MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli 536

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008253	GAAAAT	2	12	10682	10693	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008253	AAGGGA	2	12	85649	85660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008253	ATTGTT	2	12	153047	153058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008253	GTAGTG	2	12	204588	204599	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008253	TGTTGA	2	12	262834	262845	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008253	CTTTTC	2	12	278825	278836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008253	TCACAA	2	12	334436	334447	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008253	CCCGAT	2	12	355871	355882	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008253	CGTCAC	2	12	357931	357942	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008253	TTTTCT	2	12	396768	396779	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008253	CTATTT	2	12	397805	397816	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008253	AATTTC	2	12	404533	404544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008253	TGTCTG	2	12	414456	414467	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008253	TGAGGT	2	12	414649	414660	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008253	TTTATT	2	12	426621	426632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008253	TATTGA	2	12	477584	477595	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008253	TGCGCT	2	12	508828	508839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008253	TCGAAG	2	12	509005	509016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008253	TGGAAG	2	12	509230	509241	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008253	TTTTCA	2	12	539718	539729	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008253	CAGGCG	2	12	558562	558573	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008253	TGCAAA	2	12	648781	648792	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008253	ATTTTT	2	12	743481	743492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008253	TTTACC	2	12	754393	754404	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008253	GCCCGC	2	12	756263	756274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008253	GCTCTG	2	12	784374	784385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008253	TAACCG	2	12	936618	936629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008253	CTGGAA	2	12	974735	974746	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008253	AGCGAT	2	12	1000332	1000343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008253	TAAGGA	2	12	1033417	1033428	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008253	ATAATG	2	12	1034832	1034843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008253	TGGTAA	2	12	1059947	1059958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008253	TGTTAA	2	12	1068497	1068508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008253	CAAAAA	2	12	1112103	1112114	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008253	TCTGCT	2	12	1191765	1191776	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008253	GCTATT	2	12	1194418	1194429	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008253	ACAGGA	2	12	1201969	1201980	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008253	AAATGA	2	12	1232683	1232694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008253	AGGGGG	2	12	1245327	1245338	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008253	CTTATT	2	12	1315060	1315071	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008253	CAAAAG	2	12	1322111	1322122	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008253	CTGATC	2	12	1332588	1332599	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008253	AAAGTT	2	12	1336837	1336848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008253	TATAAC	2	12	1387586	1387597	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008253	GAGATT	2	12	1468720	1468731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008253	GTTAAT	2	12	1499118	1499129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008253	AAAAAC	2	12	1525486	1525497	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008253	CGTTGT	2	12	1526874	1526885	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008253	ACCGTT	2	12	1533058	1533069	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008253	TGGTTA	2	12	1541888	1541899	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008253	CAAAAA	2	12	1575404	1575415	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008253	ATACTT	2	12	1656092	1656103	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008253	AAAATA	2	12	1669751	1669762	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008253	TGTTTT	2	12	1670384	1670395	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008253	TATTAC	2	12	1789323	1789334	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008253	TTTCTT	2	12	1801776	1801787	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008253	ACTGTC	2	12	1849377	1849388	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008253	GCGCAC	2	12	1866986	1866997	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008253	AATTCA	2	12	1895495	1895506	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008253	TCTTAT	2	12	1903127	1903138	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008253	ATATTT	2	12	1938780	1938791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008253	GTCAAC	2	12	1954288	1954299	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008253	TTATAT	2	12	1958456	1958467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008253	TAAAGT	2	12	1963790	1963801	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008253	AAATAA	2	12	1964106	1964117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008253	AATATA	2	12	1965808	1965819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008253	ATTTTT	2	12	2010917	2010928	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008253	CTGATA	2	12	2074428	2074439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008253	GAAAAC	2	12	2100308	2100319	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008253	TTTTGT	2	12	2160780	2160791	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008253	CCTTAC	2	12	2245084	2245095	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008253	TCTTCC	2	12	2304683	2304694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008253	CGCATC	2	12	2333244	2333255	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008253	GACACT	2	12	2360891	2360902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008253	