MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis FSC198 chromosome

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008245	AATCA	2	10	4443	4452	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008245	ATGGT	2	10	4477	4486	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008245	ATTAA	2	10	4629	4638	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008245	TAGCT	2	10	5904	5913	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008245	AAAGA	2	10	8714	8723	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008245	CTTTT	2	10	14515	14524	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008245	ATTAA	2	10	24607	24616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008245	GATTT	2	10	46155	46164	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008245	TTGGT	2	10	46356	46365	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008245	GATAG	2	10	47054	47063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008245	TTAAT	2	10	47457	47466	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008245	AATTT	2	10	59591	59600	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008245	AAACT	2	10	85587	85596	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008245	TTTAT	2	10	88701	88710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008245	GTTTT	2	10	92933	92942	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008245	AATGT	2	10	96740	96749	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008245	AATAT	2	10	96769	96778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008245	TTGAT	2	10	105657	105666	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008245	GTATG	2	10	135002	135011	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008245	GGTGT	2	10	136244	136253	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008245	CTAGT	2	10	147838	147847	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008245	TTTAT	2	10	168744	168753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008245	AATGT	2	10	182253	182262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008245	TTTTA	2	10	187095	187104	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008245	TAAAT	2	10	195456	195465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008245	ATGTA	2	10	200261	200270	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008245	TTATC	2	10	200271	200280	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008245	TTTAT	2	10	202364	202373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008245	TAATG	2	10	202398	202407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008245	TAAAG	2	10	203745	203754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008245	CTTTT	2	10	218652	218661	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008245	AAAGC	2	10	241787	241796	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008245	TAAAC	2	10	242168	242177	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008245	AATAA	2	10	244928	244937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008245	TCAAG	2	10	250224	250233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008245	GCTAG	2	10	251120	251129	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008245	CTATA	2	10	254135	254144	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008245	TATTT	2	10	254751	254760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008245	CTATA	2	10	260982	260991	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008245	AAAAT	2	10	270383	270392	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008245	ATTTT	2	10	287222	287231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008245	AGCAA	2	10	288717	288726	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008245	TTTAT	2	10	288976	288985	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008245	ATACG	2	10	289540	289549	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008245	TTAAG	2	10	293847	293856	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008245	AGATT	2	10	293941	293950	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008245	AAAAC	2	10	300499	300508	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008245	AAGCA	2	10	307839	307848	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008245	AAAAT	2	10	319283	319292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008245	TAATA	2	10	337632	337641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008245	ATTTT	2	10	342307	342316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008245	ATTTC	2	10	351024	351033	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008245	AGAAA	2	10	352130	352139	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008245	TCAAT	2	10	352775	352784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008245	CTTTT	2	10	356997	357006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008245	CCAAG	2	10	358508	358517	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_008245	GTAAA	2	10	376817	376826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008245	TAAGA	2	10	378754	378763	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008245	ATTGA	2	10	381017	381026	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008245	TTTCT	2	10	381662	381671	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008245	TAATT	2	10	383518	383527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008245	TGAAA	2	10	396267	396276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008245	TAATT	2	10	401030	401039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008245	TTTTA	2	10	408956	408965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008245	AGTTA	2	10	408975	408984	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008245	TTAAC	2	10	436291	436300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008245	CAAGA	2	10	441732	441741	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008245	AGTGT	2	10	441855	441864	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008245	TTTAA	2	10	444765	444774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008245	TCTCT	2	10	454449	454458	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_008245	AACTT	2	10	459223	459232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008245	TTTTC	2	10	481340	481349	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008245	AAACT	2	10	501061	501070	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008245	ATTAT	2	10	508944	508953	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008245	ATTTA	2	10	508961	508970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008245	CTAGG	2	10	513679	513688	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_008245	ATTTG	2	10	518568	518577	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008245	TTTGT	2	10	521693	521702	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008245	ACAAA	2	10	524672	524681	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008245	ATTTA	2	10	527297	527306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008245	ATTAT	2	10	532791	532800	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008245	ATTAG	2	10	550353	550362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008245	AAGAA	2	10	552511	552520	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008245	AGCTA	2	10	562740	562749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008245	GTATT	2	10	570071	570080	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008245	