	GCCT	2	8	505042	505049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008254	CAAG	2	8	506264	506271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008254	TGGA	2	8	506400	506407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008254	AAAT	2	8	513903	513910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008254	CAGT	2	8	529756	529763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008254	GATC	2	8	529939	529946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008254	CTTT	2	8	529956	529963	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008254	CATT	2	8	538657	538664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008254	GAAG	2	8	543869	543876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008254	ATCC	2	8	546317	546324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008254	GTTG	2	8	546339	546346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008254	GCAA	2	8	546483	546490	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008254	CTTC	2	8	549241	549248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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440	NC_008254	ATCG	2	8	1480581	1480588	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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456	NC_008254	CCCG	2	8	1495457	1495464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
457	NC_008254	TTCT	2	8	1504403	1504410	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_008254	GCTC	2	8	1527448	1527455	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
464	NC_008254	CCAT	2	8	1527998	1528005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
465	NC_008254	CATT	2	8	1528039	1528046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
466	NC_008254	ATTC	2	8	1529477	1529484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
467	NC_008254	TGCT	2	8	1533195	1533202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
468	NC_008254	CAGC	2	8	1535860	1535867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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473	NC_008254	CGCC	2	8	1555194	1555201	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
474	NC_008254	AAGG	2	8	1556001	1556008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_008254	CTCG	2	8	1558919	1558926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
477	NC_008254	CCAA	2	8	1558927	1558934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
478	NC_008254	GGCA	2	8	1560685	1560692	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
479	NC_008254	AGCG	2	8	1564518	1564525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
480	NC_008254	CAGG	2	8	1566951	1566958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
481	NC_008254	GAGG	2	8	1567032	1567039	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
482	NC_008254	GCCC	2	8	1573863	1573870	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
483	NC_008254	CGGC	2	8	1574898	1574905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
484	NC_008254	CGCC	2	8	1574917	1574924	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
485	NC_008254	CTTT	2	8	1574930	1574937	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_008254	TTTC	2	8	1581036	1581043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
487	NC_008254	ACCC	2	8	1581064	1581071	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
488	NC_008254	GCGG	2	8	1581083	1581090	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
489	NC_008254	ATCT	2	8	1581706	1581713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_008254	CGGG	2	8	1581763	1581770	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
491	NC_008254	CAAC	2	8	1581859	1581866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
492	NC_008254	AGGC	2	8	1584426	1584433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_008254	GAGC	2	8	1587526	1587533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
494	NC_008254	AAGG	2	8	1592706	1592713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
495	NC_008254	TGCG	2	8	1594439	1594446	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_008254	GGGA	2	8	1596592	1596599	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
497	NC_008254	CCAG	2	8	1601048	1601055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_008254	CGCC	2	8	1603661	1603668	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
499	NC_008254	AACC	2	8	1605212	1605219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
500	NC_008254	GCTG	2	8	1611430	1611437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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