TAAATG	2	12	2438187	2438198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008253	TGTCAC	2	12	2451822	2451833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008253	AGCGGA	2	12	2454958	2454969	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008253	AGAAAA	2	12	2462102	2462113	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008253	GTTAAC	2	12	2499625	2499636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008253	GTTAAC	2	12	2499689	2499700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008253	CTGATG	2	12	2518433	2518444	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008253	GTTATG	2	12	2536275	2536286	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008253	TCGATA	2	12	2546901	2546912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008253	CAAGTG	2	12	2553243	2553254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008253	TCCTTC	2	12	2649032	2649043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008253	TGAGCG	2	12	2684945	2684956	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008253	TGGACA	2	12	2694955	2694966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008253	GGAGAA	2	12	2794852	2794863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008253	TGACGC	2	12	2861296	2861307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008253	GGTTTT	2	12	2911436	2911447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008253	ACAAGA	2	12	2915766	2915777	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_008253	TTTGTT	2	12	2940592	2940603	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008253	GTAAGG	2	12	3074711	3074722	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008253	TCTTTT	2	12	3105705	3105716	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008253	ACACCC	2	12	3139254	3139265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_008253	GAGGTA	3	18	3160916	3160933	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008253	GAAAAC	2	12	3164896	3164907	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008253	CGTCAC	2	12	3173939	3173950	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008253	TTTTCG	2	12	3222828	3222839	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008253	ATAAAA	2	12	3286129	3286140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008253	ATTTAA	2	12	3296869	3296880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008253	AGTTGT	2	12	3322715	3322726	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008253	CTTTTT	2	12	3327392	3327403	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008253	AATGAT	2	12	3328227	3328238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008253	TCTCCC	2	12	3350617	3350628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008253	GTAACC	2	12	3381653	3381664	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008253	TGCATT	2	12	3390463	3390474	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008253	TTTTAT	2	12	3392360	3392371	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008253	AAGCGA	2	12	3397761	3397772	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008253	GCGCGT	2	12	3465782	3465793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008253	AGCGTT	2	12	3528250	3528261	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008253	TTTATA	2	12	3544839	3544850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008253	CGTCAC	2	12	3591167	3591178	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008253	CATTGC	2	12	3622919	3622930	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008253	ACCGAT	2	12	3623268	3623279	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008253	AATTTA	2	12	3652871	3652882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008253	TGATAA	2	12	3679759	3679770	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008253	AAGATA	2	12	3744455	3744466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008253	AGATGC	2	12	3759924	3759935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_008253	TGAAAA	2	12	3783811	3783822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008253	TTTGCC	2	12	3820443	3820454	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008253	GCCAGC	2	12	3822520	3822531	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008253	CTGAAG	2	12	3824993	3825004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_008253	TATCAA	2	12	3878820	3878831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008253	TCACCT	2	12	3917026	3917037	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008253	TAATTT	2	12	3973043	3973054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008253	TTTACT	2	12	3973083	3973094	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_008253	CCTGAA	2	12	3974637	3974648	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008253	TTAACA	2	12	4016813	4016824	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_008253	AATTCC	2	12	4016843	4016854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008253	TTTATA	2	12	4038492	4038503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008253	AAAATC	2	12	4119729	4119740	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_008253	CTTTTT	2	12	4125129	4125140	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_008253	AAATAT	2	12	4136121	4136132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008253	AAATGG	2	12	4256837	4256848	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_008253	GCTTTG	2	12	4286253	4286264	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_008253	CCATGC	2	12	4286792	4286803	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008253	TTTGTT	2	12	4287404	4287415	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008253	GGGAGT	2	12	4289167	4289178	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008253	ATAAAA	2	12	4300849	4300860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008253	ATTTTT	2	12	4365049	4365060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008253	TCATTT	2	12	4432117	4432128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_008253	AATATC	2	12	4537169	4537180	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_008253	CTGATA	2	12	4572815	4572826	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_008253	TTTTAT	2	12	4622515	4622526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008253	TTTAAT	2	12	4654374	4654385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_008253	TTTCTC	2	12	4835033	4835044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_008253	GTGATT	2	12	4874494	4874505	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.