AACAA	2	10	575129	575138	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_008245	ATTTG	2	10	583854	583863	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008245	GTTTT	2	10	587497	587506	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008245	TTTTA	2	10	599195	599204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008245	TTGAT	2	10	600603	600612	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008245	CTTTT	2	10	604653	604662	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008245	TAAAA	2	10	604793	604802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008245	TATCT	2	10	605062	605071	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008245	AAGAA	2	10	605588	605597	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008245	AACAA	2	10	605625	605634	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008245	TTATA	2	10	611900	611909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008245	ATTTT	2	10	612116	612125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008245	TAGAA	2	10	617397	617406	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008245	GATAT	2	10	618737	618746	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008245	TTTTA	2	10	619737	619746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008245	TAATT	2	10	638638	638647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008245	CTTTT	2	10	650197	650206	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008245	TAATA	2	10	661982	661991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008245	ATAAA	2	10	677149	677158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008245	TATAA	2	10	678178	678187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008245	ATTTT	2	10	680582	680591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008245	TATTT	2	10	681113	681122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008245	TTATA	2	10	687911	687920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008245	TTGAT	2	10	689624	689633	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008245	CTGCT	2	10	689738	689747	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_008245	CCAAG	2	10	689949	689958	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_008245	ATTTA	2	10	691765	691774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008245	AATAA	2	10	691859	691868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008245	TATCT	2	10	712416	712425	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008245	TTAAT	2	10	717594	717603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008245	GAAAA	2	10	724982	724991	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008245	AGGTG	2	10	737348	737357	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008245	CAAAT	2	10	737409	737418	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008245	TAGTT	2	10	748878	748887	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008245	AACTT	2	10	758759	758768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008245	ATTTA	2	10	760797	760806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008245	TTTTG	2	10	773524	773533	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008245	ATTTT	2	10	773991	774000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008245	AAATA	2	10	780395	780404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008245	TATTT	2	10	792800	792809	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008245	ATTAT	2	10	793671	793680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008245	TTATT	2	10	793969	793978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008245	AAATG	2	10	795092	795101	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008245	ATAGT	2	10	795326	795335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008245	AAATT	2	10	802412	802421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008245	TATAT	2	10	824739	824748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008245	TAAAA	2	10	832034	832043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008245	AATAT	2	10	834994	835003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008245	ATTTA	2	10	852219	852228	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008245	AATCT	2	10	856620	856629	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008245	ACTAC	2	10	857397	857406	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_008245	GAACA	2	10	857834	857843	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008245	GCGAT	2	10	865023	865032	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008245	GCTTG	2	10	865964	865973	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008245	ATTTC	2	10	871430	871439	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_008245	TATCT	2	10	876462	876471	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008245	AGATA	2	10	878560	878569	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008245	AATCT	2	10	887121	887130	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008245	ATTTA	2	10	893032	893041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008245	TAGTT	2	10	898978	898987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008245	TTAGA	2	10	899207	899216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008245	GATTT	2	10	901055	901064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008245	CTGTC	2	10	907289	907298	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_008245	TTTAT	2	10	909837	909846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008245	AATAA	2	10	916124	916133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008245	GTTTT	2	10	932058	932067	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_008245	TATTT	2	10	996813	996822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008245	TATTT	2	10	996825	996834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_008245	TAGCT	2	10	1086485	1086494	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_008245	AATAA	2	10	1117946	1117955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_008245	AAATA	2	10	1373306	1373315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_008245	AAGTC	2	10	1801872	1801881	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
330	NC_008245	TATTT	2	10	1816398	1816407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_008245	ACTAA	2	10	1830636	1830645	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
332	NC_008245	AAATA	2	10	1830821	1830830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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334	NC_008245	ATTAT	2	10	1835365	1835374	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_008245	AGGGT	2	10	1843990	1843999	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_008245	TAGTA	2	10	1864312	1864321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
342	NC_008245	TTCAA	2	10	1869541	1869550	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
343	NC_008245	TAAAC	2	10	1876935	1876944	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
344	NC_008245	TAGCA	2	10	1882258	1882267	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
345	NC_008245	TTGTT	2	10	1887369	1887378	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
346	NC_008245	TTTAT	2	10	1888236	1888245	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
347	NC_008245	TTTTA	2	10	1892197	1892206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.