MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chelativorans sp. BNC1 plasmid 3

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008244	TCGC	2	8	478	485	0 %	25 %	25 %	50 %	110347350
2	NC_008244	CGCA	2	8	876	883	25 %	0 %	25 %	50 %	110347350
3	NC_008244	GCTC	2	8	956	963	0 %	25 %	25 %	50 %	110347350
4	NC_008244	TCGA	2	8	1862	1869	25 %	25 %	25 %	25 %	110347351
5	NC_008244	CGGC	2	8	2143	2150	0 %	0 %	50 %	50 %	110347351
6	NC_008244	ATCC	2	8	2471	2478	25 %	25 %	0 %	50 %	110347351
7	NC_008244	AGCG	2	8	3410	3417	25 %	0 %	50 %	25 %	110347351
8	NC_008244	AGCG	2	8	3485	3492	25 %	0 %	50 %	25 %	110347351
9	NC_008244	TGGC	2	8	3650	3657	0 %	25 %	50 %	25 %	110347352
10	NC_008244	ATCC	2	8	4042	4049	25 %	25 %	0 %	50 %	110347353
11	NC_008244	CCGT	2	8	4229	4236	0 %	25 %	25 %	50 %	110347353
12	NC_008244	CGAC	2	8	5673	5680	25 %	0 %	25 %	50 %	110347354
13	NC_008244	GACC	2	8	5806	5813	25 %	0 %	25 %	50 %	110347354
14	NC_008244	TCGA	2	8	6114	6121	25 %	25 %	25 %	25 %	110347355
15	NC_008244	AATG	2	8	6442	6449	50 %	25 %	25 %	0 %	110347355
16	NC_008244	GCCA	2	8	6679	6686	25 %	0 %	25 %	50 %	110347355
17	NC_008244	GATC	2	8	6979	6986	25 %	25 %	25 %	25 %	110347355
18	NC_008244	CGGC	2	8	7071	7078	0 %	0 %	50 %	50 %	110347356
19	NC_008244	CGAG	2	8	7299	7306	25 %	0 %	50 %	25 %	110347356
20	NC_008244	GTCG	2	8	7559	7566	0 %	25 %	50 %	25 %	110347357
21	NC_008244	CGGC	2	8	7673	7680	0 %	0 %	50 %	50 %	110347357
22	NC_008244	CGGC	2	8	7764	7771	0 %	0 %	50 %	50 %	110347357
23	NC_008244	CGAG	2	8	8148	8155	25 %	0 %	50 %	25 %	110347357
24	NC_008244	CGAG	2	8	8181	8188	25 %	0 %	50 %	25 %	110347357
25	NC_008244	GGTC	2	8	8350	8357	0 %	25 %	50 %	25 %	110347357
26	NC_008244	GAAG	2	8	8983	8990	50 %	0 %	50 %	0 %	110347357
27	NC_008244	AAGC	2	8	9044	9051	50 %	0 %	25 %	25 %	110347357
28	NC_008244	ATGG	2	8	9574	9581	25 %	25 %	50 %	0 %	110347358
29	NC_008244	TCGG	2	8	9641	9648	0 %	25 %	50 %	25 %	110347358
30	NC_008244	CGCT	2	8	9656	9663	0 %	25 %	25 %	50 %	110347358
31	NC_008244	CAGC	2	8	10035	10042	25 %	0 %	25 %	50 %	110347358
32	NC_008244	CGCC	2	8	10197	10204	0 %	0 %	25 %	75 %	110347358
33	NC_008244	CGTC	2	8	10287	10294	0 %	25 %	25 %	50 %	110347358
34	NC_008244	CCGA	2	8	10540	10547	25 %	0 %	25 %	50 %	110347358
35	NC_008244	TAGG	2	8	10602	10609	25 %	25 %	50 %	0 %	110347358
36	NC_008244	TCGA	2	8	11770	11777	25 %	25 %	25 %	25 %	110347359
37	NC_008244	GTGC	2	8	12110	12117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008244	GGCC	2	8	12713	12720	0 %	0 %	50 %	50 %	110347360
39	NC_008244	GGCC	2	8	12765	12772	0 %	0 %	50 %	50 %	110347360
40	NC_008244	CACG	2	8	13047	13054	25 %	0 %	25 %	50 %	110347361
41	NC_008244	GAGG	2	8	14022	14029	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008244	AGCG	2	8	14849	14856	25 %	0 %	50 %	25 %	110347363
43	NC_008244	AACA	2	8	15887	15894	75 %	0 %	0 %	25 %	110347365
44	NC_008244	GAAG	2	8	15913	15920	50 %	0 %	50 %	0 %	110347365
45	NC_008244	TGCG	2	8	16398	16405	0 %	25 %	50 %	25 %	110347365
46	NC_008244	TCGC	2	8	16794	16801	0 %	25 %	25 %	50 %	110347366
47	NC_008244	ACGC	2	8	16952	16959	25 %	0 %	25 %	50 %	110347367
48	NC_008244	TGGC	2	8	17083	17090	0 %	25 %	50 %	25 %	110347367
49	NC_008244	ATGG	2	8	17206	17213	25 %	25 %	50 %	0 %	110347367
50	NC_008244	TCGT	2	8	17483	17490	0 %	50 %	25 %	25 %	110347368
