MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium sp. BNC1 plasmid 2

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008243	CGTTC	2	10	1285	1294	0 %	40 %	20 %	40 %	110347236
2	NC_008243	GGAGG	2	10	1651	1660	20 %	0 %	80 %	0 %	110347236
3	NC_008243	CGGCG	2	10	2017	2026	0 %	0 %	60 %	40 %	110347236
4	NC_008243	ACGCC	2	10	3055	3064	20 %	0 %	20 %	60 %	110347237
5	NC_008243	ATCGG	2	10	3124	3133	20 %	20 %	40 %	20 %	110347237
6	NC_008243	CGATC	2	10	3772	3781	20 %	20 %	20 %	40 %	110347238
7	NC_008243	TACCG	2	10	3971	3980	20 %	20 %	20 %	40 %	110347238
8	NC_008243	TCCTG	2	10	5755	5764	0 %	40 %	20 %	40 %	110347239
9	NC_008243	CTGAG	2	10	5855	5864	20 %	20 %	40 %	20 %	110347239
10	NC_008243	AGGTG	2	10	6988	6997	20 %	20 %	60 %	0 %	110347241
11	NC_008243	CTGGA	2	10	9414	9423	20 %	20 %	40 %	20 %	110347243
12	NC_008243	GACCG	2	10	14995	15004	20 %	0 %	40 %	40 %	110347246
13	NC_008243	GTCTG	2	10	16542	16551	0 %	40 %	40 %	20 %	110347248
14	NC_008243	GACAA	2	10	18740	18749	60 %	0 %	20 %	20 %	110347249
15	NC_008243	GCGGT	2	10	21180	21189	0 %	20 %	60 %	20 %	110347251
16	NC_008243	GCCGC	2	10	26515	26524	0 %	0 %	40 %	60 %	110347257
17	NC_008243	GGCAG	2	10	26607	26616	20 %	0 %	60 %	20 %	110347257
18	NC_008243	ATTGG	2	10	27263	27272	20 %	40 %	40 %	0 %	110347258
19	NC_008243	CACCG	2	10	28345	28354	20 %	0 %	20 %	60 %	110347259
20	NC_008243	ATCCG	2	10	29023	29032	20 %	20 %	20 %	40 %	110347259
21	NC_008243	GCGCC	2	10	30266	30275	0 %	0 %	40 %	60 %	110347260
22	NC_008243	TCCAG	2	10	32364	32373	20 %	20 %	20 %	40 %	110347264
23	NC_008243	GGCAT	2	10	33644	33653	20 %	20 %	40 %	20 %	110347265
24	NC_008243	CGGTC	2	10	40332	40341	0 %	20 %	40 %	40 %	110347272
25	NC_008243	CAGAC	2	10	42053	42062	40 %	0 %	20 %	40 %	110347275
26	NC_008243	GGACG	2	10	42640	42649	20 %	0 %	60 %	20 %	110347275
27	NC_008243	CGCGG	2	10	45023	45032	0 %	0 %	60 %	40 %	110347277
28	NC_008243	TCAAC	2	10	46997	47006	40 %	20 %	0 %	40 %	110347277
29	NC_008243	GACGA	2	10	47957	47966	40 %	0 %	40 %	20 %	110347278
30	NC_008243	TATCT	2	10	48628	48637	20 %	60 %	0 %	20 %	110347280
31	NC_008243	GTCCT	2	10	48684	48693	0 %	40 %	20 %	40 %	110347280
32	NC_008243	TGCGC	2	10	48788	48797	0 %	20 %	40 %	40 %	110347280
33	NC_008243	GCAGG	2	10	50080	50089	20 %	0 %	60 %	20 %	110347281
34	NC_008243	GCTGA	2	10	52249	52258	20 %	20 %	40 %	20 %	110347283
35	NC_008243	AGCGC	2	10	52640	52649	20 %	0 %	40 %	40 %	110347283
36	NC_008243	GCGTT	2	10	53520	53529	0 %	40 %	40 %	20 %	110347284
37	NC_008243	GACCG	2	10	54829	54838	20 %	0 %	40 %	40 %	110347285
38	NC_008243	GACAA	2	10	56372	56381	60 %	0 %	20 %	20 %	110347287
39	NC_008243	GCCGG	2	10	57332	57341	0 %	0 %	60 %	40 %	110347287
40	NC_008243	GGCGA	2	10	57968	57977	20 %	0 %	60 %	20 %	110347288
41	NC_008243	GCCTG	2	10	58813	58822	0 %	20 %	40 %	40 %	110347288
42	NC_008243	CCGGC	2	10	59133	59142	0 %	0 %	40 %	60 %	110347289
43	NC_008243	GCGCC	2	10	59491	59500	0 %	0 %	40 %	60 %	110347289
