MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chelativorans sp. BNC1 plasmid 3

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008244	ATGGG	2	10	551	560	20 %	20 %	60 %	0 %	110347350
2	NC_008244	GATCG	2	10	3672	3681	20 %	20 %	40 %	20 %	110347352
3	NC_008244	CGGGC	2	10	5869	5878	0 %	0 %	60 %	40 %	110347355
4	NC_008244	GTCGC	2	10	9162	9171	0 %	20 %	40 %	40 %	110347357
5	NC_008244	CGCCA	2	10	11181	11190	20 %	0 %	20 %	60 %	110347359
6	NC_008244	ACGGC	2	10	11444	11453	20 %	0 %	40 %	40 %	110347359
7	NC_008244	CCGCA	2	10	11526	11535	20 %	0 %	20 %	60 %	110347359
8	NC_008244	CGGCA	2	10	13390	13399	20 %	0 %	40 %	40 %	110347361
9	NC_008244	ACGGC	2	10	14724	14733	20 %	0 %	40 %	40 %	110347363
10	NC_008244	TGCCC	2	10	15529	15538	0 %	20 %	20 %	60 %	110347365
11	NC_008244	CCTCC	2	10	15897	15906	0 %	20 %	0 %	80 %	110347365
12	NC_008244	GCCTC	2	10	16407	16416	0 %	20 %	20 %	60 %	110347365
13	NC_008244	CTCCC	2	10	16560	16569	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_008244	TGTCC	2	10	16920	16929	0 %	40 %	20 %	40 %	110347367
15	NC_008244	TCGCT	2	10	17431	17440	0 %	40 %	20 %	40 %	110347368
16	NC_008244	AGACT	2	10	18139	18148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008244	GACCC	2	10	18560	18569	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_008244	GCCGC	2	10	18601	18610	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_008244	GATGT	2	10	19645	19654	20 %	40 %	40 %	0 %	110347369
20	NC_008244	GCATG	2	10	21441	21450	20 %	20 %	40 %	20 %	110347371
21	NC_008244	AGGGC	2	10	21545	21554	20 %	0 %	60 %	20 %	110347371
22	NC_008244	GCAAG	2	10	21797	21806	40 %	0 %	40 %	20 %	110347371
23	NC_008244	AGGGC	2	10	22291	22300	20 %	0 %	60 %	20 %	110347371
24	NC_008244	CCCGG	2	10	25155	25164	0 %	0 %	40 %	60 %	110347375
25	NC_008244	GCGCG	2	10	25885	25894	0 %	0 %	60 %	40 %	110347376
26	NC_008244	CGTGT	2	10	26797	26806	0 %	40 %	40 %	20 %	110347378
27	NC_008244	GCACC	2	10	30001	30010	20 %	0 %	20 %	60 %	110347380
28	NC_008244	GCACA	2	10	30088	30097	40 %	0 %	20 %	40 %	110347381
29	NC_008244	GCCGC	2	10	30542	30551	0 %	0 %	40 %	60 %	110347381
30	NC_008244	GGTGA	2	10	30796	30805	20 %	20 %	60 %	0 %	110347382
31	NC_008244	CGGCT	2	10	31679	31688	0 %	20 %	40 %	40 %	110347384
32	NC_008244	CGGAC	2	10	31885	31894	20 %	0 %	40 %	40 %	110347384
33	NC_008244	CGCGG	2	10	31987	31996	0 %	0 %	60 %	40 %	110347385
34	NC_008244	TCCTA	2	10	33558	33567	20 %	40 %	0 %	40 %	110347387
35	NC_008244	TCCGG	2	10	35526	35535	0 %	20 %	40 %	40 %	110347388
36	NC_008244	GAAGC	2	10	37627	37636	40 %	0 %	40 %	20 %	110347390
37	NC_008244	GCGCA	2	10	39344	39353	20 %	0 %	40 %	40 %	110347391
38	NC_008244	CGGCC	2	10	39914	39923	0 %	0 %	40 %	60 %	110347391
39	NC_008244	TCCAT	2	10	40974	40983	20 %	40 %	0 %	40 %	110347392
40	NC_008244	TTCAT	2	10	41282	41291	20 %	60 %	0 %	20 %	110347392
41	NC_008244	CACGT	2	10	41335	41344	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_008244	TTCCG	2	10	41495	41504	0 %	40 %	20 %	40 %	110347393
43	NC_008244	GCAGG	2	10	41594	41603	20 %	0 %	60 %	20 %	110347393
44	NC_008244	ATCGG	2	10	43462	43471	20 %	20 %	40 %	20 %	110347394
45	NC_008244	TCGAC	2	10	43916	43925	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008244	TAAAC	2	10	45161	45170	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008244	TCGCC	2	10	46611	46620	0 %	20 %	20 %	60 %	110347397
48	NC_008244	GGGAG	2	10	47348	47357	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.