MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mesorhizobium sp. BNC1 plasmid 2

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008243	TCGCGC	2	12	2524	2535	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	110347237
2	NC_008243	CGCCGG	2	12	2966	2977	0 %	0 %	50 %	50 %	110347237
3	NC_008243	TCGGCA	2	12	9981	9992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110347244
4	NC_008243	GGCATC	2	12	10244	10255	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110347244
5	NC_008243	GGAATT	2	12	11974	11985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110347244
6	NC_008243	AGGCCA	2	12	16558	16569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347248
7	NC_008243	ACATCC	2	12	17972	17983	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	110347249
8	NC_008243	GGCCAT	2	12	19435	19446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110347250
9	NC_008243	GCGGCC	2	12	20096	20107	0 %	0 %	50 %	50 %	110347251
10	NC_008243	CACGCA	2	12	25555	25566	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	110347255
11	NC_008243	CCAGCC	2	12	27886	27897	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	110347259
12	NC_008243	TGGGAA	2	12	28149	28160	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	110347259
13	NC_008243	CGAAGA	2	12	35299	35310	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	110347266
14	NC_008243	GGGCGT	2	12	36971	36982	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	110347268
15	NC_008243	CAGTCA	2	12	41983	41994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110347274
16	NC_008243	GCGGCT	2	12	46497	46508	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110347277
17	NC_008243	GCGGTC	2	12	48939	48950	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110347280
18	NC_008243	CCTCGG	2	12	50560	50571	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	110347281
19	NC_008243	CAGCGG	2	12	52321	52332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	110347283
20	NC_008243	GGCGCT	2	12	52347	52358	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110347283
21	NC_008243	CCCGAG	2	12	58376	58387	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110347288
22	NC_008243	CAGCCG	2	12	59098	59109	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110347289
23	NC_008243	CGCGGC	2	12	60705	60716	0 %	0 %	50 %	50 %	110347290
24	NC_008243	GGCCGA	2	12	61260	61271	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	110347290
25	NC_008243	CTGATC	2	12	69050	69061	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110347296
26	NC_008243	TCATGC	2	12	71985	71996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110347298
27	NC_008243	GTCCGC	2	12	77328	77339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	110347304
28	NC_008243	CATCGG	2	12	78111	78122	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110347306
29	NC_008243	AGATCG	2	12	79339	79350	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	110347307
30	NC_008243	GACATG	2	12	83337	83348	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	110347311
31	NC_008243	GGAAAA	2	12	85140	85151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347313
32	NC_008243	CGAGGA	2	12	85521	85532	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	110347313
33	NC_008243	GGCTTC	2	12	90496	90507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347318
34	NC_008243	CGCTGA	2	12	90719	90730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110347318
35	NC_008243	CCGGCA	2	12	92039	92050	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110347320
36	NC_008243	TCCGGT	2	12	95772	95783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347324
37	NC_008243	CTGTCG	2	12	95928	95939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347324
38	NC_008243	TGCCGA	2	12	97877	97888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110347326
39	NC_008243	TGGCGA	2	12	99532	99543	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	110347327
40	NC_008243	TCCGAC	2	12	99900	99911	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	110347327
41	NC_008243	CGTACC	2	12	101722	101733	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	110347328
42	NC_008243	CGAAAT	2	12	103173	103184	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	110347329
43	NC_008243	CTGCGA	2	12	107048	107059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008243	TCGATC	2	12	108271	108282	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110347333
45	NC_008243	TCGATC	2	12	108325	108336	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110347333
46	NC_008243	CGGCCG	2	12	114375	114386	0 %	0 %	50 %	50 %	110347339
47	NC_008243	GGTGCT	2	12	115743	115754	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	110347340
48	NC_008243	AAGCAG	2	12	122220	122231	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	110347344
49	NC_008243	CCGACC	2	12	122377	122388	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008243	GTGAAT	2	12	123304	123315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008243	GCGGCT	2	12	123505	123516	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008243	TCGATT	2	12	125388	125399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	110347346
53	NC_008243	AGCGAC	2	12	125511	125522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347346
54	NC_008243	CCCAGC	2	12	125916	125927	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	110347346
55	NC_008243	CTCGGC	2	12	125942	125953	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	110347346

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.