44	NC_008243	GGCAG	2	10	60479	60488	20 %	0 %	60 %	20 %	110347290
45	NC_008243	GGCCG	2	10	64007	64016	0 %	0 %	60 %	40 %	110347292
46	NC_008243	AGCGT	2	10	64649	64658	20 %	20 %	40 %	20 %	110347293
47	NC_008243	CTGTC	2	10	68014	68023	0 %	40 %	20 %	40 %	110347295
48	NC_008243	TGGCA	2	10	70862	70871	20 %	20 %	40 %	20 %	110347297
49	NC_008243	GCTCG	2	10	72860	72869	0 %	20 %	40 %	40 %	110347300
50	NC_008243	TCCCC	2	10	75772	75781	0 %	20 %	0 %	80 %	110347303
51	NC_008243	ACGGT	2	10	78930	78939	20 %	20 %	40 %	20 %	110347307
52	NC_008243	GCTGG	2	10	80794	80803	0 %	20 %	60 %	20 %	110347309
53	NC_008243	TCGAT	2	10	82789	82798	20 %	40 %	20 %	20 %	110347311
54	NC_008243	GGCTG	2	10	85396	85405	0 %	20 %	60 %	20 %	110347313
55	NC_008243	GCCAG	2	10	93489	93498	20 %	0 %	40 %	40 %	110347322
56	NC_008243	TATCG	2	10	93628	93637	20 %	40 %	20 %	20 %	110347322
57	NC_008243	GGCGA	2	10	95533	95542	20 %	0 %	60 %	20 %	110347324
58	NC_008243	TCCGA	2	10	96582	96591	20 %	20 %	20 %	40 %	110347325
59	NC_008243	GAGGT	2	10	102746	102755	20 %	20 %	60 %	0 %	110347329
60	NC_008243	TGCGC	2	10	102765	102774	0 %	20 %	40 %	40 %	110347329
61	NC_008243	GCGAT	2	10	103286	103295	20 %	20 %	40 %	20 %	110347329
62	NC_008243	GGCGA	2	10	104448	104457	20 %	0 %	60 %	20 %	110347330
63	NC_008243	AAGGG	2	10	109363	109372	40 %	0 %	60 %	0 %	110347334
64	NC_008243	GAAAG	2	10	109499	109508	60 %	0 %	40 %	0 %	110347334
65	NC_008243	AGTCC	2	10	109725	109734	20 %	20 %	20 %	40 %	110347334
66	NC_008243	AGGGG	3	15	110568	110582	20 %	0 %	80 %	0 %	110347335
67	NC_008243	AGGGC	2	10	111314	111323	20 %	0 %	60 %	20 %	110347335
68	NC_008243	GCTCC	2	10	112182	112191	0 %	20 %	20 %	60 %	110347336
69	NC_008243	CCGAA	2	10	112409	112418	40 %	0 %	20 %	40 %	110347337
70	NC_008243	AGGGG	2	10	113993	114002	20 %	0 %	80 %	0 %	110347338
71	NC_008243	TGCTG	2	10	114913	114922	0 %	40 %	40 %	20 %	110347339
72	NC_008243	GTCGC	2	10	115217	115226	0 %	20 %	40 %	40 %	110347339
73	NC_008243	GCGCG	2	10	115845	115854	0 %	0 %	60 %	40 %	110347340
74	NC_008243	GGCCA	2	10	117299	117308	20 %	0 %	40 %	40 %	110347341
75	NC_008243	CGGAC	2	10	117575	117584	20 %	0 %	40 %	40 %	110347342
76	NC_008243	CGTCG	2	10	117748	117757	0 %	20 %	40 %	40 %	110347342
77	NC_008243	TCGTG	2	10	119374	119383	0 %	40 %	40 %	20 %	110347343
78	NC_008243	TCCGT	2	10	120916	120925	0 %	40 %	20 %	40 %	110347343
79	NC_008243	CGGTG	2	10	125004	125013	0 %	20 %	60 %	20 %	110347346
80	NC_008243	GCGCC	2	10	126721	126730	0 %	0 %	40 %	60 %	110347346
81	NC_008243	GATCT	2	10	128080	128089	20 %	40 %	20 %	20 %	110347347
82	NC_008243	CCCGC	2	10	128587	128596	0 %	0 %	20 %	80 %	110347347
83	NC_008243	CGATC	2	10	129799	129808	20 %	20 %	20 %	40 %	110347348
84	NC_008243	AGGGC	2	10	129906	129915	20 %	0 %	60 %	20 %	110347348
85	NC_008243	GGCGC	2	10	130069	130078	0 %	0 %	60 %	40 %	110347348

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.