51	NC_008244	AAGG	2	8	17494	17501	50 %	0 %	50 %	0 %	110347368
52	NC_008244	CTCG	2	8	17655	17662	0 %	25 %	25 %	50 %	110347368
53	NC_008244	GGCA	2	8	18277	18284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008244	TGAA	2	8	18770	18777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008244	AAGG	2	8	18830	18837	50 %	0 %	50 %	0 %	110347369
56	NC_008244	GGAA	2	8	19017	19024	50 %	0 %	50 %	0 %	110347369
57	NC_008244	CGCC	2	8	19064	19071	0 %	0 %	25 %	75 %	110347369
58	NC_008244	CGAG	2	8	19679	19686	25 %	0 %	50 %	25 %	110347369
59	NC_008244	CGAA	2	8	20487	20494	50 %	0 %	25 %	25 %	110347370
60	NC_008244	GATC	2	8	20538	20545	25 %	25 %	25 %	25 %	110347370
61	NC_008244	GTTG	2	8	20680	20687	0 %	50 %	50 %	0 %	110347370
62	NC_008244	ACAT	2	8	20937	20944	50 %	25 %	0 %	25 %	110347370
63	NC_008244	TTGA	2	8	21709	21716	25 %	50 %	25 %	0 %	110347371
64	NC_008244	TGCC	2	8	22176	22183	0 %	25 %	25 %	50 %	110347371
65	NC_008244	CGGC	2	8	22253	22260	0 %	0 %	50 %	50 %	110347371
66	NC_008244	TCGG	2	8	22306	22313	0 %	25 %	50 %	25 %	110347371
67	NC_008244	GCCG	2	8	22404	22411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008244	GAGG	2	8	22657	22664	25 %	0 %	75 %	0 %	110347372
69	NC_008244	GCGA	2	8	23090	23097	25 %	0 %	50 %	25 %	110347373
70	NC_008244	GATG	2	8	23366	23373	25 %	25 %	50 %	0 %	110347373
71	NC_008244	GCGA	2	8	23547	23554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008244	CCAC	2	8	23858	23865	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_008244	GGCT	2	8	23900	23907	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008244	ACCA	2	8	24194	24201	50 %	0 %	0 %	50 %	110347374
75	NC_008244	GCCG	2	8	24506	24513	0 %	0 %	50 %	50 %	110347374
76	NC_008244	TCGG	2	8	24525	24532	0 %	25 %	50 %	25 %	110347374
77	NC_008244	GGCC	2	8	24766	24773	0 %	0 %	50 %	50 %	110347374
78	NC_008244	GATG	2	8	25071	25078	25 %	25 %	50 %	0 %	110347374
79	NC_008244	ACGC	2	8	25289	25296	25 %	0 %	25 %	50 %	110347375
80	NC_008244	CGCC	2	8	25354	25361	0 %	0 %	25 %	75 %	110347375
81	NC_008244	CCGG	2	8	25371	25378	0 %	0 %	50 %	50 %	110347375
82	NC_008244	CGGC	2	8	25857	25864	0 %	0 %	50 %	50 %	110347376
83	NC_008244	GCAG	2	8	25940	25947	25 %	0 %	50 %	25 %	110347376
84	NC_008244	GCCG	2	8	25990	25997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008244	CGAC	2	8	26167	26174	25 %	0 %	25 %	50 %	110347377
86	NC_008244	GCCT	2	8	26307	26314	0 %	25 %	25 %	50 %	110347377
87	NC_008244	ACCG	2	8	26704	26711	25 %	0 %	25 %	50 %	110347378
88	NC_008244	CGGC	2	8	27121	27128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008244	CCGG	2	8	27775	27782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008244	CCGG	2	8	28127	28134	0 %	0 %	50 %	50 %	110347380
91	NC_008244	CGAT	2	8	28776	28783	25 %	25 %	25 %	25 %	110347380
92	NC_008244	CGCC	2	8	28855	28862	0 %	0 %	25 %	75 %	110347380
93	NC_008244	CGTC	2	8	29145	29152	0 %	25 %	25 %	50 %	110347380
94	NC_008244	GGCA	2	8	29160	29167	25 %	0 %	50 %	25 %	110347380
95	NC_008244	GGCT	2	8	29834	29841	0 %	25 %	50 %	25 %	110347380
96	NC_008244	CCGC	2	8	30154	30161	0 %	0 %	25 %	75 %	110347381
97	NC_008244	CGGC	2	8	30207	30214	0 %	0 %	50 %	50 %	110347381
98	NC_008244	CGCC	2	8	30257	30264	0 %	0 %	25 %	75 %	110347381
99	NC_008244	CGGC	2	8	30370	30377	0 %	0 %	50 %	50 %	110347381
100	NC_008244	GTCG	2	8	30988	30995	0 %	25 %	50 %	25 %	110347382
101	NC_008244	CAGT	2	8	31425	31432	25 %	25 %	25 %	25 %	110347383
102	NC_008244	GACC	3	12	31917	31928	25 %	0 %	25 %	50 %	110347384
103	NC_008244	ATCC	2	8	31939	31946	25 %	25 %	0 %	50 %	110347385
104	NC_008244	CGCA	2	8	32323	32330	25 %	0 %	25 %	50 %	110347385
105	NC_008244	TGCC	2	8	32761	32768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008244	GCCG	2	8	32861	32868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008244	CGGC	2	8	33237	33244	0 %	0 %	50 %	50 %	110347386
108	NC_008244	CGCC	2	8	33804	33811	0 %	0 %	25 %	75 %	110347387
109	NC_008244	CCCA	2	8	33892	33899	25 %	0 %	0 %	75 %	110347387
110	NC_008244	GATG	2	8	33987	33994	25 %	25 %	50 %	0 %	110347387
111	NC_008244	TCCG	2	8	34184	34191	0 %	25 %	25 %	50 %	110347387
112	NC_008244	CGGC	2	8	34220	34227	0 %	0 %	50 %	50 %	110347387
113	NC_008244	CATC	2	8	34858	34865	25 %	25 %	0 %	50 %	110347387
114	NC_008244	GCCG	2	8	35568	35575	0 %	0 %	50 %	50 %	110347388
115	NC_008244	GGCA	2	8	36132	36139	25 %	0 %	50 %	25 %	110347388
116	NC_008244	GGGA	2	8	36158	36165	25 %	0 %	75 %	0 %	110347388
117	NC_008244	TCGC	2	8	36823	36830	0 %	25 %	25 %	50 %	110347389
118	NC_008244	GAGC	2	8	37210	37217	25 %	0 %	50 %	25 %	110347390
119	NC_008244	CAGG	2	8	37608	37615	25 %	0 %	50 %	25 %	110347390
120	NC_008244	GCTC	2	8	37908	37915	0 %	25 %	25 %	50 %	110347390
121	NC_008244	GTTT	2	8	38462	38469	0 %	75 %	25 %	0 %	110347390
122	NC_008244	AGAT	2	8	38800	38807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008244	GCCG	2	8	38872	38879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008244	GGCC	2	8	39038	39045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008244	GCAG	2	8	39514	39521	25 %	0 %	50 %	25 %	110347391
126	NC_008244	CCAT	2	8	41099	41106	25 %	25 %	0 %	50 %	110347392
127	NC_008244	TTGT	2	8	41528	41535	0 %	75 %	25 %	0 %	110347393
128	NC_008244	GAAG	2	8	42175	42182	50 %	0 %	50 %	0 %	110347393
129	NC_008244	TCCG	2	8	42290	42297	0 %	25 %	25 %	50 %	110347393
130	NC_008244	CGGC	2	8	42355	42362	0 %	0 %	50 %	50 %	110347393
131	NC_008244	ACCG	2	8	43285	43292	25 %	0 %	25 %	50 %	110347394
132	NC_008244	GCAG	2	8	43343	43350	25 %	0 %	50 %	25 %	110347394
133	NC_008244	ATAG	2	8	43672	43679	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008244	GATG	2	8	43742	43749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008244	AAGT	2	8	44019	44026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008244	CATA	2	8	44653	44660	50 %	25 %	0 %	25 %	110347395
137	NC_008244	AGGA	2	8	45119	45126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008244	GGCT	2	8	45244	45251	0 %	25 %	50 %	25 %	110347396
139	NC_008244	GGCT	2	8	45301	45308	0 %	25 %	50 %	25 %	110347396
140	NC_008244	CTGC	2	8	45745	45752	0 %	25 %	25 %	50 %	110347396
141	NC_008244	CGAC	2	8	45770	45777	25 %	0 %	25 %	50 %	110347396
142	NC_008244	ACCT	2	8	45979	45986	25 %	25 %	0 %	50 %	110347396
143	NC_008244	CGTT	2	8	46065	46072	0 %	50 %	25 %	25 %	110347397
144	NC_008244	CCTT	2	8	46164	46171	0 %	50 %	0 %	50 %	110347397
145	NC_008244	GGCC	2	8	46177	46184	0 %	0 %	50 %	50 %	110347397
146	NC_008244	GGCC	2	8	46589	46596	0 %	0 %	50 %	50 %	110347397
147	NC_008244	CCAC	2	8	46749	46756	25 %	0 %	0 %	75 %	110347397
148	NC_008244	CATC	2	8	47167	47174	25 %	25 %	0 %	50 %	110347398

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.